登録情報 データベース : PDB / ID : 4whq 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Alkylperoxo reaction intermediate trapped in Protocatechuate 3,4-dioxygenase (pseudomonas putida) at pH 6.5 要素(Protocatechuate 3,4-dioxygenase ...) x 2 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / dioxygen activation / non-heme iron / intradiol dioxygenase / aromatic ring cleavage / catalytic intermediates機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
protocatechuate 3,4-dioxygenase / protocatechuate 3,4-dioxygenase activity / 3,4-dihydroxybenzoate catabolic process / beta-ketoadipate pathway / ferric iron binding 類似検索 - 分子機能 Protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit / Protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit / Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit, N-terminal / Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit N terminal / Protocatechuate 3,4-Dioxygenase, subunit A / Aromatic compound dioxygenase / Intradiol ring-cleavage dioxygenases signature. / : / Intradiol ring-cleavage dioxygenase, C-terminal / Intradiol ring-cleavage dioxygenase, core ... Protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit / Protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit / Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit, N-terminal / Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit N terminal / Protocatechuate 3,4-Dioxygenase, subunit A / Aromatic compound dioxygenase / Intradiol ring-cleavage dioxygenases signature. / : / Intradiol ring-cleavage dioxygenase, C-terminal / Intradiol ring-cleavage dioxygenase, core / Dioxygenase / Sandwich / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 4-fluorobenzene-1,2-diol / Chem-3N9 / BICARBONATE ION / BETA-MERCAPTOETHANOL / : / Protocatechuate 3,4-dioxygenase alpha chain / Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain 類似検索 - 構成要素生物種 Pseudomonas putida (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 解像度 : 1.78 Å 詳細データ登録者 Knoot, C.J. / Purpero, V.M. / Lipscomb, J.D. 資金援助 米国, 2件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) GM24689 米国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) GM08700 米国
引用ジャーナル : Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年 : 2015タイトル : Crystal structures of alkylperoxo and anhydride intermediates in an intradiol ring-cleaving dioxygenase.著者 : Knoot, C.J. / Purpero, V.M. / Lipscomb, J.D. 履歴 登録 2014年9月23日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2014年12月31日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2015年1月14日 Group : Database references改定 1.2 2015年1月28日 Group : Database references改定 1.3 2017年9月27日 Group : Advisory / Author supporting evidence ... Advisory / Author supporting evidence / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description / Source and taxonomy カテゴリ : citation / entity_src_gen ... citation / entity_src_gen / pdbx_audit_support / pdbx_database_status / pdbx_struct_oper_list / pdbx_validate_close_contact / software Item : _citation.journal_id_CSD / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag ... _citation.journal_id_CSD / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_database_status.pdb_format_compatible / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.name 改定 1.4 2019年12月25日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.5 2023年12月27日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / refine_hist / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _refine_hist.number_atoms_total / _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid / _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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