登録情報 | データベース: PDB / ID: 5buq |
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タイトル | Unliganded Form of O-succinylbenzoate Coenzyme A Synthetase (MenE) from Bacillus Subtilis, Solved at 1.98 Angstroms |
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要素 | 2-succinylbenzoate--CoA ligase |
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キーワード | LIGASE / apo / ATP / AMP / enzyme mechanism / protein conformation / vitamin K2 / adenylate forming enzyme / domain alteration / open-closed conformational change |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
o-succinylbenzoate-CoA ligase / o-succinylbenzoate-CoA ligase activity / CoA-ligase activity / menaquinone biosynthetic process / ATP binding類似検索 - 分子機能 2-succinylbenzoate--CoA ligase / ANL, C-terminal domain / ANL, N-terminal domain / ANL, N-terminal domain / AMP-binding enzyme, C-terminal domain / AMP-binding enzyme C-terminal domain / AMP-binding, conserved site / Putative AMP-binding domain signature. / GMP Synthetase; Chain A, domain 3 / AMP-dependent synthetase/ligase ...2-succinylbenzoate--CoA ligase / ANL, C-terminal domain / ANL, N-terminal domain / ANL, N-terminal domain / AMP-binding enzyme, C-terminal domain / AMP-binding enzyme C-terminal domain / AMP-binding, conserved site / Putative AMP-binding domain signature. / GMP Synthetase; Chain A, domain 3 / AMP-dependent synthetase/ligase / AMP-binding enzyme, C-terminal domain superfamily / AMP-binding enzyme / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / 2-succinylbenzoate--CoA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Bacillus subtilis (枯草菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.98 Å |
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データ登録者 | Chen, Y. / Sun, Y. / Song, H. / Guo, Z. |
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資金援助 | 香港, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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HKSAR Government | GRF601413 | 香港 |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2015 タイトル: Structural Basis for the ATP-dependent Configuration of Adenylation Active Site in Bacillus subtilis o-Succinylbenzoyl-CoA Synthetase 著者: Chen, Y. / Sun, Y. / Song, H. / Guo, Z. |
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履歴 | 登録 | 2015年6月4日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2015年8月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2015年9月2日 | Group: Data collection |
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改定 1.2 | 2015年10月21日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_oper_list / struct_conn Item: _citation.journal_id_CSD / _database_2.pdbx_DOI ..._citation.journal_id_CSD / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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