解像度: 1.8→1.847 Å / 冗長度: 7.8 % / Rmerge(I) obs: 0.442 / Mean I/σ(I) obs: 3.1 / Num. unique all: 566 / % possible all: 77.74
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
SBC-Collect
データ収集
HKL-3000
位相決定
REFMAC
5.5.0102
精密化
HKL-3000
データ削減
HKL-3000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.8→51.64 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.963 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.937 / SU B: 8.51 / SU ML: 0.117 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.268 / ESU R Free: 0.139 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.24337
367
4.7 %
RANDOM
Rwork
0.18073
-
-
-
obs
0.18383
7457
96.45 %
-
all
-
7735
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 11.429 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
0.76 Å2
0 Å2
0 Å2
2-
-
0.76 Å2
0 Å2
3-
-
-
-1.52 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.8→51.64 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
645
0
0
45
690
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.022
0.022
677
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_other_d
0.002
0.02
473
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.901
1.965
915
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_other_deg
1.098
3
1140
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
7.076
5
82
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
30.687
23.143
35
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
14.282
15
109
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_4_deg
28.702
15
6
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.112
0.2
99
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.007
0.021
760
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_other
0.001
0.02
154
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_it
1.702
1.5
413
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_other
0.518
1.5
166
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_it
2.734
2
666
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_it
4.186
3
264
X-RAY DIFFRACTION
r_scangle_it
6.353
4.5
249
X-RAY DIFFRACTION
r_rigid_bond_restr
2.071
3
1150
LS精密化 シェル
解像度: 1.801→1.847 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.324
25
-
Rwork
0.206
415
-
obs
-
440
77.74 %
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 18.638 Å / Origin y: -3.422 Å / Origin z: 2.27 Å