PDB-4j6i: Discovery of thiazolobenzoxepin PI3-kinase inhibitors that spare ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4j6i

タイトル

Discovery of thiazolobenzoxepin PI3-kinase inhibitors that spare the PI3-kinase beta isoform

要素

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

キーワード

Transferase/Transferase Inhibitor / beta-sparing / SBDD / catalytic subunit gamma / phosphorylation / Transferase-Transferase Inhibitor complex

機能・相同性

機能・相同性情報

secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis ...secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis / negative regulation of fibroblast apoptotic process / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IB / sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IA / dendritic cell chemotaxis / 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase activity / 1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase / phosphatidylinositol 3-kinase / phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process / 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity / mast cell degranulation / Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K) / hepatocyte apoptotic process / positive regulation of Rac protein signal transduction / regulation of cell adhesion mediated by integrin / Synthesis of PIPs at the plasma membrane / phosphatidylinositol-mediated signaling / phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process / regulation of angiogenesis / T cell proliferation / cellular response to cAMP / GPVI-mediated activation cascade / T cell activation / ephrin receptor binding / positive regulation of endothelial cell migration / phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / neutrophil chemotaxis / positive regulation of cytokine production / positive regulation of MAP kinase activity / platelet aggregation / endocytosis / G beta:gamma signalling through PI3Kgamma / Signaling by CSF1 (M-CSF) in myeloid cells / kinase activity / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / angiogenesis / adaptive immune response / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / non-specific serine/threonine protein kinase / protein kinase activity / inflammatory response / phosphorylation / immune response / G protein-coupled receptor signaling pathway / innate immune response / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / ATP binding / identical protein binding / membrane / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. ...PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. / PI3-kinase family, Ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain / PI3-kinase family, ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase C2 / Phosphoinositide 3-kinase, region postulated to contain C2 domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase-type domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K)-type domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain / Phosphatidylinositol kinase / PIK helical domain profile. / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 1. / Phosphatidylinositol 3/4-kinase, conserved site / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 2. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases catalytic domain profile. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / C2 domain superfamily / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / Ubiquitin-like (UB roll) / Alpha Horseshoe / Armadillo-type fold / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Protein kinase-like domain superfamily / Immunoglobulin-like / Sandwich / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.9 Å

データ登録者

Murray, J.M. / Rouge, L. / Wu, P.

引用

ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2013
タイトル: Discovery of thiazolobenzoxepin PI3-kinase inhibitors that spare the PI3-kinase beta isoform.
著者: Staben, S.T. / Ndubaku, C. / Blaquiere, N. / Belvin, M. / Bull, R.J. / Dudley, D. / Edgar, K. / Gray, D. / Heald, R. / Heffron, T.P. / Jones, G.E. / Jones, M. / Kolesnikov, A. / Lee, L. / ...

履歴

登録	2013年2月11日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年8月28日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb4j6i.ent.gz	295.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4j6i.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4j6i_validation.pdf.gz	690.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4j6i_full_validation.pdf.gz	713.7 KB	表示
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CIF形式データ	4j6i_validation.cif.gz	44 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j6/4j6i ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j6/4j6i	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	4anw-d 3t8m-d 1e90-d 4urk-d 1e8y-d 3csf-d 4xz4-d 2chz-d 7jwe-d 1e7v-d 2a5u-d 4gb9-d 4ps8-d 4anx-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (35) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (1) #239 - 2019年11月ホスホリパーゼA2 (Phospholipase A2) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

ヘテロ分子

111 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	143.671, 67.161, 106.655
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 95.430, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

#1: タンパク質	Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform / PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / ...PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / Phosphatidylinositol 4 / 5-bisphosphate 3-kinase 110 kDa catalytic subunit gamma / PtdIns-3-kinase subunit p110-gamma / p110gamma / Phosphoinositide-3-kinase catalytic gamma polypeptide / Serine/threonine protein kinase PIK3CG / p120-PI3K 分子量: 110727.102 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 144-1102 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: p110 gamma, PIK3CG 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 株 (発現宿主): Sf9 参照: UniProt: P48736, phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, non-specific serine/threonine protein kinase
#2: 化合物	ChemComp-1JV / 2-methyl-1-(4-{2-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-4,5-dihydro[1]benzoxepino[5,4-d][1,3]thiazol-8-yl}-1H-pyrazol-1-yl)propan-2-ol 分子量: 490.501 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₂H₂₁F₃N₆O₂S

#1: タンパク質

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform / PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / ...

