PDB-4lmx: Light harvesting complex PE555 from the cryptophyte Hemiselmis an...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4lmx

タイトル

Light harvesting complex PE555 from the cryptophyte Hemiselmis andersenii CCMP644

要素

(cryptophyte phycoerythrin (alpha- ...) x 3
cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

キーワード

PHOTOSYNTHESIS / thylakoid lumen

機能・相同性

機能・相同性情報

phycobilisome / chloroplast thylakoid membrane / photosynthesis
類似検索 - 分子機能

生物種

Hemiselmis andersenii (真核生物)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Harrop, S.J. / Wilk, K.E. / Curmi, P.M.G.

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2014
タイトル: Single-residue insertion switches the quaternary structure and exciton states of cryptophyte light-harvesting proteins.
著者: Harrop, S.J. / Wilk, K.E. / Dinshaw, R. / Collini, E. / Mirkovic, T. / Teng, C.Y. / Oblinsky, D.G. / Green, B.R. / Hoef-Emden, K. / Hiller, R.G. / Scholes, G.D. / Curmi, P.M.

履歴

登録	2013年7月11日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2014年6月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2014年7月16日	Group: Database references
改定 1.2	2023年9月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / software / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _software.name / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.3	2024年11月27日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4lmx.cif.gz	618.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4lmx.ent.gz	518.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4lmx.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4lmx_validation.pdf.gz	7.5 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4lmx_full_validation.pdf.gz	7.6 MB	表示
XML形式データ	4lmx_validation.xml.gz	90.1 KB	表示
CIF形式データ	4lmx_validation.cif.gz	124.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lm/4lmx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lm/4lmx	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4lm6C 4lmsC 1qgwS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	2dbu-2 4a5q-2 4ott-d 4hva-d 2dbx-2 4a5q-1 3lfl-2 2xh9-2 6unl-d 3wd6-6 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#137 - 2011年5月シトクロムbc1 (Cytochrome bc1) 類似性 (1)

登録構造単位

A: cryptophyte phycoerythrin (alpha-2 chain)

B: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

C: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1 chain)

D: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

E: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

F: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

G: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

H: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

I: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

J: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

K: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

L: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

ヘテロ分子

166 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: cryptophyte phycoerythrin (alpha-2 chain)

B: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

C: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1 chain)

D: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
55.2 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

E: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

F: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

G: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

H: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
55.7 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

I: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

J: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

K: cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain)

L: cryptophyte phycoerythrin (beta chain)

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
55.7 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	66.073, 76.741, 142.593
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 92.86, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

-
Cryptophyte phycoerythrin (alpha- ... , 3種, 6分子 ACEGIK

#1: タンパク質	cryptophyte phycoerythrin (alpha-2 chain) 分子量: 6628.628 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Hemiselmis andersenii (真核生物) / 株: CCMP644 / 参照: UniProt: U5TBJ3*PLUS
#3: タンパク質	cryptophyte phycoerythrin (alpha-1 chain) 分子量: 7019.024 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Hemiselmis andersenii (真核生物) / 株: CCMP644 / 参照: UniProt: U5TBU5*PLUS
#4: タンパク質	cryptophyte phycoerythrin (alpha-1/alpha-2 chain) 分子量: 7072.145 Da / 分子数: 4 / Fragment: SEE REMARK 999 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Hemiselmis andersenii (真核生物) / 株: CCMP644 / 参照: UniProt: U5TBJ3*PLUS

-
タンパク質 , 1種, 6分子 BDFHJL

#2: タンパク質	cryptophyte phycoerythrin (beta chain) 分子量: 18406.949 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Hemiselmis andersenii (真核生物) / 株: CCMP644 / 参照: UniProt: U5T8W0*PLUS

-
非ポリマー , 3種, 2219分子

#5: 化合物	ChemComp-PEB / PHYCOERYTHROBILIN 分子量: 588.694 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₃H₄₀N₄O₆
#6: 化合物	ChemComp-DBV / 15,16-DIHYDROBILIVERDIN 分子量: 584.662 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₃H₃₆N₄O₆
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 2195 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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詳細

