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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3k0i | ||||||
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タイトル | Crystal structure of Cu(I)CusA | ||||||
![]() | Cation efflux system protein cusA | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / transmembrane helix / Cell inner membrane / Cell membrane / Copper transport / Ion transport / Membrane / Transmembrane / Transport | ||||||
機能・相同性 | ![]() silver ion transport / silver ion transmembrane transporter activity / plasma membrane copper ion transport / copper ion transmembrane transport / response to silver ion / silver ion transmembrane transport / copper ion transmembrane transporter activity / copper ion export / detoxification of copper ion / response to copper ion ...silver ion transport / silver ion transmembrane transporter activity / plasma membrane copper ion transport / copper ion transmembrane transport / response to silver ion / silver ion transmembrane transport / copper ion transmembrane transporter activity / copper ion export / detoxification of copper ion / response to copper ion / xenobiotic transmembrane transporter activity / intracellular copper ion homeostasis / response to toxic substance / copper ion binding / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Su, C.-C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of CusA 著者: Long, F. / Su, C.-C. / Routh, M.D. / Rajashankar, K.R. / Yu, E.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 409.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 335 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 439.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 533.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 49.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 65.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 115833.945 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: Resistance-Nodulation-Cell Division (RND) Heavy-metal Transporter 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.82 Å3/Da / 溶媒含有率: 67.81 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 10% PEG 3350, 0.1M Na citrate, 0.5M (NH4)2SO4, 10% Glycerol, 1% JM600 pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2009年7月30日 |
放射 | モノクロメーター: Si(111) channel / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.3779 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 4.116→40 Å / Num. obs: 26090 / % possible obs: 98.1 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.089 / Net I/σ(I): 8.8 |
反射 シェル | 解像度: 4.116→4.27 Å / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.457 / % possible all: 99.5 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 130.53 Å2 / ksol: 0.25 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 190.13 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 4.116→38.458 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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