PDB-4zws: Crystal Structure of the Bacteriophage T4 recombination mediator ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4zws

タイトル

Crystal Structure of the Bacteriophage T4 recombination mediator protein UvsY, Lattice Type III

要素

Recombination protein uvsY

キーワード

VIRAL PROTEIN / recombination / DNA binding / homo-heptamer / asymmetry / alpha barrel

機能・相同性

Recombination, repair and ssDNA binding protein UvsY / Recombination, repair and ssDNA binding protein UvsY / DNA biosynthetic process / DNA recombination / DNA binding / Recombination protein uvsY

機能・相同性情報

生物種

Enterobacteria phage T4 (ファージ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.6 Å

データ登録者

Gajewski, S. / White, S.W.

資金援助

米国, 3件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	GM066934	米国
National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)	CA21765	米国
American Lebanese-Syrian Associated Charities (ALSAC)		米国

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2016
タイトル: Structure and mechanism of the phage T4 recombination mediator protein UvsY.
著者: Gajewski, S. / Waddell, M.B. / Vaithiyalingam, S. / Nourse, A. / Li, Z. / Woetzel, N. / Alexander, N. / Meiler, J. / White, S.W.

履歴

登録	2015年5月19日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年3月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年3月23日	Group: Database references
改定 1.2	2016年4月20日	Group: Database references
改定 1.3	2017年9月6日	Group: Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.4	2019年12月4日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.5	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4zws.cif.gz	303.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4zws.ent.gz	249.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4zws.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zw/4zws ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zw/4zws	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4zwqC 4zwrSC 4zwtC C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6brp-2 3lww-2 5y3a-d 1lee-3 5sv7-d 2clw-d 6brp-1 2r7o-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Recombination protein uvsY

B: Recombination protein uvsY

C: Recombination protein uvsY

D: Recombination protein uvsY

E: Recombination protein uvsY

F: Recombination protein uvsY

G: Recombination protein uvsY

111 kDa, 7 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	123.571, 123.571, 332.465
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	179
Space group name H-M	P6₅22

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	chain A
2	1	chain B
3	1	chain C
4	1	chain D
5	1	chain E
6	1	chain F
7	1	chain G

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1

Dom-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	MET	MET	GLY	GLY	chain A	A	A	1 - 136	1 - 136
2	MET	MET	GLY	GLY	chain B	B	B	1 - 136	1 - 136
3	MET	MET	ALA	ALA	chain C	C	C	1 - 135	1 - 135
4	ARG	ARG	GLY	GLY	chain D	D	D	2 - 136	2 - 136
5	MET	MET	ALA	ALA	chain E	E	E	1 - 135	1 - 135
6	MET	MET	ALA	ALA	chain F	F	F	1 - 135	1 - 135
7	MET	MET	LYS	LYS	chain G	G	G	1 - 137	1 - 137

#1: タンパク質	Recombination protein uvsY 分子量: 15865.247 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Enterobacteria phage T4 (ファージ) 遺伝子: uvsY / プラスミド: pET21 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P04537

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.3 Å³/Da / 溶媒含有率: 62.72 %
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8 詳細: 1:1 UvsY (10 mg/mL, 150 mM sodium chloride, 20 mM HEPES, pH 7.5, 2 mM DTT) to 10% Jeffamine T-403, 10% Jeffamine ED-2003, 100 mM Tris-HCl, pH 8.0 in the presence of 750 uM dA3 oligonucleotide

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2015年3月1日

放射

モノクロメーター: double crystal Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.6→45.262 Å / Num. obs: 87352 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 4.55 % / B_iso Wilson estimate: 67.95 Å² / R_merge F obs: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.104 / R_rim(I) all: 0.118 / Χ²: 1.045 / Net I/σ(I): 11.26 / Num. measured all: 397409

