登録情報 | データベース: PDB / ID: 3url |
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タイトル | Endothiapepsin-DB6 complex. |
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要素 | - DB6 peptide
- Endothiapepsin
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / hydrolase-hydrolase inhibitor complex / aspartic proteinase mechanism / transition state analogue. |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
endothiapepsin / aspartic-type endopeptidase activity / proteolysis類似検索 - 分子機能 Aspergillopepsin-like catalytic domain / Eukaryotic aspartyl protease / Aspartic peptidase A1 family / Peptidase family A1 domain / Peptidase family A1 domain profile. / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily ...Aspergillopepsin-like catalytic domain / Eukaryotic aspartyl protease / Aspartic peptidase A1 family / Peptidase family A1 domain / Peptidase family A1 domain profile. / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily / Beta Barrel / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Endothia parasitica (菌類) |
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手法 | X線回折 / フーリエ合成 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Bailey, D. / Sanz-Aparicio, J. / Albert, A. / Cooper, J.B. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2012 タイトル: An analysis of subdomain orientation, conformational change and disorder in relation to crystal packing of aspartic proteinases. 著者: Bailey, D. / Carpenter, E.P. / Coker, A. / Coker, S. / Read, J. / Jones, A.T. / Erskine, P. / Aguilar, C.F. / Badasso, M. / Toldo, L. / Rippmann, F. / Sanz-Aparicio, J. / Albert, A. / ...著者: Bailey, D. / Carpenter, E.P. / Coker, A. / Coker, S. / Read, J. / Jones, A.T. / Erskine, P. / Aguilar, C.F. / Badasso, M. / Toldo, L. / Rippmann, F. / Sanz-Aparicio, J. / Albert, A. / Blundell, T.L. / Roberts, N.B. / Wood, S.P. / Cooper, J.B. |
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履歴 | 登録 | 2011年11月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年4月18日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2012年4月25日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2012年5月9日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2012年12月12日 | Group: Other |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_peptide_omega / pdbx_validate_rmsd_angle / software / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _software.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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