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- PDB-4od4: Apo structure of a UbiA homolog from Aeropyrum pernix K1 -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 4od4
タイトルApo structure of a UbiA homolog from Aeropyrum pernix K1
要素4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
キーワードTRANSFERASE / all alpha helical / intramembrane aromatic prenyltransferase / membrane
機能・相同性
機能・相同性情報


transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups / 転移酵素; メチル基以外のアルキル基またはアリル基を移すもの; - / plasma membrane
類似検索 - 分子機能
UbiA prenyltransferase / UbiA prenyltransferase / 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-related / Prenyltransferase / UbiA prenyltransferase family / UbiA prenyltransferase superfamily / UbiA prenyltransferase family / Tetracycline Repressor; domain 2 / Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) / Up-down Bundle ...UbiA prenyltransferase / UbiA prenyltransferase / 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-related / Prenyltransferase / UbiA prenyltransferase family / UbiA prenyltransferase superfamily / UbiA prenyltransferase family / Tetracycline Repressor; domain 2 / Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) / Up-down Bundle / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha
類似検索 - ドメイン・相同性
4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
類似検索 - 構成要素
生物種Aeropyrum pernix (古細菌)
手法X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 3.301 Å
データ登録者Li, W. / Cheng, W.
引用ジャーナル: Science / : 2014
タイトル: Structural insights into ubiquinone biosynthesis in membranes.
著者: Cheng, W. / Li, W.
履歴
登録2014年1月9日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02014年3月19日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12024年2月28日Group: Data collection / Database references
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ref_seq_dif
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
B: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
C: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
D: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
E: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
F: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)191,0196
ポリマ-191,0196
非ポリマー00
00
1
A: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,8361
ポリマ-31,8361
非ポリマー00
0
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
2
B: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,8361
ポリマ-31,8361
非ポリマー00
0
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
3
C: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,8361
ポリマ-31,8361
非ポリマー00
0
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
4
D: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,8361
ポリマ-31,8361
非ポリマー00
0
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
5
E: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,8361
ポリマ-31,8361
非ポリマー00
0
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
6
F: 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)31,8361
ポリマ-31,8361
非ポリマー00
0
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)70.090, 123.070, 423.480
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number19
Space group name H-MP212121
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID
11
21
31
41
51
61

NCSドメイン領域:
Dom-IDComponent-IDEns-IDSelection details
111chain 'A' and (resseq 3:277 ) and (not element H)
211chain 'B' and (resseq 3:277 ) and (not element H)
311chain 'C' and (resseq 3:277 ) and (not element H)
411chain 'D' and (resseq 3:277 ) and (not element H)
511chain 'E' and (resseq 3:277 ) and (not element H)
611chain 'F' and (resseq 3:277 ) and (not element H)

-
要素

#1: タンパク質
4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase


分子量: 31836.461 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Aeropyrum pernix (古細菌) / : K1 / 遺伝子: ubiA, APE_1570 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): C43
参照: UniProt: Q9YBM8, 転移酵素; メチル基以外のアルキル基またはアリル基を移すもの; -

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実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 4.78 Å3/Da / 溶媒含有率: 74.27 %
結晶化温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5
詳細: 0.1M Na2SO4, 0.1M sodium cacodylate pH 5.0, 26.5% (w/v) PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K

-
データ収集

回折平均測定温度: 77 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 24-ID-C / 波長: 0.9790, 0.97920, 0.96380
検出器タイプ: Pilatus detector / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年10月22日
放射モノクロメーター: Monochromator Si(111) / プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
ID波長 (Å)相対比
10.9791
20.97921
30.96381
反射解像度: 3.3→50 Å / Num. obs: 55984 / % possible obs: 99.4 % / Observed criterion σ(F): 2.1 / Observed criterion σ(I): 2.1 / 冗長度: 6.8 % / Biso Wilson estimate: 108.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.115 / Net I/σ(I): 14.1
反射 シェル解像度: 3.3→3.42 Å / 冗長度: 5.3 % / Rmerge(I) obs: 0.892 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / Num. unique all: 5432 / % possible all: 98.5

