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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3tv0 | ||||||
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タイトル | Structure of dynactin p27 subunit | ||||||
![]() | Dynactin subunit 6 | ||||||
![]() | STRUCTURAL PROTEIN / left-handed beta-helix / p25 / p62 / Arp11 / cytosol | ||||||
機能・相同性 | ![]() kinetochore => GO:0000776 / dynactin complex / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport / COPI-mediated anterograde transport / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / MHC class II antigen presentation / antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II / centrosome / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Derewenda, Z.S. / Derewenda, U. / Kowalska, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Dynactin targets Polo-like kinase 1 to kinetochores 著者: Derewenda, Z.S. / Derewenda, U. / Kowalska, A. / Zheng, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 63.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 50.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 433.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 438.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21087.285 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.19 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.79 % |
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 3.6 詳細: 19% PEG 2000, 0.15 M Potassium phosphate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年6月27日 / 詳細: Si(111) |
放射 | モノクロメーター: Si 111 / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.149→43.5 Å / Num. all: 16307 / Num. obs: 16255 / % possible obs: 81.1 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 5 |
反射 シェル | 解像度: 2.149→2.19 Å / % possible all: 38.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.95 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 46.955 Å2 / ksol: 0.385 e/Å3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1492→43.451 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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