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	最高解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge F obs	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. possible	Num. unique obs	R_rim(I) all	% possible all
2.6-2.76		3.9	0.284	1.795	0.91	63514	14113	14076	2.035	99.7
2.76-2.95			0.575	1.015	1.68	60477	13294	13293	1.15	100
2.95-3.18			0.836	0.499	3.29	56188	12317	12315	0.565	100
3.18-3.48			0.961	0.236	6.65	51861	11348	11347	0.268	100
3.48-3.89			0.989	0.118	12.52	47179	10308	10308	0.133	100
3.89-4.49			0.996	0.064	21.37	41494	9068	9068	0.072	100
4.49-5.49			0.998	0.05	25.61	35033	7668	7668	0.056	100
5.49-7.71			0.998	0.048	26.62	27022	5959	5958	0.055	100
	7.71		0.999	0.023	46.65	14641	3341	3319	0.026	99.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
Coot		モデル構築
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 4ZWR

4zwr

解像度: 2.6→45.262 Å / SU ML: 0.42 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 25.23 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2363	3698	4.24 %
R_work	0.2023	83612	-
obs	0.2037	87310	99.92 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 152.14 Å² / B_iso mean: 71.1781 Å² / B_iso min: 41.04 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.6→45.262 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5732	0	0	0	5732
残基数	-	-	-	-	732

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	5816
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.973	7801
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.043	868
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	979
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.722	2118

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL
1	2	B	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL
1	3	C	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL
1	4	D	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL
1	5	E	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL
1	6	F	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL
1	7	G	3338	X-RAY DIFFRACTION	9.055	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 26

