登録情報 | データベース: PDB / ID: 3vm5 |
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タイトル | Recombinant medaka fish alpha-amylase expressed in yeast Pichia pastoris |
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要素 | alpha-amylase |
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キーワード | HYDROLASE / (alpha/beta)8 barrel fold / starch hydrolysis |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
alpha-amylase activity => GO:0004556 / alpha-amylase / alpha-amylase activity / carbohydrate metabolic process / extracellular region / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Alpha-amylase, C-terminal domain / Aamy_C / Alpha-amylase/branching enzyme, C-terminal all beta / Alpha amylase, C-terminal all-beta domain / Alpha amylase / Alpha amylase, catalytic domain / Glycosyl hydrolase, family 13, catalytic domain / Alpha-amylase domain / Golgi alpha-mannosidase II / Glycosyl hydrolase, all-beta ...Alpha-amylase, C-terminal domain / Aamy_C / Alpha-amylase/branching enzyme, C-terminal all beta / Alpha amylase, C-terminal all-beta domain / Alpha amylase / Alpha amylase, catalytic domain / Glycosyl hydrolase, family 13, catalytic domain / Alpha-amylase domain / Golgi alpha-mannosidase II / Glycosyl hydrolase, all-beta / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_fish.gif) Oryzias latipes (ヒメダカ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.85 Å |
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データ登録者 | Mizutani, K. / Toyoda, M. / Mikami, B. |
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引用 | ジャーナル: Biochim.Biophys.Acta / 年: 2012 タイトル: Structural and functional characterization of recombinant medaka fish alpha-amylase expressed in yeast Pichia pastoris. 著者: Mizutani, K. / Toyoda, M. / Otake, Y. / Yoshioka, S. / Takahashi, N. / Mikami, B. |
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履歴 | 登録 | 2011年12月8日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2012年6月6日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年6月26日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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