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- PDB-4kjy: Complex of high-affinity SIRP alpha variant FD6 with CD47 -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 4kjy
タイトルComplex of high-affinity SIRP alpha variant FD6 with CD47
要素
  • High-affinity SIRPa variant FD6
  • Leukocyte surface antigen CD47
キーワードIMMUNE SYSTEM / Immunoglobulin fold / Immune regulation / N-linked glycosylation / Plasma membrane
機能・相同性
機能・相同性情報


cellular response to interleukin-12 / regulation of Fc receptor mediated stimulatory signaling pathway / protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion / positive regulation of monocyte extravasation / regulation of type II interferon production / ATP export / positive regulation of cell-cell adhesion / regulation of interleukin-10 production / cell-cell adhesion mediator activity / regulation of tumor necrosis factor production ...cellular response to interleukin-12 / regulation of Fc receptor mediated stimulatory signaling pathway / protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion / positive regulation of monocyte extravasation / regulation of type II interferon production / ATP export / positive regulation of cell-cell adhesion / regulation of interleukin-10 production / cell-cell adhesion mediator activity / regulation of tumor necrosis factor production / regulation of interleukin-12 production / regulation of nitric oxide biosynthetic process / negative regulation of phagocytosis / regulation of interleukin-6 production / Signal regulatory protein family interactions / thrombospondin receptor activity / tertiary granule membrane / cellular response to interleukin-1 / Integrin cell surface interactions / specific granule membrane / positive regulation of phagocytosis / positive regulation of stress fiber assembly / integrin-mediated signaling pathway / Cell surface interactions at the vascular wall / cellular response to type II interferon / positive regulation of inflammatory response / cell migration / positive regulation of T cell activation / angiogenesis / inflammatory response / apoptotic process / positive regulation of cell population proliferation / Neutrophil degranulation / cell surface / extracellular exosome / plasma membrane
類似検索 - 分子機能
Leukocyte surface antigen CD47 / CD47-like, transmembrane / CD47 immunoglobulin-like / Leukocyte surface antigen CD47, IgV / CD47 transmembrane region / CD47 immunoglobulin-like domain / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulins ...Leukocyte surface antigen CD47 / CD47-like, transmembrane / CD47 immunoglobulin-like / Leukocyte surface antigen CD47, IgV / CD47 transmembrane region / CD47 immunoglobulin-like domain / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Leukocyte surface antigen CD47
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.93 Å
データ登録者Ring, A.M. / Ozkan, E. / Ho, C.C.M. / Garcia, K.C.
引用ジャーナル: Science / 年: 2013
タイトル: Engineered SIRP alpha variants as immunotherapeutic adjuvants to anticancer antibodies.
著者: Weiskopf, K. / Ring, A.M. / Ho, C.C. / Volkmer, J.P. / Levin, A.M. / Volkmer, A.K. / Ozkan, E. / Fernhoff, N.B. / van de Rijn, M. / Weissman, I.L. / Garcia, K.C.
履歴
登録2013年5月4日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02013年6月12日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12013年8月28日Group: Database references
改定 2.02019年12月25日Group: Database references / Derived calculations / Polymer sequence
カテゴリ: entity_poly / pdbx_struct_mod_residue ...entity_poly / pdbx_struct_mod_residue / struct_conn / struct_ref_seq_dif
Item: _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 2.12020年7月29日Group: Data collection / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen
Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id
解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Leukocyte surface antigen CD47
B: High-affinity SIRPa variant FD6
C: Leukocyte surface antigen CD47
D: High-affinity SIRPa variant FD6
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)59,59415
ポリマ－57,5374
非ポリマー2,05811
水6,810378
1
A: Leukocyte surface antigen CD47
B: High-affinity SIRPa variant FD6
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)29,5286
ポリマ－28,7682
非ポリマー7604
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area2550 Å2
ΔGint-8 kcal/mol
Surface area11410 Å2
手法PISA
2
C: Leukocyte surface antigen CD47
D: High-affinity SIRPa variant FD6
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)30,0669
ポリマ－28,7682
非ポリマー1,2987
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area3350 Å2
ΔGint-12 kcal/mol
Surface area11820 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)71.340, 71.340, 399.180
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number179
Space group name H-MP6522
Components on special symmetry positions
IDモデル要素
11B-300-