Has protein modification	Y
配列の詳細	THERE ARE THREE ALPHA1:BETA:ALPHA2:BETA COMPLEXES IN THE ASYMMETRIC UNIT. COMPLEXES 2 AND 3 HAVE ...THERE ARE THREE ALPHA1:BETA:ALPHA2:BETA COMPLEXES IN THE ASYMMETRIC UNIT. COMPLEXES 2 AND 3 HAVE ALPHA CHAINS MODELED AS A 50:50 MIXTURE OF ALPHA1 AND ALPHA2 CHAINS.

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.37 Å³/Da / 溶媒含有率: 48.09 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 25% PEG10000, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K

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データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-D / 波長: 0.97934 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年6月12日
放射	モノクロメーター: Double crystal cryo-cooled Si(111) プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97934 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.8→142.416 Å / Num. all: 131955 / Num. obs: 131573 / % possible obs: 99.6 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.6 % / B_iso Wilson estimate: 15.2 Å² / R_merge(I) obs: 0.079 / R_sym value: 0.079 / Net I/σ(I): 11
反射シェル	解像度: 1.8→1.9 Å / 冗長度: 2.6 % / R_merge(I) obs: 0.488 / Mean I/σ(I) obs: 2.9 / Num. unique all: 18707 / R_sym value: 0.488 / % possible all: 97.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
Blu-Ice	ICE	データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.7.2_867)	精密化
XDS		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1QGW

1qgw

解像度: 1.8→18.636 Å / SU ML: 0.41 / Isotropic thermal model: ISOTROPIC / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.35 / σ(I): 0 / 位相誤差: 21.09 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2139	6623	5.04 %	RANDOM
R_work	0.1581	-	-	-
obs	0.1609	131521	99.78 %	-
all	-	131521	-	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.73 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 49.108 Å² / k_sol: 0.348 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso mean: 15.2 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.8222 Å²	0 Å²	-2.931 Å²
2-	-	4.9496 Å²	0 Å²
3-	-	-	-5.7718 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.8→18.636 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10710	0	1032	2195	13937

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	12043
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.076	16316
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.195	4303
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.067	1718
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	2061