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
RAPDデータ収集
SOLVE位相決定
PHENIX(phenix.refine: 1.8.2_1309)精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
精密化構造決定の手法: 多波長異常分散 / 解像度: 3.301→49.783 Å / SU ML: 0.51 / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 30.62 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.3029 2824 5.05 %random
Rwork0.2715 ---
obs0.273 55886 99.15 %-
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 3.301→49.783 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数12036 0 0 0 12036
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.00612300
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.8816854
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d12.1964128
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0322112
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0042076
Refine LS restraints NCS
Ens-IDDom-IDAuth asym-IDRefine-IDタイプRms dev position (Å)
11A2006X-RAY DIFFRACTIONPOSITIONAL
12B2006X-RAY DIFFRACTIONPOSITIONAL0.022
13C2006X-RAY DIFFRACTIONPOSITIONAL0.022
14D2006X-RAY DIFFRACTIONPOSITIONAL0.019
15E2006X-RAY DIFFRACTIONPOSITIONAL0.023
16F2006X-RAY DIFFRACTIONPOSITIONAL0.02
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
3.301-3.35790.38881260.38372451X-RAY DIFFRACTION93
3.3579-3.4190.33751400.33342601X-RAY DIFFRACTION100
3.419-3.48470.31231400.29712660X-RAY DIFFRACTION100
3.4847-3.55580.36011410.29552614X-RAY DIFFRACTION100
3.5558-3.63310.31191320.29882637X-RAY DIFFRACTION100
3.6331-3.71760.32221340.28142677X-RAY DIFFRACTION100
3.7176-3.81060.30341410.26082598X-RAY DIFFRACTION100
3.8106-3.91360.29741590.25972639X-RAY DIFFRACTION100
3.9136-4.02870.31761360.26222610X-RAY DIFFRACTION99
4.0287-4.15860.28881480.25362618X-RAY DIFFRACTION98
4.1586-4.30720.26581410.23272619X-RAY DIFFRACTION100
4.3072-4.47950.28471580.24052645X-RAY DIFFRACTION100
4.4795-4.68330.29331510.25052691X-RAY DIFFRACTION100
4.6833-4.930.31571330.26942649X-RAY DIFFRACTION99
4.93-5.23850.31731470.26212668X-RAY DIFFRACTION100
5.2385-5.64250.28521290.26752650X-RAY DIFFRACTION98
5.6425-6.20940.32451670.28042687X-RAY DIFFRACTION100
6.2094-7.10570.29321240.24562735X-RAY DIFFRACTION100
7.1057-8.94390.21921360.2182744X-RAY DIFFRACTION99
8.9439-49.78860.33031410.32362869X-RAY DIFFRACTION98
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL112)L122)L132)L222)L232)L332)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T112)T122)T132)T222)T232)T332)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
10.04320.15270.02560.55820.04130.0135-0.16750.0721-0.1461-0.2293-0.0076-0.36260.03820.3845-0.51770.05210.04990.16470.63870.09510.162977.834717.676685.7498
20.0475-0.0307-0.01440.01780.00210.03740.03790.0709-0.13840.03840.06420.0259-0.0198-0.00180.34550.04820.23270.05660.66730.05250.26156.998116.720995.5929
30.13310.0021-0.01960.0034-0.01780.0107-0.11010.1416-0.0673-0.018-0.1784-0.0184-0.06440.1086-1.0476-0.20490.08920.04371.17160.16970.414178.05567.620387.9285
40.2298-0.03210.02290.06660.12750.2851-0.071-0.15070.0070.1011-0.07540.07320.0406-0.084-0.01850.45250.26350.02641.38270.08980.750465.5416.1712110.2161
50.0751-0.013-0.00740.01430.0020.0049-0.09050.02390.0412-0.00890.01330.083-0.05060.0702-0.1689-0.21480.0279-0.15160.81670.130.30590.448811.3841101.7775
60.08150.0345-0.03160.0223-0.02140.04270.05990.01370.0298-0.03780.00030.0441-0.0115-0.06040.1983-0.0727-0.29160.09320.8259-0.28090.400384.428620.6743103.7244
70.07150.0423-0.00390.03530.02760.4501-0.1202-0.1054-0.02720.02430.00560.0677-0.0388-0.2385-0.43790.67010.22760.05950.39990.06390.01863.667325.569964.4667
80.0853-0.0201-0.07530.07160.03860.0763-0.0575-0.0871-0.0782-0.26560.019-0.23090.01090.42790.21540.85150.38790.13341.65420.29680.496275.20768.468354.1436