分子量: 110727.102 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 144-1102 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: p110 gamma, PIK3CG
発現宿主:

Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
株 (発現宿主): Sf9
参照: UniProt: P48736, phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, non-specific serine/threonine protein kinase

#2: 化合物

ChemComp-1JV / 2-methyl-1-(4-{2-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-4,5-dihydro[1]benzoxepino[5,4-d][1,3]thiazol-8-yl}-1H-pyrazol-1-yl)propan-2-ol

分子量: 490.501 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₂H₂₁F₃N₆O₂S

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.31 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.82 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: PEG 3350, 0.2M NH4SO4, 0.1M Tris-HCl 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRL

/ ビームライン: BL7-1 / 波長: 0.97946 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2009年5月20日

放射

モノクロメーター: Side scattering I-beam bent single crystal
プロトコル: SINGLE / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97946 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.87→50 Å / Num. obs: 22879 / % possible obs: 97.5 % / 冗長度: 3.6 % / B_iso Wilson estimate: 83 Å² / R_merge(I) obs: 0.055 / Χ²: 1.034 / Net I/σ(I): 12.5

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
2.87-2.97	2.7	0.446	1890	1.036	1	81.6
2.97-3.09	3.1	0.392	2200	1.083	1	94.4
3.09-3.23	3.5	0.302	2319	1.047	1	99.6
3.23-3.4	3.7	0.198	2332	1.014	1	99.9
3.4-3.62	3.8	0.123	2338	0.995	1	99.9
3.62-3.89	3.8	0.081	2323	1.001	1	99.9
3.89-4.29	3.8	0.055	2341	1.045	1	99.9
4.29-4.91	3.8	0.044	2354	1.04	1	100
4.91-6.18	3.7	0.051	2362	1.03	1	99.8
6.18-50	3.6	0.024	2420	1.063	1	99.7

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX	1.8_1068	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
ADSC	Quantum	データ収集
HKL-3000		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.9→19.85 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU ML: 0.35 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 28.89 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2508	1115	5.01 %
R_work	0.2053	-	-
obs	0.2077	22244	98.26 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 215.37 Å² / B_iso mean: 94.9072 Å² / B_iso min: 34.99 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.9→19.85 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6749	0	34	0	6783

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.013	6966
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.982	9432
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.092	1056
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.012	1195
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.398	2589

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 8

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.9-3.0316	0.3155	104	0.2659	2391	2495	89
3.0316-3.1908	0.3331	154	0.2657	2598	2752	98
3.1908-3.3898	0.3151	117	0.2428	2674	2791	100
3.3898-3.65	0.2743	154	0.2165	2665	2819	100
3.65-4.0146	0.2903	141	0.2083	2666	2807	100
4.0146-4.5892	0.2274	155	0.1865	2679	2834	100
4.5892-5.7585	0.2647	146	0.1977	2696	2842	100
5.7585-19.85	0.1972	144	0.1899	2760	2904	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.0053	-0.1197	-0.305	1.49	-2.0852	2.9741	-0.1957	1.18	-1.4068	-1.1089	-0.3489	0.2781	1.0734	-0.3041	0.3728	0.847	0.0537	-0.1969	1.0842	-0.4776	1.1362	28.6735	28.968	4.5896
2	0.9491	0.3918	-1.1362	0.9623	-0.5905	1.383	-0.548	0.4182	-0.657	-0.5069	-0.2947	-0.3703	0.2397	0.2175	0.2494	0.9704	-0.005	-0.0048	1.2032	-0.4889	0.8582	44.291	34.2925	6.6338
3	1.1328	0.8313	-0.5119	0.8513	-0.6623	0.5746	-0.2856	0.594	-0.8818	0.0708	-0.2865	1.0825	0.5781	0.0327	0.0626	0.7098	0.2617	0.0836	-0.7253	-0.9086	1.211	38.5056	24.974	17.4798
4	2.9037	-0.4993	0.2577	1.2966	-0.3303	3.9477	0.0257	-0.2198	-0.7994	-0.0097	-0.096	0.1412	0.6333	-0.6417	-0.0448	0.561	-0.0933	-0.0922	0.63	0.1452	1.1533	20.0917	31.343	33.3347
5	5.8784	0.9159	0.7662	0.6996	-0.5376	0.8925	0.0149	-0.7808	0.3636	0.6738	-0.0922	-0.1135	-0.3087	-0.2107	0.1626	1.9117	0.2794	0.2227	1.8268	0.0669	1.1844	15.5862	47.9232	49.2835
6	2.8007	-0.3229	1.0795	2.1987	-0.6833	2.5529	-0.0162	-1.4284	0.0447	-0.1305	-0.2052	0.4691	0.2782	-0.995	0.2287	0.5624	-0.0113	0.122	1.6068	0.3733	1.3088	1.9083	35.6993	41.3965
7	3.0943	0.0113	0.4978	0.5841	1.204	2.521	-0.0783	-0.0621	-1.6125	0.0501	-0.5561	0.5772	0.6994	0.0172	0.5763	0.848	-0.1638	0.0863	1.0317	-0.0838	1.3217	4.0013	28.3293	31.3069
8	2.8661	-0.1662	1.1877	2.7218	-1.8836	6.5767	0.8743	-0.2465	-0.5247	0.0095	0.1751	0.001	0.2782	-0.2678	-0.6008	0.882	-0.0879	0.2511	0.742	0.0893	0.8499	12.0764	34.9113	32.601
9	3.7848	-0.6763	0.6032	3.2534	1.7569	3.4772	-0.3517	0.1745	-0.1989	-0.2194	-0.0769	-0.4981	-0.7437	-0.187	0.1733	0.9886	0.0437	0.2819	0.9525	0.0635	0.6717	14.2957	42.0652	39.5503
10	3.4378	0.1327	0.8912	0.0714	-0.0818	0.4202	0.1152	-0.2058	-0.0264	-0.0048	0.0806	0.8627	-1.0234	-0.3198	-0.3305	0.8261	0.2711	0.2449	1.3554	-0.0659	1.3921	6.7862	47.3166	36.9395
11	0.9411	1.2947	0.3472	1.7819	0.4664	0.1522	-0.5403	0.1954	0.2011	-0.2561	-0.0315	0.6124	0.2703	-1.0926	0.4735	0.543	-0.1277	0.0303	1.2322	-0.1336	1.3594	5.8925	30.0636	26.9374
12	2.1155	0.3389	1.3876	3.3789	-1.7891	2.1297	-0.3862	0.4381	-0.4534	-1.6776	0.4694	-0.4181	1.0732	0.4618	-0.0118	1.1619	-0.057	0.0307	0.6425	-0.3976	1.2684	20.3387	22.4967	15.9483
13	1.8743	0.8426	-0.7188	4.4904	-1.5065	4.4071	-0.3496	-0.0288	-0.5581	-0.7479	0.3771	-0.5715	0.8306	0.5491	0.1939	0.6732	0.2087	0.0448	1.2978	-0.0977	0.6212	69.4724	36.6483	12.6487
14	0.061	0.0736	0.0698	0.0993	0.0721	0.0623	-0.2919	-0.3558	1.5131	-0.9536	-0.3671	0.692	-0.2158	-0.0565	0.6241	1.2002	-0.1253	0.08	1.3365	0.2116	1.3535	61.3662	59.2635	2.3007
15	1.8221	0.3614	-0.8572	2.0429	-0.9438	1.9129	0.1573	0.1893	-0.2649	-0.0724	-0.174	-0.1501	-0.1547	0.4842	0.0124	0.4931	-0.0302	-0.0463	0.9311	-0.1549	0.6167	66.8849	43.155	16.217
16	2.5223	0.4258	-1.0451	0.3011	-1.0753	3.7434	-0.3214	0.1189	0.6238	0.0566	-0.3373	-0.3426	-0.8271	0.453	0.4494	0.6005	-0.1425	-0.062	0.8192	-0.0416	0.5933	61.2612	47.985	14.9897
17	4.5586	0.4735	0.0073	0.771	1.2846	2.2323	-0.1723	0.7035	-0.3878	-0.4248	-0.06	0.1782	-0.4716	-0.2279	0.2586	0.7231	0.143	-0.0086	0.6015	-0.0306	0.4106	57.1323	44.0603	14.4501
18	2.292	-1.0483	-0.6019	1.2435	0.0556	0.2215	0.1504	0.1638	-0.0708	0.0158	-0.0406	0.095	0.1473	-0.4014	0.0829	0.8375	0.1583	0	0.519	-0.2445	1.0151	54.6136	25.6652	17.924
19	0.9996	0.849	-0.2997	0.785	-0.6056	2.364	0.073	0.8425	-0.8509	-0.8132	-0.1414	-0.0112	0.6213	0.2829	0.0833	0.659	0.1838	0.04	0.9516	-0.3068	0.5944	59.6459	35.6995	8.662
20	4.7765	1.5534	0.9622	1.8073	3.0955	6.241	0.785	0.12	1.0844	-0.2436	0.0482	0.3136	-0.2426	-0.2242	-0.4405	0.8602	-0.1703	0.2496	0.9328	-0.1117	0.7512	51.1478	53.2264	11.6376
21	5.2574	-0.8396	-2.2201	2.9198	-1.6614	4.2103	-0.4674	-0.0766	0.7048	0.125	-0.5256	-0.0084	-0.9578	0.7791	0.803	0.6899	-0.2027	-0.1837	0.7733	-0.1188	0.6913	50.5099	49.1615	20.8611
22	1.6342	-0.1447	-0.2962	4.9032	0.5103	0.0996	-0.1596	0.5199	-0.257	-0.2083	0.4144	-0.3433	0.4198	0.1858	-0.1136	0.4305	0.2002	0.0354	0.8168	-0.2082	0.4075	50.2593	42.0057	11.6702
23	0.8249	0.8682	-1.1523	0.9353	-1.2426	1.6377	-0.0136	0.3668	0.0349	-0.5998	0.1333	-0.3169	-0.3361	0.2713	-0.1017	0.9407	-0.0948	0.0732	1.6575	0.0047	0.6471	49.3886	46.4954	0.4935
24	4.2138	2.0986	0.3918	4.09	0.9188	5.84	0	0.8752	0.2631	-0.6326	0.4154	0.2313	0.0662	-0.2064	-0.3102	0.6757	-0.1252	0.0803	0.899	0.0224	0.6735	58.8401	45.7809	4.6711
25	0.9681	0.9164	-0.2541	1.0504	-1.0666	4.021	0.3315	-0.0728	-0.2756	0.3036	-0.041	-0.5293	0.6401	0.6338	-0.2909	0.913	0.2992	0.1954	1.1856	-0.1167	0.894	66.8664	32.752	10.4962
26	8.3323	-4.0504	3.9203	3.8255	-3.4359	8.9182	-0.1242	-1.1812	-0.1059	0.9736	0.2195	-0.7733	-0.2088	0.6377	0.2369	0.7584	0.1792	-0.2156	0.9302	0.0318	0.6526	58.657	43.0355	54.8045
27	4.6517	-1.6084	0.1118	2.4658	0.3967	3.1634	-0.7952	0.1569	0.3738	0.1757	0.8361	-0.2981	0.5967	-0.3714	-0.0795	0.6436	-0.0445	-0.0617	1.0755	0.0174	0.6429	58.3512	41.3371	45.2701
28	3.9288	-0.1552	-1.035	2.9799	0.4486	3.3254	-0.2799	-0.2495	-0.481	-0.0497	0.0088	-0.5016	0.5357	0.4347	0.2217	0.4909	0.0132	-0.0779	0.6292	0.0834	0.5815	57.9768	33.7436	38.3253
29	2.1056	-0.1735	-0.5053	0.6534	0.3061	1.4376	0.0772	-0.7237	-0.5396	0.9031	0.1211	0.2991	0.1232	0.0086	-0.188	0.7725	-0.0611	0.0334	0.5494	0.1644	0.6016	46.081	35.9129	39.2907
30	5.9513	1.1483	-0.1429	2.3509	-1.0982	2.6958	0.207	-0.4225	-0.4293	0.5711	0.0976	0.6597	0.2941	-0.2878	-0.3371	0.6502	0.0677	0.0116	0.5384	0.1738	0.6764	41.772	32.3086	35.1306
31	2.989	-0.4588	0.7327	1.9338	-0.37	2.2242	0.1457	0.3358	-0.7241	-0.054	-0.0793	0.1937	0.0872	-0.0595	-0.0615	0.4026	-0.0271	-0.0175	0.3154	-0.1158	0.4708	34.8985	37.3717	22.1667
32	2.8973	-0.3008	-0.0786	7.2106	-1.9476	4.1037	0.0889	1.6109	-0.0747	-0.6678	-0.1276	0.2922	-0.0021	-1.203	-0.113	0.5015	0.149	-0.053	1.0319	-0.0106	0.5598	21.9743	46.7839	8.8733
33	2.8005	0.1374	-0.5546	2.3269	-0.7241	2.7029	0.1669	0.8223	0.1818	-0.4172	-0.1171	0.6454	-0.3529	-0.5914	-0.001	0.7339	0.2361	-0.0964	0.887	0.0624	0.6864	14.4696	53.6091	12.8232
34	3.498	-0.5246	0.6236	2.161	-0.1367	2.3613	-0.1217	-0.2923	0.9563	0.7991	-0.1362	0.5929	-0.5861	-0.4061	0.1217	0.8299	0.085	0.1417	0.4787	-0.1723	0.7953	22.5535	62.6139	32.2646
35	1.2302	-0.6825	1.0338	1.3264	-1.2864	1.7922	-0.1249	-1.0481	1.184	0.2238	-0.3708	-0.2653	-1.2124	-0.3163	0.3176	1.6763	-0.0151	-0.0077	0.787	-0.4677	1.2574	26.6297	74.3318	41.5182
36	1.9201	0.2393	0.2403	1.0335	0.5924	0.4287	-0.1486	-0.7889	0.3962	1.2955	0.111	-0.0847	-0.2475	-0.2708	-0.1905	1.1944	0.1006	-0.0022	0.7619	-0.1791	0.4943	34.5118	56.7256	42.422
37	0.0876	0.0541	0.0231	0.0287	0.013	0.0058	0.1356	0.0192	0.2428	0.5784	-0.0076	-0.4576	-0.0481	0.961	-0.2154	1.4316	-0.4986	0.1338	1.1783	-0.1678	1.0425	48.3261	56.8485	25.5456
38	2.9207	-1.642	-0.5406	3.6855	-0.7145	2.0374	-0.3979	-0.742	1.8009	1.036	-0.1546	-0.2684	-1.1736	0.2559	0.2914	1.2919	-0.0507	-0.182	0.7614	-0.3934	1.1393	38.0197	68.9119	39.4507