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.8-1.8204	0.3021	242	0.2343	4110	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8204-1.8418	0.309	197	0.2248	4213	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8418-1.8643	0.2595	206	0.213	4119	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8643-1.8879	0.2764	230	0.2139	4155	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8879-1.9127	0.2813	242	0.1926	4143	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9127-1.9388	0.2217	205	0.1755	4140	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9388-1.9665	0.2633	232	0.1724	4138	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9665-1.9958	0.2493	216	0.173	4185	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9958-2.027	0.2373	192	0.1734	4184	X-RAY DIFFRACTION	100
2.027-2.0602	0.2357	216	0.1733	4139	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0602-2.0957	0.2368	232	0.1688	4120	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0957-2.1337	0.2257	221	0.1571	4206	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1337-2.1747	0.2212	224	0.1564	4103	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1747-2.219	0.2269	221	0.1565	4181	X-RAY DIFFRACTION	100
2.219-2.2672	0.2238	237	0.1549	4136	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2672-2.3198	0.2151	234	0.1509	4155	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3198-2.3777	0.2017	224	0.1494	4136	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3777-2.4419	0.2198	207	0.1518	4183	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4419-2.5136	0.2419	217	0.1609	4156	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5136-2.5945	0.2329	233	0.163	4168	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5945-2.687	0.1898	205	0.1498	4185	X-RAY DIFFRACTION	100
2.687-2.7942	0.2143	223	0.1487	4150	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7942-2.9209	0.2215	221	0.1563	4181	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9209-3.0743	0.205	215	0.155	4178	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0743-3.2659	0.2092	221	0.1524	4190	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2659-3.5165	0.2099	237	0.1488	4153	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5165-3.8676	0.1794	213	0.1441	4220	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8676-4.4207	0.179	214	0.1361	4193	X-RAY DIFFRACTION	99
4.4207-5.5451	0.1759	211	0.1423	4216	X-RAY DIFFRACTION	99
5.5451-18.6367	0.1888	235	0.1665	4162	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.0769	0.0652	3.091	0.9396	0.2754	3.7711	-0.0348	-0.1851	0.1295	0.0824	-0.0241	-0.0117	-0.2425	0.0898	0.0846	0.1122	-0.0564	0.0184	0.083	0.001	0.0805	40.8285	-0.551	6.6668
2	4.2241	0.5067	-1.1617	6.1573	0.3574	0.6956	0.0882	0.203	0.5388	0.1561	-0.0189	0.1409	-0.4173	-0.1257	-0.1281	0.3049	0.0335	-0.0365	0.1075	0.0578	0.2063	31.7051	6.3238	-5.1731
3	0.2369	0.3134	-0.5137	0.4117	-0.6796	1.111	0.0825	-0.0579	0.1287	0.1647	-0.0404	0.1629	-0.4297	0.1639	0.0277	0.1959	-0.0529	0.0035	0.0508	-0.0079	0.1263	40.4226	0.5702	11.5717
4	6.2114	3.6505	0.7422	6.924	0.4972	0.1228	-0.172	-0.0162	-0.0618	-0.2495	0.1844	0.0214	-0.0721	0.0362	-0.0201	0.0772	-0.014	0.0431	0.0947	-0.0285	0.0849	33.5104	-13.1267	26.9891
5	6.744	0.1557	0.8786	7.1075	-0.3638	4.785	0.1383	0.4975	-0.6281	-0.0083	0.1196	0.0834	0.8461	0.0645	-0.2124	0.1548	0.0429	0.0363	0.1289	-0.007	0.174	33.5015	-23.7144	22.0405
6	0.3804	-0.0575	0.2466	0.1885	0.7856	3.9244	-0.1503	0.3998	0.2565	-0.5571	0.2912	-0.0156	-0.191	0.0585	-0.1201	0.3899	-0.207	-0.0217	0.2633	0.0579	0.2125	50.4716	5.3094	1.8791
7	5.9114	0.8754	2.5885	0.513	1.2157	2.9418	0.0532	-0.5829	0.6893	0.4847	0.1792	-0.3451	-0.446	0.3886	-0.098	0.4313	-0.1197	-0.1035	0.2211	-0.0495	0.3042	43.2236	9.0897	4.4359
8	4.7564	-1.533	0.1778	6.4924	-2.177	4.5567	0.0573	0.5165	0.5542	-0.4791	0.0908	-0.4397	-0.0627	0.3328	-0.0949	0.1295	-0.0516	0.0393	0.2023	0.0075	0.1818	46.6454	-2.5947	-8.8782
