登録情報 | データベース: PDB / ID: 3vyr |
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タイトル | Crystal structure of the HypC-HypD complex |
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要素 | - Hydrogenase expression/formation protein HypC
- Hydrogenase expression/formation protein HypD
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キーワード | METAL BINDING PROTEIN / [NiFe] hydrogenase maturation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
carbon dioxide binding / carbon monoxide binding / protein maturation / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / iron ion binding類似検索 - 分子機能 HypD, alpha/beta domain 2 / HypD, alpha/beta domain 1 / Arc Repressor Mutant, subunit A - #100 / Hydrogenase formation HypD protein / HypD, domain 1 / HypD, domain 2 / Hydrogenase formation hypA family / Hydrogenase assembly chaperone, conserved site / Hydrogenases expression/synthesis hupF/hypC family signature. / Hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC ...HypD, alpha/beta domain 2 / HypD, alpha/beta domain 1 / Arc Repressor Mutant, subunit A - #100 / Hydrogenase formation HypD protein / HypD, domain 1 / HypD, domain 2 / Hydrogenase formation hypA family / Hydrogenase assembly chaperone, conserved site / Hydrogenases expression/synthesis hupF/hypC family signature. / Hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC / HupF/HypC family / Arc Repressor Mutant, subunit A / SH3 type barrels. - #140 / Helix non-globular / Special / SH3 type barrels. / Roll / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 CITRIC ACID / IRON/SULFUR CLUSTER / Hydrogenase expression/formation protein HypC / hydrogenase expression/formation protein HypD類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Thermococcus kodakarensis (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.55 Å |
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データ登録者 | Watanabe, S. / Miki, K. |
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引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2012 タイトル: Crystal structures of the HypCD complex and the HypCDE ternary complex: transient intermediate complexes during [NiFe] hydrogenase maturation 著者: Watanabe, S. / Matsumi, R. / Atomi, H. / Imanaka, T. / Miki, K. |
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履歴 | 登録 | 2012年10月2日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2012年11月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年7月31日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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