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 143:158 )	A	143 - 158
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 159:171 )	A	159 - 171
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 172:188 )	A	172 - 188
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 189:208 )	A	189 - 208
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 209:214 )	A	209 - 214
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 215:250 )	A	215 - 250
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 267:274 )	A	267 - 274
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND RESID 275:286 )	A	275 - 286
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN A AND RESID 287:298 )	A	287 - 298
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN A AND RESID 299:304 )	A	299 - 304
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN A AND RESID 305:312 )	A	305 - 312
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN A AND RESID 313:320 )	A	313 - 320
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN A AND RESID 357:369 )	A	357 - 369
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN A AND RESID 370:381 )	A	370 - 381
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN A AND RESID 382:427 )	A	382 - 427
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN A AND RESID 428:435 )	A	428 - 435
17	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN A AND RESID 460:469 )	A	460 - 469
18	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN A AND RESID 470:474 )	A	470 - 474
19	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN A AND RESID 475:484 )	A	475 - 484
20	X-RAY DIFFRACTION	20	( CHAIN A AND RESID 485:489 )	A	485 - 489
21	X-RAY DIFFRACTION	21	( CHAIN A AND RESID 497:502 )	A	497 - 502
22	X-RAY DIFFRACTION	22	( CHAIN A AND RESID 503:507 )	A	503 - 507
23	X-RAY DIFFRACTION	23	( CHAIN A AND RESID 508:512 )	A	508 - 512
24	X-RAY DIFFRACTION	24	( CHAIN A AND RESID 513:517 )	A	513 - 517
25	X-RAY DIFFRACTION	25	( CHAIN A AND RESID 518:522 )	A	518 - 522
26	X-RAY DIFFRACTION	26	( CHAIN A AND RESID 546:560 )	A	546 - 560
27	X-RAY DIFFRACTION	27	( CHAIN A AND RESID 561:585 )	A	561 - 585
28	X-RAY DIFFRACTION	28	( CHAIN A AND RESID 586:612 )	A	586 - 612
29	X-RAY DIFFRACTION	29	( CHAIN A AND RESID 613:637 )	A	613 - 637
30	X-RAY DIFFRACTION	30	( CHAIN A AND RESID 638:652 )	A	638 - 652
31	X-RAY DIFFRACTION	31	( CHAIN A AND RESID 653:725 )	A	653 - 725
32	X-RAY DIFFRACTION	32	( CHAIN A AND RESID 726:753 )	A	726 - 753
33	X-RAY DIFFRACTION	33	( CHAIN A AND RESID 760:837 )	A	760 - 837
34	X-RAY DIFFRACTION	34	( CHAIN A AND RESID 838:967 )	A	838 - 967
35	X-RAY DIFFRACTION	35	( CHAIN A AND RESID 981:1003 )	A	981 - 1003
36	X-RAY DIFFRACTION	36	( CHAIN A AND RESID 1004:1038 )	A	1004 - 1038
37	X-RAY DIFFRACTION	37	( CHAIN A AND RESID 1039:1045 )	A	1039 - 1045
38	X-RAY DIFFRACTION	38	( CHAIN A AND RESID 1046:1087 )	A	1046 - 1087

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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