9	0.6824	0.1856	-0.6502	0.9804	-2.6339	7.6887	0.0035	0.0328	-0.007	0.003	0.1008	0.065	0.0828	-0.1324	-0.1212	0.0904	-0.0092	0.0145	0.0442	-0.0224	0.1216	40.0311	-13.6851	10.247
10	1.3833	0.2301	-0.78	1.038	-0.2612	2.6054	0.049	-0.0698	0.025	0.0444	0.1162	-0.0606	0.0682	0.2142	-0.0589	0.0241	-0.0025	0.0166	0.06	-0.0168	0.0715	45.1312	-10.144	21.9889
11	0.7544	0.003	-0.3737	0.3723	-1.0125	4.4981	-0.0639	0.1289	0.0094	0.0026	-0.0266	-0.1759	-0.2154	0.8359	0.0981	0.1099	-0.0529	0.0048	0.2872	-0.0153	0.1449	56.5216	-6.5396	17.5251
12	3.0543	-0.3278	3.1647	0.7952	-0.6783	6.4026	0.0039	0.0575	-0.1565	-0.126	0.0308	0.0117	0.2594	-0.0238	-0.0485	0.1202	0.0188	0.0291	0.0803	-0.0378	0.1328	40.9481	-19.5423	7.652
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56	0.2202	-0.2185	0.1036	0.2615	0.1178	1.1567	0.0245	0.0653	0.1153	-0.0673	-0.0757	-0.1343	-0.3182	0.042	0.0981	0.1572	-0.0019	0.0233	0.0326	-0.0229	0.2189	45.1204	-39.9146	36.2493
57	5.9863	-1.6485	0.6166	2.6645	0.7053	1.8116	0.0061	0.1065	0.0122	0.3662	0.0912	-0.1285	0.3051	0.0187	-0.0732	0.1231	0.003	0.0278	0.1143	-0.0192	0.0619	52.4337	-55.5151	19.937
58	7.3848	-0.222	5.7083	2.5543	1.8724	6.3349	-0.4734	-0.0974	0.8488	0.0445	-0.0428	0.6063	-0.9612	-0.636	0.3253	0.2519	0.0608	-0.035	0.193	-0.0648	0.4091	38.215	-34.3558	45.006
59	0.3953	1.4105	0.4404	5.2538	1.0332	2.0101	0.0731	-0.3306	0.451	0.2245	0.0239	0.0216	-0.1888	-0.0543	0.033	0.18	-0.0094	0.0767	0.174	-0.1178	0.2588	39.3411	-46.5313	57.2689
60	0.4287	-0.369	-0.7065	0.8504	0.2171	4.1441	0.025	-0.0048	0.0937	-0.0081	-0.0025	-0.0579	0.2179	0.0665	-0.0252	0.1184	-0.0161	0.0123	0.0249	-0.006	0.1328	46.0415	-54.1446	36.2387
61	1.2144	-0.0675	-0.8825	1.5496	0.5206	3.9141	0.0806	0.1969	0.1583	-0.1237	0.0314	0.0717	0.0234	-0.1574	-0.0704	0.0557	-0.0146	0.0019	0.0507	0.0272	0.1157	40.7732	-49.2977	25.3751
62	2.0035	0.8028	1.1052	1.8182	2.1346	4.0247	-0.0153	-0.0543	0.2109	0.0063	-0.022	0.2455	0.0325	-0.7002	0.0827	0.0881	-0.0185	-0.0002	0.1685	0.028	0.1551	29.3637	-46.9048	29.777
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64	2.0379	0.5374	0.3483	1.8192	0.1419	0.7823	0.0228	-0.0179	-0.1619	0.0771	0.1432	0.0593	0.3056	-0.1419	-0.1186	0.2071	-0.0872	0.0395	0.0732	0.0251	0.103	36.734	-58.1483	41.4076
65	2.7282	0.0342	2.4885	0.4356	0.3481	2.7293	0.2049	-0.2459	0.053	0.2029	-0.1434	-0.1303	-0.2157	0.2445	0.0458	0.1991	-0.1394	0.0073	0.2511	0.0207	0.1385	63.5204	-35.9297	25.2827
66	4.1794	0.7467	-0.3908	4.147	-0.5805	2.0279	-0.0229	0.0369	0.6627	-0.1613	-0.0467	0.0064	-0.6755	-0.015	0.0571	0.2976	0.0281	0.0106	0.0896	0.0082	0.2788	53.0008	-30.1748	14.1736
67	0.0205	-0.1687	0.309	1.5023	-2.7543	5.0632	0.0962	-0.0681	-0.0203	0.3435	-0.0299	0.1036	-0.7849	0.2671	-0.0569	0.2177	-0.0922	0.0397	0.2101	-0.0061	0.1695	62.7709	-35.9818	30.5709
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70	4.7182	0.8748	2.9534	1.2505	-0.177	3.7009	-0.0099	-0.9692	0.8557	0.8186	0.0604	-0.3024	-0.4971	0.4142	-0.0391	0.5698	-0.067	-0.0714	0.3701	-0.1432	0.2973	63.8018	-26.1369	24.8029
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73	1.0251	0.2361	-0.722	0.5673	0.2613	1.9495	0.024	-0.0586	0.0338	0.0499	0.068	-0.121	0.126	0.5607	0.0516	0.0412	-0.0218	0.0067	0.3022	-0.0253	0.1087	70.4795	-46.0494	39.1909
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75	3.3837	-1.2161	0.4423	0.9618	-0.1547	1.4935	0.0138	-0.0649	0.1655	0.0136	0.0076	-0.1796	-0.139	0.3072	0.0696	0.1197	-0.145	0.005	0.5708	-0.0228	0.1535	80.8691	-42.085	44.0072
76	2.8669	0.7146	2.869	1.1116	0.5215	2.9148	0.0388	-0.1616	-0.1616	-0.0728	-0.0964	-0.1189	0.1136	0.2766	-0.0063	0.1248	0.0845	0.0189	0.3941	-0.0023	0.1414	73.6635	-52.7856	29.8946
77	3.8146	1.7099	-4.3419	5.3014	-4.252	7.9518	-0.1297	0.3344	-0.2724	-0.3604	0.1612	-0.2003	0.633	0.1645	-0.014	0.1844	0.0464	-0.0164	0.3023	-0.0541	0.1479	63.7063	-55.8729	17.2146
78	0.6682	0.0204	-0.4544	0.2888	0.1216	0.9811	0.039	-0.172	0.0231	0.0689	-0.0187	-0.0634	0.0051	0.2674	0.008	0.0546	0.0161	0.0554	0.6026	-0.0576	0.147	79.5539	-47.0576	24.836

