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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3ngm | ||||||
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タイトル | Crystal structure of lipase from Gibberella zeae | ||||||
![]() | Extracellular lipase | ||||||
![]() | HYDROLASE / secret lipase / Gibberella zeae | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lou, Z.Y. / Li, M. / Sun, Y.N. / Liu, Y. / Liu, Z. / Rao, Z.H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of a secreted lipase from Gibberella zeae reveals a novel "double-lock" mechanism 著者: Lou, Z.Y. / Li, M. / Sun, Y.N. / Liu, Y. / Liu, Z. / Wu, W.P. / Rao, Z.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 228 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 184.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1einS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 33799.562 Da / 分子数: 4 / 断片: residues 1-319 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: FGL1 / プラスミド: pLIZG7 / 発現宿主: ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.58 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.39 % |
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2008年1月3日 / 詳細: osmic mirror |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→50 Å / Num. all: 35284 / Num. obs: 34080 / % possible obs: 98 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / Rmerge(I) obs: 0.101 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1EIN 解像度: 2.8→50 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→50 Å
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拘束条件 |
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