PDB-3gas: Crystal Structure of Helicobacter pylori Heme Oxygenase Hugz in C...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3gas

タイトル

Crystal Structure of Helicobacter pylori Heme Oxygenase Hugz in Complex with Heme

要素

heme oxygenase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / heme oxygenase / FMN-binding split barrel

機能・相同性

機能・相同性情報

metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Helicobacter pylori (ピロリ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

多波長異常分散 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Jiang, F. / Hu, Y.L. / Guo, Y. / Guo, G. / Zou, Q.M. / Wang, D.C.

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Crystal Structure of Helicobacter pylori Heme Oxygenase Hugz in Complex with Heme
著者: Jiang, F. / Hu, Y.L. / Guo, Y. / Guo, G. / Zou, Q.M. / Wang, D.C.

履歴

登録	2009年2月18日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2010年2月23日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2024年10月30日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
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その他	その他のダウンロード

-
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文書・詳細版	3gas_full_validation.pdf.gz	2.5 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ga/3gas ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ga/3gas	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	2op0-d 3lsy-d 2nq8-d 4oqq-d 2op1-d 2ol4-d 1zxl-d 4wl2-3 3swj-2 1oxl-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

類似構造データ

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-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: heme oxygenase

B: heme oxygenase

C: heme oxygenase

D: heme oxygenase

E: heme oxygenase

F: heme oxygenase

ヘテロ分子

185 kDa, 6 ポリマー
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1

A: heme oxygenase

B: heme oxygenase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
61.5 kDa, 2 ポリマー
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2

C: heme oxygenase

D: heme oxygenase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
61.4 kDa, 2 ポリマー
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3

E: heme oxygenase

F: heme oxygenase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
61.5 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	88.330, 139.340, 152.900
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	heme oxygenase 分子量: 29863.961 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Helicobacter pylori (ピロリ菌) / 株: NCTC11639 / 遺伝子: HugZ / プラスミド: pET22b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: C0LU01, heme oxygenase (biliverdin-producing)
#2: 化合物	ChemComp-HEM / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / HEME 分子量: 616.487 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₄H₃₂FeN₄O₄
#3: 化合物	ChemComp-AZI / AZIDE ION / アザイド分子量: 42.020 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: N₃
#4: 化合物	... ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 22 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1289 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.63 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.15 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: PEG 3350, tacsimate, imidazole, methanol, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 95 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

Photon Factory

/ ビームライン: BL-17A / 波長: 1.00000, 0.97912, 0.97931, 0.96408

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 270 / 検出器: CCD / 日付: 2008年10月26日

放射

プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	1	1
2	0.97912	1
3	0.97931	1
4	0.96408	1

Reflection

冗長度: 9.9 % / Av σ(I) over netI: 7.8 / 数: 810953 / R_merge(I) obs: 0.06 / R_sym value: 0.06 / D res high: 2.321 Å / D res low: 103.142 Å / Num. obs: 82219 / % possible obs: 100

Diffraction reflection shell

最高解像度 (Å)	最低解像度 (Å)	% possible obs (%)	ID	R_merge(I) obs	R_sym value	Redundancy
7.34	57.83	99.7	1	0.057	0.057	8.9
5.19	7.34	100	1	0.052	0.052	9.6
4.24	5.19	100	1	0.049	0.049	9.8
3.67	4.24	100	1	0.05	0.05	9.9
3.28	3.67	100	1	0.054	0.054	10
3	3.28	100	1	0.059	0.059	10
2.77	3	100	1	0.073	0.073	10
2.59	2.77	100	1	0.088	0.088	10
2.45	2.59	100	1	0.11	0.11	9.9
2.32	2.45	100	1	0.127	0.127	9.7

反射

解像度: 1.8→47.87 Å / Num. all: 165619 / Num. obs: 165702 / % possible obs: 94.9 % / Observed criterion σ(F): 2 / 冗長度: 6.7 % / B_iso Wilson estimate: 20 Å² / Limit h max: 48 / Limit h min: 0 / Limit k max: 74 / Limit k min: 0 / Limit l max: 76 / Limit l min: 0 / Observed criterion F max: 3093830.4 / Observed criterion F min: 4.1 / R_merge(I) obs: 0.049 / R_sym value: 0.049 / Net I/σ(I): 8.621

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique all	R_sym value	% possible all
1.8-1.9	4.5	0.172	4.3	81539	18209	0.172	72.8
1.9-2.01	5.4	0.128	5.5	119174	21917	0.128	91.9
2.01-2.15	7.2	0.119	5.7	161041	22494	0.119	99.9
2.15-2.32	7.3	0.09	7.4	152948	21077	0.09	100
2.32-2.55	7.3	0.067	9.6	142096	19347	0.067	100
2.55-2.85	7.4	0.05	12.1	130521	17599	0.05	100
2.85-3.29	7.5	0.041	13.4	116066	15563	0.041	100
3.29-4.02	7.4	0.038	14.4	98565	13270	0.038	100
4.02-5.69	7.3	0.039	14.2	75570	10341	0.039	100
5.69-47.89	6.8	0.047	10.4	40213	5885	0.047	99.5

-
位相決定

位相決定

手法:

