登録情報 | データベース: PDB / ID: 4imo |
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タイトル | Crystal structure of wild type human Lipocalin PGDS in complex with substrate analog U44069 |
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要素 | Lipocalin-type prostaglandin-D synthase |
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キーワード | ISOMERASE / Beta barrel / Endoplasmic reticulum |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
prostaglandin-D synthase / prostaglandin-D synthase activity / Transcriptional regulation of testis differentiation / negative regulation of male germ cell proliferation / regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep / Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX) / cyclooxygenase pathway / retinoid binding / prostaglandin biosynthetic process / mast cell degranulation ...prostaglandin-D synthase / prostaglandin-D synthase activity / Transcriptional regulation of testis differentiation / negative regulation of male germ cell proliferation / regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep / Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX) / cyclooxygenase pathway / retinoid binding / prostaglandin biosynthetic process / mast cell degranulation / response to glucocorticoid / rough endoplasmic reticulum / fatty acid binding / gene expression / nuclear membrane / endoplasmic reticulum membrane / perinuclear region of cytoplasm / Golgi apparatus / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region類似検索 - 分子機能 Lipocalin / Lipocalin family conserved site / Calycin beta-barrel core domain / Lipocalin / cytosolic fatty-acid binding protein family / Lipocalin/cytosolic fatty-acid binding domain / Calycin / Lipocalin / Lipocalin signature. / Beta Barrel / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-PWZ / THIOCYANATE ION / Prostaglandin-H2 D-isomerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.88 Å |
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データ登録者 | Lim, S.M. / Chen, D. / Teo, H. / Roos, A. / Nyman, T. / Tresaugues, L. / Pervushin, K. / Nordlund, P. |
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引用 | ジャーナル: J.Lipid Res. / 年: 2013 タイトル: Structural and dynamic insights into substrate binding and catalysis of human lipocalin prostaglandin D synthase. 著者: Lim, S.M. / Chen, D. / Teo, H. / Roos, A. / Jansson, A.E. / Nyman, T. / Tresaugues, L. / Pervushin, K. / Nordlund, P. |
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履歴 | 登録 | 2013年1月3日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年3月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年5月22日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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