PDB-3h1s: Crystal structure of superoxide dismutase from Francisella tulare...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3h1s

タイトル

Crystal structure of superoxide dismutase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4

要素

Superoxide dismutase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / sobD / superoxide dismutase / CSGID / Structural Genomics / National Institute of Allergy and Infectious Diseases / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases

機能・相同性

機能・相同性情報

superoxide dismutase / superoxide dismutase activity / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Francisella tularensis subsp. tularensis (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Nocek, B. / Zhou, M. / Papazisi, L. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Crystal structure of superoxide dismutase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
著者: Nocek, B. / Zhou, M. / Papazisi, L. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2009年4月13日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2009年5月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Refinement description / Version format compliance
改定 1.2	2018年1月24日	Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.name
改定 1.3	2023年9月6日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3h1s.cif.gz	98.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3h1s.ent.gz	76.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3h1s.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3h1s_validation.pdf.gz	447.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3h1s_full_validation.pdf.gz	450.4 KB	表示
XML形式データ	3h1s_validation.xml.gz	18.3 KB	表示
CIF形式データ	3h1s_validation.cif.gz	27.1 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h1/3h1s ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h1/3h1s	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	1iscS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1uer-2 1uer-1 3esf-2 6ex3-2 4yet-d 2rcv-2 2bkb-1 1mng-d 6qv9-d 2rcv-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetDB: IDP01808

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#94 - 2007年10月スーパーオキシドジスムターゼ (Superoxide Dismutase) 類似性 (11)

登録構造単位

A: Superoxide dismutase

B: Superoxide dismutase

ヘテロ分子

44.9 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	136.787, 136.787, 59.765
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	146
Space group name H-M	H3

詳細

THE AUTHORS STATE THAT THE BIOLOGICAL UNIT IS UNKNOWN.

#1: タンパク質	Superoxide dismutase 分子量: 22234.732 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Francisella tularensis subsp. tularensis (バクテリア) 遺伝子: sodB, FTT0068 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21magic / 参照: UniProt: Q5NIJ9, superoxide dismutase
#2: 化合物	ChemComp-FE / FE (III) ION 分子量: 55.845 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 252 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.42 Å³/Da / 溶媒含有率: 49.17 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 0.2 potassium acetate 20% Peg 3350 0.1 M Cesium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.9794 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2009年4月8日 / 詳細: mirrors
放射	モノクロメーター: double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9794 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.9→40 Å / Num. all: 32840 / Num. obs: 32413 / % possible obs: 98.7 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.9 % / B_iso Wilson estimate: 44.8 Å² / R_merge(I) obs: 0.032 / Net I/σ(I): 38
反射シェル	解像度: 1.9→1.93 Å / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.466 / Mean I/σ(I) obs: 3 / Num. unique all: 1617 / % possible all: 96.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SBC-Collect		データ収集
MOLREP		位相決定
REFMAC	5.5.0054	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 1ISC

1isc

解像度: 1.9→40 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.971 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.955 / SU B: 7.001 / SU ML: 0.095 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / σ(I): 2 / ESU R: 0.141 / ESU R Free: 0.132 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.20502	1647	5.1 %	RANDOM
R_work	0.16485	-	-	-
all	0.167	32408	-	-
obs	0.1669	30761	98.62 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 18.936 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-1.66 Å²	-0.83 Å²	0 Å²
2-	-	-1.66 Å²	0 Å²
3-	-	-	2.48 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.9→40 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3092	0	20	252	3364

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.018	0.022	3193
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	2086
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.509	1.919	4340
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.935	3	5095
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.871	5	380
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	37.105	25.28	161
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	14.779	15	512
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.136	15	6
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.099	0.2	466
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.02	3556
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	658
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.851	1.5	1900
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.269	1.5	770
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.381	2	3068
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.188	3	1293
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.291	4.5	1272
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 1.9→1.949 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.276	124	-
R_work	0.229	2205	-
obs	-	-	96.96 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.9579	-0.239	-0.7931	3.3426	0.9018	6.5929	0.1877	0.8347	0.0214	-0.0267	-0.2488	0.8534	0.0852	-0.7997	0.0611	0.1288	0.1158	-0.0772	0.5359	-0.0604	0.6715	6.7154	17.3256	-2.2622
2	9.1307	-0.6741	0.8634	7.1052	-4.1289	2.4335	-0.4299	0.084	0.2694	0.3928	0.3342	-0.0825	-0.2843	-0.2302	0.0958	0.2558	0.1859	0.047	0.2186	-0.0675	0.6589	11.1377	30.0539	8.7147
3	3.0453	-0.3587	-2.4139	2.2581	0.7231	4.0197	0.119	0.3881	0.1507	-0.1136	-0.0429	0.5903	-0.399	-0.3352	-0.0761	0.2168	0.078	-0.0059	0.2089	0.0008	0.44	16.7546	27.5372	2.3379
4	4.0782	-1.8946	1.1495	5.4816	2.0226	3.4719	-0.0807	0.8005	-0.4864	-0.5279	-0.0272	0.7239	-0.4848	0.0604	0.1079	0.1608	0.0966	-0.0701	0.4568	-0.0851	0.4565	16.5987	17.9135	-4.2834
5	8.7541	2.4756	2.0119	6.5955	0.7566	4.2706	0.0651	0.6384	-0.4931	-0.7968	-0.086	0.3058	0.078	-0.3878	0.0209	0.2266	-0.0058	-0.1809	0.4305	-0.2097	0.4421	14.603	5.4959	-11.1049
6	9.5793	-3.9265	-4.5333	6.3947	5.1667	4.4334	0.0435	0.3822	-0.851	0.2076	-0.2217	0.0242	0.1466	-0.2407	0.1783	0.3475	-0.1193	-0.1941	0.4011	-0.1655	0.6047	9.1192	1.9999	-5.6816
7	9.5258	-2.591	2.9199	6.7325	-5.4044	4.4284	0.1275	0.4633	-0.9658	-0.592	0.3536	0.6299	0.4744	-0.2276	-0.4811	0.1456	-0.0891	-0.0242	0.268	-0.216	0.8388	11.4699	0.9546	1.0193
8	2.4532	0.5858	0.4359	1.3361	-0.9765	1.3447	0.0726	0.4071	-0.1874	-0.0574	0.0612	0.3907	0.0581	-0.059	-0.1338	0.0358	0.0406	-0.0298	0.1804	-0.1961	0.4793	16.4096	9.4073	1.7103
9	1.6826	-0.3026	-1.0582	2.2064	-2.7977	5.8933	-0.2455	0.0592	0.0291	0.25	0.0281	0.3121	-0.076	-0.4449	0.2174	0.1634	0.0507	0.1635	0.1785	-0.1269	0.6208	6.0827	18.8244	18.871
10	5.2702	1.3129	2.9458	6.2824	-1.7027	4.767	-0.0178	-0.8549	-0.0172	0.9541	-0.2346	0.2092	-0.1753	-0.2677	0.2524	0.4034	0.0978	0.3396	0.3635	0.0266	0.473	13.917	11.466	29.645
11	6.9039	-0.4528	-4.0439	6.7891	-0.6377	5.5259	-0.2954	-0.4208	0.1636	0.6576	0.1732	0.5147	-0.0882	0.3614	0.1222	0.241	0.0461	0.1452	0.1281	-0.0562	0.2758	22.426	15.1569	21.7257
12	1.7981	0.2063	0.6317	0.9458	0.0815	1.503	-0.0516	-0.0812	-0.3048	0.2842	-0.0127	0.4256	0.1026	-0.1685	0.0643	0.1613	0.0281	0.1606	0.0897	-0.0387	0.3672	18.5793	6.9923	15.6583
13	8.8435	5.6563	-5.672	9.2014	-2.4532	4.1931	0.135	0.0836	-0.5349	0.153	-0.3623	0.6786	-0.1142	0.0611	0.2273	0.0848	0.0181	0.1185	0.2428	-0.1982	0.6868	17.0377	3.2492	8.0509
14	7.8004	-1.3945	-4.7636	9.2318	2.6827	8.8263	-0.2634	0.2789	-0.6629	0.1792	-0.2111	0.6352	0.6779	-0.3707	0.4746	0.1328	0.0052	0.0904	0.1909	-0.0345	0.3878	11.8197	5.1835	14.3449
15	1.1161	-0.601	-0.455	0.4286	0.3779	0.9242	-0.0862	0.1568	0.0324	0.0477	-0.0751	0.1809	-0.1125	-0.0427	0.1613	0.1574	0.041	0.0219	0.1162	-0.006	0.3961	23.3945	21.3295	8.1798
16	3.6071	1.6321	-3.3311	0.9909	-2.2521	5.6771	0.1726	-0.1296	0.3044	0.2248	-0.1522	0.1603	-0.4275	0.3234	-0.0204	0.2578	-0.0259	0.0988	0.0975	-0.0881	0.3467	27.4422	26.2743	13.5387
17	9.8395	-3.0094	-0.6303	1.8899	-1.5307	3.1297	-0.3367	-0.2789	-0.3551	0.3347	0.1335	0.0806	-0.3431	-0.0615	0.2033	0.1801	0.0439	0.1675	0.0933	-0.1024	0.5243	15.0952	22.6221	18.1673
18	2.4726	0.0499	3.25	7.9096	-3.2995	5.7149	0.0494	-0.2467	0.0572	0.0346	-0.0127	0.3939	0.0775	-0.3681	-0.0366	0.1275	0.0313	0.253	0.273	-0.1013	0.6828	4.0812	12.2127	16.8
19	1.5278	-0.5083	-0.553	3.9776	-3.5245	5.4167	-0.1358	-0.0924	0.402	0.4781	-0.0324	-0.4916	-0.4668	0.3579	0.1682	0.2012	-0.0845	-0.096	0.101	-0.0142	0.2246	50.7234	23.6435	12.4415
20	6.1979	0.3573	2.0172	1.3386	1.3864	2.1133	-0.0727	0.2985	0.5849	-0.1074	-0.067	0.1321	-0.3471	0.0029	0.1397	0.3174	-0.042	0.0058	0.0807	0.1166	0.2972	43.0323	32.8636	-2.1439
21	6.177	-3.8402	-0.1071	9.7301	-5.0806	7.7394	0.0159	0.094	0.6062	0.4397	0.0434	-0.0225	-0.8532	0.1272	-0.0593	0.2498	-0.0205	-0.0198	0.0184	0.0564	0.2703	37.7932	32.9709	3.8505
22	1.8781	-0.2148	0.1977	2.3422	-1.407	0.8515	-0.1432	-0.111	0.3189	0.3581	0.1424	0.0131	-0.2369	-0.0686	0.0008	0.283	-0.0218	-0.0095	0.1201	-0.0254	0.2211	39.7868	25.0603	10.432
23	2.5748	-3.4386	0.6246	8.4175	-0.1514	0.7762	-0.3297	-0.1375	0.1271	0.8754	0.3221	0.0492	-0.0417	0.1798	0.0075	0.3035	0.0364	-0.0024	0.1952	-0.0544	0.1256	44.651	16.1442	20.9607
24	3.7084	-0.8759	-1.0001	3.5862	-4.8722	7.9949	-0.1017	-0.1235	0.2018	0.39	-0.0175	-0.1536	-0.5082	0.1086	0.1192	0.2051	-0.0114	-0.017	0.1285	-0.0218	0.1049	51.3903	8.8125	18.7286
25	9.4119	-1.683	3.4755	6.1311	1.0621	2.6829	-0.0634	0.2807	0.2193	-0.123	-0.1817	-0.3308	0.013	0.0364	0.245	0.1861	-0.0124	0.0217	0.1721	0.0166	0.1055	50.2758	7.3894	10.6207
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29	4.5638	-1.3196	-1.7844	2.3361	1.0318	7.713	0.2	0.3049	0.0919	-0.4476	-0.1594	-0.0452	-0.453	-0.2254	-0.0407	0.2727	0.0005	-0.0292	0.1911	0.0708	0.1201	41.8755	14.3329	-17.6532
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33	1.5344	-0.3511	0.297	2.1174	-0.3737	0.9557	-0.0474	0.0843	0.0166	0.0213	-0.0348	0.0566	-0.0612	0.0462	0.0823	0.1643	-0.0217	-0.0033	0.1598	0.016	0.1015	43.6367	10.2556	0.0786
34	3.2712	1.0501	1.4332	3.2766	0.2179	0.6536	-0.0506	0.0054	0.2159	0.0876	-0.0291	0.2597	-0.068	-0.0129	0.0797	0.2567	0.05	0.0057	0.1567	0.0278	0.2299	31.4775	22.8488	1.9967
35	5.4668	-0.4511	-1.7585	1.3615	0.5622	1.799	-0.0088	0.4066	0.1551	-0.2388	-0.0981	0.125	-0.2881	-0.1813	0.1068	0.2179	0.0209	-0.0578	0.1193	0.0958	0.1537	36.6934	24.0638	-8.0323
36	5.4618	-1.2322	0.5665	5.1244	-0.1342	4.177	-0.0891	0.2178	0.1282	-0.0333	-0.1457	-0.3681	-0.3106	0.369	0.2349	0.1395	-0.0596	-0.0032	0.1735	0.0966	0.1582	55.0951	16.4806	-6.8514

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	2 - 9
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	10 - 18
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	19 - 28
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	29 - 37
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	38 - 47
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	48 - 53
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	54 - 59
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	60 - 77
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	78 - 94
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	95 - 105
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	106 - 117
12	X-RAY DIFFRACTION	12	A	118 - 140
13	X-RAY DIFFRACTION	13	A	141 - 147
14	X-RAY DIFFRACTION	14	A	148 - 153
15	X-RAY DIFFRACTION	15	A	154 - 165
16	X-RAY DIFFRACTION	16	A	166 - 172
17	X-RAY DIFFRACTION	17	A	173 - 183
18	X-RAY DIFFRACTION	18	A	184 - 191
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	1 - 9
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	10 - 19
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	20 - 25
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	26 - 35
23	X-RAY DIFFRACTION	23	B	36 - 45
24	X-RAY DIFFRACTION	24	B	46 - 53
25	X-RAY DIFFRACTION	25	B	54 - 58
26	X-RAY DIFFRACTION	26	B	59 - 77
27	X-RAY DIFFRACTION	27	B	78 - 88
28	X-RAY DIFFRACTION	28	B	89 - 101
29	X-RAY DIFFRACTION	29	B	102 - 109
30	X-RAY DIFFRACTION	30	B	110 - 118
31	X-RAY DIFFRACTION	31	B	119 - 126
32	X-RAY DIFFRACTION	32	B	127 - 137
33	X-RAY DIFFRACTION	33	B	138 - 157
34	X-RAY DIFFRACTION	34	B	158 - 164
35	X-RAY DIFFRACTION	35	B	165 - 183
36	X-RAY DIFFRACTION	36	B	184 - 191

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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