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.5997-2.6339	0.3806	143	0.3677	3219	3362	98
2.6339-2.67	0.354	136	0.3548	3189	3325	100
2.67-2.7081	0.3571	143	0.3498	3228	3371	100
2.7081-2.7485	0.3979	145	0.3332	3245	3390	100
2.7485-2.7915	0.3371	140	0.3202	3171	3311	100
2.7915-2.8372	0.3002	140	0.3106	3222	3362	100
2.8372-2.8862	0.3161	140	0.2945	3196	3336	100
2.8862-2.9386	0.3176	141	0.2824	3251	3392	100
2.9386-2.9951	0.2956	137	0.2669	3198	3335	100
2.9951-3.0563	0.3008	140	0.274	3237	3377	100
3.0563-3.1227	0.3093	142	0.2642	3175	3317	100
3.1227-3.1953	0.2964	145	0.2674	3262	3407	100
3.1953-3.2752	0.248	143	0.2334	3201	3344	100
3.2752-3.3637	0.3113	142	0.2353	3214	3356	100
3.3637-3.4627	0.2519	144	0.2297	3202	3346	100
3.4627-3.5744	0.2619	144	0.2042	3220	3364	100
3.5744-3.7021	0.2539	144	0.2145	3241	3385	100
3.7021-3.8503	0.2781	142	0.2062	3212	3354	100
3.8503-4.0254	0.2219	144	0.1756	3215	3359	100
4.0254-4.2375	0.1891	142	0.1534	3219	3361	100
4.2375-4.5027	0.1876	142	0.1565	3201	3343	100
4.5027-4.85	0.16	140	0.1434	3224	3364	100
4.85-5.3374	0.2162	140	0.1578	3237	3377	100
5.3374-6.1081	0.2469	147	0.2075	3206	3353	100
6.1081-7.6895	0.1941	149	0.1907	3220	3369	100
7.6895-45.2686	0.1859	143	0.1541	3207	3350	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.152	-0.5112	-2.5944	1.3605	1.5745	5.7871	-0.0602	0.4787	-0.0196	-0.0663	0.0636	-0.2025	-0.2455	0.5037	0.0005	0.3735	0.0049	0.0119	0.8368	-0.0623	0.6746	31.2587	62.2112	1.8009
2	5.216	-2.0498	-2.9958	5.7309	1.832	8.6628	-0.1445	-0.211	0.0429	0.7308	-0.0107	-0.1287	0.6353	0.352	0.0249	0.4319	0.0681	-0.1644	0.5861	-0.0301	0.6153	25.9663	68.6898	36.0637
3	4.2675	2.0782	0.8881	1.9156	2.8311	6.8023	0.1014	-0.0116	0.5439	1.2888	0.2781	-0.9338	0.766	0.6214	-0.2204	0.8797	0.0477	-0.221	1.0187	-0.0882	0.8965	28.7291	74.607	47.3521
4	3.8054	0.7824	-2.638	2.8329	1.0483	8.2862	-0.0741	0.1588	0.1097	0.4244	-0.1295	0.1685	-0.4862	-0.2131	0.319	0.5916	0.1065	-0.0927	0.5504	-0.126	0.6643	18.7879	73.0649	34.7644
5	1.2376	-0.5366	-2.212	3.0714	1.9872	4.203	-0.2634	0.716	-0.0888	-0.1091	0.0378	0.1096	0.3045	-0.0217	0.5206	0.3379	-0.0032	-0.0167	1.0362	-0.1588	0.6551	24.0882	57.6233	-4.4244
6	2.0433	-0.6966	-0.5044	2.6913	1.8931	8.4804	-0.1408	0.6147	0.2727	-0.4388	0.0719	0.0249	-0.6857	0.1372	-0.0787	0.3862	-0.0002	0.0138	0.7645	0.016	0.6232	14.117	68.4235	-3.0287
7	2.2602	-1.4163	-3.177	6.997	0.7438	8.7013	0.2762	-0.2765	-0.3881	0.5551	0.2423	-0.4326	0.1975	-0.3719	0.058	0.4811	0.0863	-0.1334	0.5534	-0.0763	0.7178	12.6302	75.6644	25.5123
8	2.4678	-2.6262	-4.252	9.4154	3.8823	7.3789	-0.503	0.0675	-0.6416	0.55	0.1067	1.3593	-0.2865	-2.0314	0.2243	0.7145	0.2291	0.022	0.7775	-0.0809	0.8426	7.5247	80.4921	36.5609
9	4.2508	-1.8628	3.2422	1.8966	-2.0619	3.2096	-0.4435	-0.4489	2.2473	0.6044	-0.9361	0.8323	-1.2331	-1.2662	0.9324	0.8369	0.2232	0.004	0.698	0.0153	1.108	8.1665	83.0044	32.3261
10	1.5498	-1.9857	-3.1367	5.937	6.1461	9.2144	-0.0699	0.3915	0.0863	-0.11	0.125	0.0153	0.1584	-0.3671	-0.0476	0.4038	-0.0015	-0.0811	0.9144	-0.0647	0.6624	10.3804	61.0206	-2.9897
11	2.2482	0.0794	0.0253	0.9798	0.7834	2.8032	0.5212	1.3273	0.3125	-0.6886	-0.4856	0.311	-0.3899	-1.8349	0.0121	0.5521	0.0634	-0.1341	1.2637	-0.032	0.7364	-9.1947	57.252	-7.0273
12	2.9029	-1.0113	-3.7825	3.747	0.8981	5.5085	-0.3992	1.1391	0.1528	-0.4233	-0.3546	0.422	0.5095	-1.061	0.262	0.3786	0.0944	-0.0706	1.0702	0.0383	0.5555	3.6362	56.4667	-15.0413
13	3.7648	2.904	-0.8544	3.4013	1.5813	5.0585	0.4523	0.1531	1.1211	0.0214	-0.428	0.3587	-0.5489	-0.8267	0.1611	0.3706	0.1114	-0.0285	0.7518	-0.0596	0.7989	-2.8494	69.8378	7.4466
14	4.1247	-0.9054	-3.2995	5.9502	6.4145	8.9586	-0.1645	0.2569	-0.0152	0.6131	-0.4364	0.6939	0.2575	-0.7682	0.1355	0.3874	0.1197	-0.0286	0.8448	-0.0048	0.7191	-6.3174	62.1342	7.7848
