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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4hcx | ||||||
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タイトル | Structure of ICDH-1 from M.tuberculosis complexed with NADPH & Mn2+ | ||||||
![]() | Isocitrate dehydrogenase [NADP] | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / ICDH-1 / Rossmann Fold / Dehydrogenase / NADP Binding | ||||||
機能・相同性 | ![]() isocitrate metabolic process / isocitrate dehydrogenase (NADP+) / isocitrate dehydrogenase (NADP+) activity / NADP metabolic process / glyoxylate cycle / tricarboxylic acid cycle / NAD binding / magnesium ion binding / zinc ion binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hazra, S. / Blanchard, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural, Kinetic and Chemical Mechanism of Isocitrate Dehydrogenase-1 from Mycobacterium tuberculosis. 著者: Quartararo, C.E. / Hazra, S. / Hadi, T. / Blanchard, J.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 174.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 138.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 45565.629 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: icd, Rv3339c, MT3442, MTV016.39c / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P65097, UniProt: P9WKL1*PLUS, isocitrate dehydrogenase (NADP+) #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.36 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.85 % |
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 30% PEG2K, 0.1M Tris HCl pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K |
-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() |
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検出器 | タイプ: FUJI / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2012年7月21日 |
放射 | モノクロメーター: Cu / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.18→50 Å / Num. all: 45115 / Num. obs: 42831 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 34.751 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.18→50 Å
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