登録情報 | データベース: PDB / ID: 3gz6 |
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タイトル | Crystal structure of Shewanella oneidensis NrtR complexed with a 27mer DNA |
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要素 | - (DNA (27-MER)) x 2
- MutT/nudix family protein
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN/DNA / DNA binding protein / NUDIX domain / wHTH domain / DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
catalytic activity / identical protein binding類似検索 - 分子機能 Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / NUDIX domain / Nudix hydrolase domain profile. / NUDIX hydrolase domain / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain / Arc Repressor Mutant, subunit A / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily ...Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / Nucleoside Triphosphate Pyrophosphohydrolase / NUDIX domain / Nudix hydrolase domain profile. / NUDIX hydrolase domain / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain / Arc Repressor Mutant, subunit A / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Transcriptional repressor of nicotinamide riboside utilization NrtR類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Shewanella oneidensis (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.901 Å |
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データ登録者 | Huang, N. / Zhang, H. |
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引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2009 タイトル: Structure and function of an ADP-ribose-dependent transcriptional regulator of NAD metabolism 著者: Huang, N. / De Ingeniis, J. / Galeazzi, L. / Mancini, C. / Korostelev, Y.D. / Rakhmaninova, A.B. / Gelfand, M.S. / Rodionov, D.A. / Raffaelli, N. / Zhang, H. |
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履歴 | 登録 | 2009年4月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2009年6月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年1月11日 | Group: Other |
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改定 1.3 | 2017年11月1日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.4 | 2018年4月4日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.type |
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改定 1.5 | 2019年7月24日 | Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.location / _software.name / _software.type |
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改定 1.6 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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