15	4.2945	-3.878	-4.3187	8.3607	4.3284	7.3314	-0.2082	0.9211	-0.5242	-0.6328	0.137	-0.0378	0.4921	-0.8249	0.198	0.55	-0.098	-0.0693	1.0559	-0.2883	0.5973	6.4996	43.0196	-13.9334
16	9.2979	-0.656	-3.199	4.5709	1.745	4.8474	-0.1367	0.4475	-0.8502	-0.551	0.4707	-0.3865	0.681	-0.9524	0.2934	0.6377	-0.2645	-0.0664	1.092	-0.1955	0.7075	-16.673	38.2814	3.3459
17	4.5666	-0.0515	-1.9215	1.2029	0.171	2.7708	-0.165	0.6661	-0.1451	-0.1018	-0.1247	0.1167	0.2724	-0.5397	0.137	0.4695	-0.0677	-0.0971	1.0108	-0.1737	0.604	-8.6214	45.6671	-1.9077
18	6.1342	-3.5784	-1.9851	7.3518	-3.5514	4.8583	1.4548	-0.1018	1.7949	0.1536	0.489	-0.4411	0.3307	0.6199	-0.0738	0.3466	-0.2331	0.0539	0.9481	-0.2465	0.7628	-21.9143	60.6893	18.3335
19	7.3295	-3.0966	-5.4957	1.7043	1.9967	4.3224	-0.0912	0.0809	-0.3941	-0.069	0.1069	-0.2474	0.3757	-0.0053	-0.1781	0.4527	-0.062	-0.0857	0.9708	-0.1701	0.6765	-7.4426	43.1739	6.2723
20	2.0228	0.5923	-0.9732	2.0014	-9.8781	9.0545	-1.2655	0.7896	-1.0195	0.1789	-1.2706	0.268	0.6367	-0.6623	-0.8592	1.1015	0.1983	0.0103	1.0103	-0.4816	1.0671	12.4593	29.4083	-11.8492
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22	1.4952	0.1499	-1.12	2.6954	-0.3132	0.9497	-0.0465	0.148	-0.7221	-0.2021	0.1386	-0.0648	0.4671	-0.3189	-0.0884	0.5788	-0.1397	-0.1097	0.8743	-0.2122	0.7479	-6.47	30.3394	8.458
23	0.8393	0.5208	-1.7684	3.1889	0.9803	5.5944	0.6768	-0.2621	0.1951	1.2025	-0.3262	-1.165	-0.9705	0.0343	-0.0088	0.635	0.0112	0.1519	0.767	0.088	0.8176	-24.5558	37.4889	29.2578
24	4.4865	0.0097	-0.9975	3.465	-0.736	6.3664	-0.3514	-0.392	-0.7908	0.4791	0.5024	-0.163	0.4829	-1.3926	-0.0627	0.6946	-0.1647	-0.1026	1.1277	0.1349	0.83	-11.0639	31.8903	22.4316
25	8.9983	-0.1699	-4.0169	1.8382	-1.5122	5.5172	-0.0059	0.8813	-1.773	-0.2666	-0.1011	-0.1657	0.7829	0.2746	0.1688	0.5675	0.0388	0.0186	0.744	-0.2928	0.8898	11.149	31.4106	3.3537
26	4.0185	-0.58	-0.6593	2.0385	-1.2739	4.151	-0.1039	0.0782	-0.4799	-0.2369	0.4413	-0.5564	0.969	0.1286	0.0103	0.7598	0.0695	-0.0697	0.4917	-0.0481	1.1114	13.3581	21.2785	23.9489
27	3.1502	0.9086	-1.771	1.8439	-2.5826	3.7962	0.0831	0.0684	-0.7759	-0.4462	0.2289	-0.066	0.814	0.3042	-0.0607	0.7336	-0.0096	-0.1085	0.4804	-0.1475	0.891	6.4178	24.6337	16.3885
28	3.9815	0.4328	1.1024	3.9712	-0.3221	4.2478	0.0217	-0.871	-0.4279	0.5748	0.339	-0.861	0.3113	0.1273	-0.5175	0.5365	-0.038	-0.0943	0.8013	0.1891	0.6486	-10.4358	25.3767	35.3423
29	9.7	5.1728	-5.6372	6.6788	-5.1716	4.4651	0.4216	-1.0844	-0.2606	0.3827	-0.2144	0.5521	0.5525	0.1117	-0.3975	0.8265	-0.1167	-0.0649	0.8903	0.125	0.9807	2.2236	27.0675	33.6115
30	7.9435	5.0531	-5.8	3.6554	-4.5734	9.5961	-0.1763	0.4481	-1.1206	-0.0398	0.1494	-0.7965	0.4362	0.2909	0.0642	0.5202	0.0875	0.0182	0.616	-0.2518	0.8643	18.7652	34.1165	10.9557
31	3.9341	-0.8327	-0.9668	0.3747	-0.9993	6.7121	0.2726	-0.0474	-0.5757	0.0673	0.0058	-0.3821	0.1724	0.7513	-0.0734	0.6662	0.1903	-0.1343	0.5966	-0.0497	0.9977	23.1477	32.1806	29.0245
32	3.2303	1.5703	-3.1315	4.3255	2.9262	8.8768	0.0344	-1.2393	-0.3735	1.1821	-0.8175	-1.6084	1.3304	-0.6574	-0.0342	0.8486	0.0568	-0.1555	0.8143	0.194	0.8415	8.217	26.337	44.8368
33	0.3451	-0.2757	1.2746	3.0109	1.1457	7.565	-0.4648	-0.6485	-0.6768	0.3614	0.2234	-0.3367	0.9571	-1.4088	0.1133	0.5966	0.0727	-0.0929	0.9671	0.0827	0.584	5.1927	26.3169	53.5907
34	3.6564	1.8411	-2.1945	1.4581	-3.2843	9.875	0.2037	-0.235	-0.308	0.4027	0.3744	-0.1066	-0.5626	-0.2942	-0.3302	0.6305	0.1983	-0.0414	0.5771	-0.0607	0.7584	18.493	38.5927	29.7111
35	1.0288	0.8884	2.6906	9.5462	3.9017	7.3499	-0.9447	-0.3048	-1.4002	-1.0494	0.1062	-0.3843	-0.6457	0.4232	-0.5449	0.4459	0.0626	0.1217	0.7439	-0.1377	0.6772	28.3206	47.1973	6.1337