HOH

21C-308-

HOH

-
要素

#1: 抗体 Leukocyte surface antigen CD47 / Antigenic surface determinant protein OA3 / Integrin-associated protein / IAP / Protein MER6


分子量: 14245.014 Da / 分子数: 2 / 変異: C15G / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CD47, MER6 / プラスミド: pAcGP67a / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: Q08722
#2: 抗体 High-affinity SIRPa variant FD6


分子量: 14523.237 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / プラスミド: pMal-p2x / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)
#3: 化合物 ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO4
#4: 糖
ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン


タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C8H15NO6
識別子タイププログラム
DGlcpNAcbCONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOLGMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamineCOMMON NAMEGMML 1.0
b-D-GlcpNAcIUPAC CARBOHYDRATE SYMBOLPDB-CARE 1.0
GlcNAcSNFG CARBOHYDRATE SYMBOLGMML 1.0
#5: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 378 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O
配列の詳細AUTHORS STATE THAT THIS RESIDUE IS ENCODED AS GLUTAMINE, BUT SPONTANEOUSLY CYCLIZES TO PYROGLUTAMIC ACID.

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.55 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.73 %
結晶化温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.3
詳細: Crystals were obtained by addition of 0.1 microL protein to an equal volume of 2.0 M ammonium sulfate and 0.1 M Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K

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データ収集

回折平均測定温度: 120 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 8.2.1 / 波長: 1 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2011年9月9日
放射モノクロメーター: KOHZU / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 36706 / % possible obs: 83.1 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 8.3 % / Rmerge(I) obs: 0.089 / Net I/σ(I): 21.4
反射 シェル
解像度 (Å)Diffraction-ID% possible all
1.9-1.93130.3
1.93-1.97139.4
1.97-2.01145.2
2.01-2.05151.8
2.05-2.09160.7
2.09-2.14164.7
2.14-2.19175.3
2.19-2.25190
2.25-2.32198.8
2.32-2.391100
2.39-2.481100
2.48-2.581100
2.58-2.71100
2.7-2.841100
2.84-3.021100
3.02-3.251100
3.25-3.581100
3.58-4.091100
4.09-5.16199.2
5.16-50197.3