90.1081-0.1181-0.00140.0769-0.03720.0095-0.11640.02380.04530.02640.0217-0.01040.18440.2824-0.83920.13520.4665-0.00170.43520.24330.124156.088519.187155.6307
100.0485-0.07160.09740.1188-0.16290.22260.014-0.0070.08390.01860.02970.0099-0.23570.0241-0.03251.11770.47690.10571.0172-0.03880.486450.808840.211954.4526
110.50330.1645-0.04450.6817-0.10440.0198-0.037-0.35320.15230.43710.042-0.1356-0.19980.00030.15620.38640.1408-0.04320.221-0.05420.377962.818633.506846.816
120.1846-0.08080.13190.1689-0.3180.59270.09530.0967-0.253-0.1745-0.00990.03780.3426-0.02370.0630.64260.1544-0.12790.09880.105-0.084450.248141.851515.8121
130.01110.02610.02510.08040.06030.0448-0.0041-0.1150.11630.51380.11240.1154-0.4283-0.22260.07670.83650.35010.0170.35530.07140.208545.569151.883515.046
140.0066-0.02180.01450.0333-0.01120.03960.03410.04560.0172-0.011-0.03710.0168-0.0650.01470.03711.3040.0897-0.1539-0.0632-0.01520.000540.793165.742125.9601
150.1956-0.11850.22870.1099-0.15670.2757-0.1385-0.3055-0.0394-0.00450.31980.2636-0.4042-0.34150.15951.23870.6929-0.02220.44590.4010.448838.507143.238817.3988
160.038-0.0342-0.00240.0789-0.02230.0193-0.0014-0.1812-0.0449-0.00750.10970.0585-0.0873-0.21260.05191.35490.49880.06471.04310.23690.534333.121653.883440.0531
170.2652-0.01660.14110.0102-0.02690.08360.17760.0325-0.2294-0.03550.21760.30860.0127-0.09921.41470.85830.30410.02490.4050.15970.500446.647634.424234.1857
180.10270.0464-0.00810.0605-0.00550.0116-0.0451-0.15610.17140.19160.16410.3827-0.2284-0.1505-0.0230.80850.2302-0.00310.3942-0.01260.539955.149140.893627.8977
190.75160.04640.05370.26930.00990.0124-0.07180.215-0.0686-0.2522-0.0249-0.3669-0.17770.3135-0.28580.26170.18830.12520.9314-0.02680.438136.146783.92375.3436
200.0219-0.01150.0020.2266-0.05640.08070.2180.3416-0.1348-0.3572-0.29630.05360.12280.0676-0.08340.38550.4079-0.01281.3132-0.02240.576822.969478.977176.4248
210.8513-0.02980.08370.54960.02420.02420.11550.3926-0.1155-0.3089-0.0735-0.3737-0.00590.45090.61390.17310.39440.13341.10210.16350.488837.843472.63879.8835
220.3392-0.164-0.15020.11980.130.1848-0.0524-0.0229-0.1170.0153-0.05480.0610.05020.0051-0.15950.31390.26940.12150.73440.20920.609923.697468.723597.6184
230.4704-0.20590.04940.2260.00780.01420.0311-0.29230.2882-0.02640.1298-0.2052-0.05540.24120.41360.02110.02380.07811.4043-0.0390.730244.841881.264292.6368
240.01530.08350.01680.59290.12560.0289-0.1389-0.29490.0141-0.0277-0.03060.3423-0.0397-0.2499-0.36240.52910.4506-0.04230.49760.05120.186518.748496.377653.2675
250.00590.00330.00070.0349-0.02340.0134-0.00670.04620.002-0.1705-0.0585-0.02610.10290.0849-0.22490.75560.522-0.0680.4216-0.10750.139925.065287.278453.8555
260.30260.25880.11830.30890.17520.1143-0.13860.23820.0535-0.39420.1908-0.01340.10090.1620.24331.67310.86160.37051.78110.53030.763435.738577.165742.9979
270.3354-0.2440.30530.8073-0.42330.53610.28610.1571-0.2885-0.55620.0428-0.05850.36680.00890.56160.84250.411-0.26130.29750.21430.280514.580384.079353.3966
280.28350.00890.21540.148-0.10790.2330.20980.3441-0.0433-0.5218-0.05860.36180.44460.29980.27771.70490.6487-0.13090.7280.00830.72414.171890.858235.6265
290.0707-0.0688-0.02370.10470.06920.062-0.0593-0.103-0.2037-0.31950.0177-0.12620.16170.0173-0.08940.97050.54090.26680.3164-0.16050.297420.3699100.643136.1908
300.42280.28720.06650.60080.36790.302-0.06250.3884-0.2855-0.08430.2044-0.15780.22390.07110.23441.09230.30870.22460.677-0.27480.103317.7429115.89775.9799
310.1130.2083-0.13940.3829-0.2570.17470.02440.1160.05180.03470.1310.0822-0.24020.21260.10860.77830.072-0.03040.7098-0.04110.187811.0774124.74685.2616
320.17130.04050.07240.03840.04140.0562-0.0099-0.38530.2988-0.0619-0.05940.1071-0.37690.01420.15331.117-0.1193-0.19970.60110.020.49583.3057137.089816.2738