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 1:49)	A	1 - 49
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 50:65)	A	50 - 65
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 66:73)	A	66 - 73
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 74:100)	A	74 - 100
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 101:136)	A	101 - 136
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain B and resid 1:49)	B	1 - 49
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain B and resid 50:57)	B	50 - 57
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain B and resid 58:66)	B	58 - 66
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain B and resid 67:94)	B	67 - 94
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain B and resid 95:136)	B	95 - 136
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain C and resid 1:19)	C	1 - 19
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain C and resid 20:30)	C	20 - 30
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain C and resid 31:57)	C	31 - 57
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain C and resid 58:119)	C	58 - 119
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain C and resid 120:135)	C	120 - 135
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain D and resid 2:12)	D	2 - 12
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain D and resid 13:47)	D	13 - 47
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain D and resid 48:55)	D	48 - 55
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain D and resid 56:130)	D	56 - 130
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain D and resid 131:136)	D	131 - 136
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain E and resid 1:8)	E	1 - 8
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain E and resid 9:49)	E	9 - 49
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain E and resid 50:96)	E	50 - 96
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain E and resid 97:114)	E	97 - 114
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain E and resid 115:135)	E	115 - 135
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain F and resid 1:19)	F	1 - 19
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain F and resid 20:42)	F	20 - 42
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain F and resid 43:97)	F	43 - 97
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain F and resid 98:114)	F	98 - 114
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain F and resid 115:135)	F	115 - 135
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(chain G and resid 1:42)	G	1 - 42
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(chain G and resid 43:49)	G	43 - 49
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(chain G and resid 50:99)	G	50 - 99
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(chain G and resid 100:130)	G	100 - 130
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(chain G and resid 131:137)	G	131 - 137

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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