登録情報 データベース : PDB / ID : 4mdz 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of a HD-GYP domain (a cyclic-di-GMP phosphodiesterase) containing a tri-nuclear metal centre 要素Metal dependent phosphohydrolase 詳細 キーワード HYDROLASE / Structural Genomics / Oxford Protein Production Facility / OPPF / phosphohydrolase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
hydrolase activity / nucleotide binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 : / HD domain / HD-GYP domain / HD-GYP domain profile. / HDIG domain / Hypothetical protein af1432 / Hypothetical protein af1432 / GAF domain / HD domain / GAF domain ... : / HD domain / HD-GYP domain / HD-GYP domain profile. / HDIG domain / Hypothetical protein af1432 / Hypothetical protein af1432 / GAF domain / HD domain / GAF domain / Domain present in phytochromes and cGMP-specific phosphodiesterases. / GAF domain / GAF-like domain superfamily / Metal dependent phosphohydrolases with conserved 'HD' motif. / HD/PDEase domain / Beta-Lactamase / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-C2E / : / SUCCINIC ACID / Metal dependent phosphohydrolase 類似検索 - 構成要素生物種 Persephonella marina (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.68 Å 詳細データ登録者 Bellini, D. / Walsh, M.A. / Oxford Protein Production Facility (OPPF) 引用ジャーナル : Mol.Microbiol. / 年 : 2014タイトル : Crystal structure of an HD-GYP domain cyclic-di-GMP phosphodiesterase reveals an enzyme with a novel trinuclear catalytic iron centre.著者 : Bellini, D. / Caly, D.L. / McCarthy, Y. / Bumann, M. / An, S.Q. / Dow, J.M. / Ryan, R.P. / Walsh, M.A. 履歴 登録 2013年8月23日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2014年2月19日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2021年8月11日 Group : Database references / Derived calculations / Structure summaryカテゴリ : chem_comp / database_2 ... chem_comp / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct.title / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.2 2023年9月20日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
すべて表示 表示を減らす