ジャーナル: Appl.Microbiol.Biotechnol. / 年: 2015 タイトル: Structural insights into the substrate stereospecificity of D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from Delftia sp. HT23: a useful enzyme for the synthesis of optically pure L-threo- ...タイトル: Structural insights into the substrate stereospecificity of D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from Delftia sp. HT23: a useful enzyme for the synthesis of optically pure L-threo- and D-erythro-3-hydroxyaspartate 著者: Matsumoto, Y. / Yasutake, Y. / Takeda, Y. / Tamura, T. / Yokota, A. / Wada, M.
モノクロメーター: Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.98 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.5→50 Å / Num. all: 157557 / Num. obs: 157557 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 14.7 % / Rmerge(I) obs: 0.089 / Net I/σ(I): 33.66
反射 シェル
解像度: 1.5→1.53 Å / 冗長度: 14.6 % / Rmerge(I) obs: 0.765 / Mean I/σ(I) obs: 4.99 / Num. unique all: 7806 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
ADSC
Quantum
データ収集
SHELXCD
位相決定
SHELXE
モデル構築
REFMAC
5.6.0117
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.5→45.63 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.98 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.973 / SU B: 1.585 / SU ML: 0.027 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.05 / ESU R Free: 0.048 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1518
7908
5 %
RANDOM
Rwork
0.1211
-
-
-
obs
0.1227
149594
99.88 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK