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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5cej | ||||||
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タイトル | The crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (FabG) from Yersinia pestis at 2.50A resolution | ||||||
![]() | 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / FabG / reductase / FASII / Rossmann | ||||||
機能・相同性 | ![]() 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity / fatty acid biosynthetic process / NAD binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Nanson, J.D. / Forwood, J.K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Characterisation of FabG from Yersinia pestis, a Key Component of Bacterial Fatty Acid Synthesis. 著者: Nanson, J.D. / Forwood, J.K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 135.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 108.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25790.633 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q7CJ23, UniProt: A0A5P8YI04*PLUS, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.72 % |
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結晶化 | 温度: 296.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 300 mM ammonium phosphate monobasic, trimethylamine N-oxide dihydrate |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210r / 検出器: CCD / 日付: 2015年5月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.7108 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→31.17 Å / Num. obs: 7814 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 14.6 % / Net I/σ(I): 9.7 |
反射 シェル | 解像度: 2.5→2.6 Å / Mean I/σ(I) obs: 3 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→31.169 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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