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
Blu-Iceデータ収集
PHENIXモデル構築
PHENIX(phenix.refine: 1.8.1_1168)精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
PHENIX位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.93→31.291 Å / SU ML: 0.25 / σ(F): 1.32 / 位相誤差: 27.5 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2621 1476 4.02 %
Rwork0.2189 --
obs0.2206 36706 78.03 %
all-49097 -
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 1.93→31.291 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3501 0 127 378 4006
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0063719
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.9475057
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d12.4861336
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.059601
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.004636
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
1.93-1.98950.407790.3467319X-RAY DIFFRACTION8
1.9895-2.06060.291430.2619927X-RAY DIFFRACTION23
2.0606-2.14310.3448680.2621783X-RAY DIFFRACTION44
2.1431-2.24060.32171240.28393167X-RAY DIFFRACTION78
2.2406-2.35870.30561710.26153978X-RAY DIFFRACTION99
2.3587-2.50640.31951700.26824026X-RAY DIFFRACTION100
2.5064-2.69980.30291740.2624080X-RAY DIFFRACTION100
2.6998-2.97130.30321720.25044112X-RAY DIFFRACTION100
2.9713-3.40080.24021770.20724143X-RAY DIFFRACTION100
3.4008-4.28290.23521780.17874204X-RAY DIFFRACTION100
4.2829-31.29470.22371900.18794491X-RAY DIFFRACTION99
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
10.8855-0.5389-0.6765.3073-1.14244.3854-0.34030.72370.5788-0.90090.2774-1.4542-0.52341.51720.06630.8924-0.51420.16031.1132-0.21170.813310.157227.2118-36.352
22.695-0.8988-0.25343.1872-0.97655.2243-0.25820.5361-0.0308-0.60710.1466-0.37430.13930.95360.10770.5409-0.06270.04560.5911-0.19690.32741.591116.5042-30.8862
32.0001-2.0662-6.38278.0513-0.20884.9975-0.4409-0.5373-0.5845-0.07970.2535-0.34120.60031.33690.19140.64170.1780.10180.7157-0.29790.52464.77666.2863-27.2751
45.0474-1.2532-1.17716.0659-1.15861.5452-0.0373-0.11060.2495-0.52360.1534-0.90890.19921.4109-0.12610.5483-0.03630.14740.9618-0.29820.58319.566815.9286-30.6208
52.0001-0.1719-6.85352.0209-1.80327.5874-0.5793-0.761-0.3496-1.0120.0318-1.01390.74981.21360.5491.071-0.26130.39711.5607-0.36360.958216.006718.1325-41.4106
67.1157-0.0494-6.49484.48012.09888.8195-0.0350.68330.3703-0.89370.5114-0.574-0.8450.4909-0.49570.6033-0.15930.07260.4839-0.19940.286-1.274118.4228-34.1025
74.01251.43540.81842.40140.06910.1944-0.29680.7030.2497-0.76270.2812-0.6041-0.46880.6793-0.01180.7887-0.38540.11580.6405-0.17170.41723.034424.3584-39.1927
87.25920.94380.88146.24460.09132.59750.17440.0441-0.8075-0.1330.17560.89530.3979-0.7904-0.36940.4665-0.28740.11210.5425-0.17820.2871-27.252614.0639-34.4543
92.1562-0.60860.93492.41571.43653.70380.04540.2922-0.0279-0.1539-0.03040.0234-0.0178-0.0902-0.0160.45-0.15910.0890.1957-0.08760.1598-16.445315.6405-37.5029
109.14760.09445.25694.5172-0.0827.207-0.16130.26870.3217-0.01490.20960.0124-0.4017-0.2013-0.02710.39-0.00940.07450.2728-0.12920.1978-21.312421.5323-34.5484
116.99521.46793.43976.49722.67996.9970.4296-0.1851-0.5783-0.087-0.05210.33490.5483-0.3196-0.36860.5093-0.34790.06120.2422-0.23210.1763-18.56059.5314-37.6006
125.4311-1.8469-1.31186.35710.82130.68910.08371.0305-0.7348-0.4097-0.01160.45430.3471-0.209-0.0060.6942-0.29510.07260.4758-0.21170.1427-19.49459.4156-38.834
131.99981.735-6.29514.44831.8675.2920.15830.20580.7289-0.61430.0922-0.404-0.4830.1508-0.2750.583-0.177-0.04690.2136-0.0760.412814.620324.469-2.1356