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resseq 1:20)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resseq 21:33)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resseq 34:46)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resseq 47:56)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resseq 57:62)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resseq 2:10)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resseq 11:20)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resseq 21:33)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resseq 34:62)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resseq 63:99)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resseq 100:123)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resseq 124:158)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resseq 159:177)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resseq 1:20)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resseq 21:33)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resseq 34:46)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resseq 47:56)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resseq 57:66)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resseq 3:10)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resseq 11:20)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resseq 21:33)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resseq 34:62)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resseq 63:99)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resseq 100:123)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resseq 124:158)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resseq 159:177)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resseq 1:20)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resseq 21:33)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resseq 34:46)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resseq 47:60)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resseq 2:9)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resseq 10:20)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resseq 21:33)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resseq 34:62)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resseq 63:75)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resseq 76:99)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resseq 100:112)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resseq 113:123)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resseq 124:142)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'F' and (resseq 143:152)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'F' and (resseq 153:177)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'G' and (resseq 1:15)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'G' and (resseq 16:33)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'G' and (resseq 34:64)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resseq 2:10)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resseq 11:20)
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'H' and (resseq 21:33)
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'H' and (resseq 34:62)
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'H' and (resseq 63:99)
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'H' and (resseq 100:112)
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'H' and (resseq 113:123)
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'H' and (resseq 124:158)
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'H' and (resseq 159:177)
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'I' and (resseq 1:20)
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'I' and (resseq 21:33)
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'I' and (resseq 34:46)
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'I' and (resseq 47:60)
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'J' and (resseq 3:20)
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'J' and (resseq 21:33)
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'J' and (resseq 34:62)
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'J' and (resseq 63:99)
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'J' and (resseq 100:123)
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'J' and (resseq 124:152)
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resseq 153:177)
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'K' and (resseq 1:20)
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'K' and (resseq 21:33)
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'K' and (resseq 34:46)
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'K' and (resseq 47:60)
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70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'L' and (resseq 11:20)
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75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'L' and (resseq 113:123)
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'L' and (resseq 124:142)
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'L' and (resseq 143:158)
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'L' and (resseq 159:177)

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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Cryptophyte phycoerythrin (alpha- ... , 3種, 6分子 ACEGIK

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タンパク質 , 1種, 6分子 BDFHJL

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非ポリマー , 3種, 2219分子

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)