330.0537-0.06410.0170.0883-0.02020.00790.07150.0324-0.0136-0.2442-0.03320.01340.08890.03250.07861.5473-0.1615-0.11950.3084-0.03820.42366.8195118.9069-3.5104
340.0661-0.08070.07440.4574-0.31210.21770.07480.1464-0.0909-0.30690.1970.18550.2289-0.0820.48060.8358-0.0924-0.18890.09260.14060.3382.347117.893312.3754
350.1633-0.04240.01050.0188-0.00790.0008-0.08390.154-0.251-0.2680.0564-0.00930.1731-0.00310.01121.38370.27660.14170.4614-0.04690.40899.0614108.86589.261
360.08820.05360.11040.04940.04270.1980.0903-0.1953-0.10830.02510.02380.0561-0.0644-0.21550.08720.67370.1498-0.05990.4270.15780.3708-1.9487123.621630.0284
370.4903-0.32740.1450.74040.03630.29040.24660.4415-0.0629-0.24880.1458-0.01850.30710.36911.78941.16940.91910.00470.55190.07960.484317.7365110.178422.2223
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 3 through 53 )
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 54 through 85 )
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 86 through 178 )
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 179 through 198 )
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 199 through 238 )
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 239 through 277 )
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 3 through 53 )
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 54 through 85 )
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 86 through 218 )
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 219 through 238 )
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 239 through 277 )
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'C' and (resid 3 through 28 )
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'C' and (resid 29 through 53 )
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resid 54 through 85 )
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resid 86 through 178 )
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 179 through 198 )
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 199 through 253 )
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 254 through 277 )
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'D' and (resid 3 through 53 )
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'D' and (resid 54 through 108 )
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'D' and (resid 109 through 178 )
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'D' and (resid 179 through 198 )
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'D' and (resid 199 through 277 )
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'E' and (resid 3 through 28 )
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'E' and (resid 29 through 53 )
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'E' and (resid 54 through 85 )
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'E' and (resid 86 through 158 )
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'E' and (resid 159 through 238 )
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'E' and (resid 239 through 277 )
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'F' and (resid 3 through 28 )
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'F' and (resid 29 through 53 )
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'F' and (resid 54 through 85 )
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'F' and (resid 86 through 108 )
34X-RAY DIFFRACTION34chain 'F' and (resid 109 through 144 )
35X-RAY DIFFRACTION35chain 'F' and (resid 145 through 178 )
36X-RAY DIFFRACTION36chain 'F' and (resid 179 through 198 )
37X-RAY DIFFRACTION37chain 'F' and (resid 199 through 277 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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