148.28955.0526-4.9864.9562-0.25297.1342-0.85330.003-1.9851-0.89590.2453-2.4890.80661.04680.62850.7277-0.18490.29710.5499-0.05321.315827.871511.8294-6.5919
151.61620.6586-0.1663.05590.84511.1606-0.0254-0.13520.10730.10020.0816-0.2118-0.22590.1806-0.07840.4738-0.0503-0.10950.0835-0.07580.32099.609615.82153.9896
163.2996-0.3851-0.0648.2558-0.19553.463-0.20210.0871-0.0936-0.18680.1213-0.62570.29960.27840.07590.3243-0.030.03650.1224-0.04610.390111.70224.8771-1.8302
172.69031.1266-0.60155.29080.82144.4845-0.2610.2399-0.4034-0.50490.1695-1.12360.23820.50050.03990.4433-0.09640.03720.1399-0.06380.566316.733311.7948-1.9789
185.54411.8395-2.7544.6582-0.53373.7317-0.50270.3977-0.1243-0.79260.2301-0.68890.16950.13520.20320.5756-0.1687-0.06810.1344-0.10080.324113.195618.0203-5.3133
198.506-5.83675.75282.0023-5.99198.6817-0.6123-1.2470.04191.36580.82110.186-1.1203-1.5494-0.20510.58930.09610.01060.5695-0.08190.2444-16.506920.20484.527
200.4895-0.68430.43211.0089-0.89971.9506-0.0152-00.07780.1235-0.07040.0935-0.2274-0.12640.08320.52980.1544-0.08380.2607-0.13860.3331-16.45635.1159-9.5477
210.3973-0.12770.23290.5132-0.33671.6325-0.0336-0.1344-0.02750.1548-0.06590.1113-0.1279-0.15550.06190.42650.1188-0.0926-0.0254-0.34680.1073-8.710719.6364-3.1664
223.9177-5.4811.96072.0029-4.36184.30060.23870.24940.6283-1.2904-0.1932-1.18520.16590.3073-0.04830.53790.0147-0.09570.1724-0.07940.5309-1.021127.0391-7.729
234.0487-3.41621.26044.7782-3.30983.0569-0.1689-0.28260.39150.60190.0967-0.3707-0.65090.13580.05490.62070.0946-0.27260.1965-0.29680.2826-3.635528.02896.1613
244.74880.86466.7422.33012.55042.0001-0.28060.12660.5162-0.4525-0.0222-0.1272-0.93730.11830.30910.54190.0869-0.13130.1651-0.09290.3409-11.588932.4724-13.6367
254.5567-0.41281.69942.03921.7956.18270.1359-0.1743-0.3070.08270.0690.20560.2826-0.0508-0.22430.33320.0697-0.09580.0995-0.24470.1621-11.294618.0067-4.3107
262.7024-1.1631-0.03242.0446-0.28170.5754-0.02780.1907-0.4651-0.0683-0.03650.13950.0796-0.12130.09830.3448-0.0012-0.03970.1197-0.06860.2933-7.747611.6152-2.0106
274.4306-5.43652.84242.0014-5.79238.68960.4320.24680.0552-1.1907-0.09041.00860.3977-0.0972-0.31670.46880.1771-0.02050.2265-0.1050.2967-20.280734.2095-13.8485
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1CHAIN A AND (RESID 2: 21 )
2X-RAY DIFFRACTION2CHAIN A AND (RESID 22: 51 )
3X-RAY DIFFRACTION3CHAIN A AND (RESID 52: 58 )
4X-RAY DIFFRACTION4CHAIN A AND (RESID 59: 79 )
5X-RAY DIFFRACTION5CHAIN A AND (RESID 80: 92 )
6X-RAY DIFFRACTION6CHAIN A AND (RESID 93:102 )
7X-RAY DIFFRACTION7CHAIN A AND (RESID 103:114 )
8X-RAY DIFFRACTION8CHAIN B AND (RESID 1: 23 )
9X-RAY DIFFRACTION9CHAIN B AND (RESID 24: 62 )
10X-RAY DIFFRACTION10CHAIN B AND (RESID 63: 86 )
11X-RAY DIFFRACTION11CHAIN B AND (RESID 87: 95 )
12X-RAY DIFFRACTION12CHAIN B AND (RESID 96:114 )
13X-RAY DIFFRACTION13CHAIN C AND (RESID 2: 8 )
14X-RAY DIFFRACTION14CHAIN C AND (RESID 9: 21 )
15X-RAY DIFFRACTION15CHAIN C AND (RESID 22: 42 )
16X-RAY DIFFRACTION16CHAIN C AND (RESID 43: 69 )
17X-RAY DIFFRACTION17CHAIN C AND (RESID 70:100 )
18X-RAY DIFFRACTION18CHAIN C AND (RESID 101:114 )
19X-RAY DIFFRACTION19CHAIN D AND (RESID 2: 11 )
20X-RAY DIFFRACTION20CHAIN D AND (RESID 12: 23 )
21X-RAY DIFFRACTION21CHAIN D AND (RESID 24: 50 )
22X-RAY DIFFRACTION22CHAIN D AND (RESID 51: 62 )
23X-RAY DIFFRACTION23CHAIN D AND (RESID 63: 75 )
24X-RAY DIFFRACTION24CHAIN D AND (RESID 76: 86 )
25X-RAY DIFFRACTION25CHAIN D AND (RESID 87: 95 )
26X-RAY DIFFRACTION26CHAIN D AND (RESID 96:108 )
27X-RAY DIFFRACTION27CHAIN D AND (RESID 109:117 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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