多波長異常分散

Phasing MAD set

ID	最高解像度 (Å)	最低解像度 (Å)	Power acentric	Power centric	Reflection acentric	Reflection centric
ISO_1	2.32	57.81	0	0	75375	6758
ISO_2	2.32	57.81	0.596	0.421	74189	6719
ISO_3	2.32	57.81	1.111	0.793	74263	6702
ANO_1	2.32	57.81	1.848	0	75372	0
ANO_2	2.32	57.81	1.368	0	74163	0
ANO_3	2.32	57.81	1.228	0	74223	0

Phasing MAD set shell

ID	解像度 (Å)	Power acentric	Power centric	Reflection acentric	Reflection centric
ISO_1	10.22-57.81	0	0	751	316
ISO_1	7.28-10.22	0	0	1452	335
ISO_1	5.96-7.28	0	0	1944	337
ISO_1	5.17-5.96	0	0	2297	334
ISO_1	4.63-5.17	0	0	2642	341
ISO_1	4.23-4.63	0	0	2930	337
ISO_1	3.92-4.23	0	0	3216	348
ISO_1	3.66-3.92	0	0	3443	332
ISO_1	3.46-3.66	0	0	3701	347
ISO_1	3.28-3.46	0	0	3886	338
ISO_1	3.13-3.28	0	0	4129	340
ISO_1	2.99-3.13	0	0	4299	344
ISO_1	2.88-2.99	0	0	4519	338
ISO_1	2.77-2.88	0	0	4681	338
ISO_1	2.68-2.77	0	0	4837	336
ISO_1	2.59-2.68	0	0	5035	342
ISO_1	2.52-2.59	0	0	5215	348
ISO_1	2.45-2.52	0	0	5345	340
ISO_1	2.38-2.45	0	0	5533	344
ISO_1	2.32-2.38	0	0	5520	323
ANO_1	10.22-57.81	0.8	0	751	0
ANO_1	7.28-10.22	2.197	0	1452	0
ANO_1	5.96-7.28	3.688	0	1944	0
ANO_1	5.17-5.96	3.133	0	2297	0
ANO_1	4.63-5.17	2.641	0	2642	0
ANO_1	4.23-4.63	2.374	0	2930	0
ANO_1	3.92-4.23	2.291	0	3216	0
ANO_1	3.66-3.92	2.143	0	3443	0
ANO_1	3.46-3.66	2.094	0	3701	0
ANO_1	3.28-3.46	2.105	0	3886	0
ANO_1	3.13-3.28	2.205	0	4129	0
ANO_1	2.99-3.13	2.161	0	4299	0
ANO_1	2.88-2.99	2.114	0	4519	0
ANO_1	2.77-2.88	1.947	0	4681	0
ANO_1	2.68-2.77	1.707	0	4837	0
ANO_1	2.59-2.68	1.654	0	5035	0
ANO_1	2.52-2.59	1.559	0	5215	0
ANO_1	2.45-2.52	1.394	0	5343	0
ANO_1	2.38-2.45	1.219	0	5533	0
ANO_1	2.32-2.38	1.112	0	5519	0
ISO_2	10.22-57.81	0.473	0.497	749	285
ISO_2	7.28-10.22	0.685	0.616	1442	332
ISO_2	5.96-7.28	1.05	0.379	1925	337
ISO_2	5.17-5.96	0.893	0.651	2268	334
ISO_2	4.63-5.17	0.777	0.635	2616	341
ISO_2	4.23-4.63	0.697	0.476	2894	337
ISO_2	3.92-4.23	0.698	0.475	3177	348
ISO_2	3.66-3.92	0.664	0.474	3396	332
ISO_2	3.46-3.66	0.64	0.438	3651	347
ISO_2	3.28-3.46	0.653	0.386	3835	338
ISO_2	3.13-3.28	0.685	0.414	4068	340
ISO_2	2.99-3.13	0.668	0.413	4234	344
ISO_2	2.88-2.99	0.627	0.382	4446	338
ISO_2	2.77-2.88	0.586	0.369	4610	338
ISO_2	2.68-2.77	0.527	0.329	4753	336
ISO_2	2.59-2.68	0.497	0.304	4942	341
ISO_2	2.52-2.59	0.47	0.315	5123	348
ISO_2	2.45-2.52	0.42	0.252	5244	340
ISO_2	2.38-2.45	0.379	0.26	5418	342
ISO_2	2.32-2.38	0.337	0.235	5398	321
ANO_2	10.22-57.81	0.953	0	749	0
ANO_2	7.28-10.22	1.924	0	1439	0
ANO_2	5.96-7.28	2.648	0	1921	0
ANO_2	5.17-5.96	2.19	0	2264	0
ANO_2	4.63-5.17	1.85	0	2614	0
ANO_2	4.23-4.63	1.741	0	2892	0
ANO_2	3.92-4.23	1.673	0	3175	0
ANO_2	3.66-3.92	1.472	0	3396	0
ANO_2	3.46-3.66	1.483	0	3649	0
ANO_2	3.28-3.46	1.479	0	3832	0
ANO_2	3.13-3.28	1.509	0	4068	0
ANO_2	2.99-3.13	1.475	0	4230	0
ANO_2	2.88-2.99	1.413	0	4445	0
ANO_2	2.77-2.88	1.309	0	4607	0
ANO_2	2.68-2.77	1.17	0	4751	0
ANO_2	2.59-2.68	1.101	0	4934	0
ANO_2	2.52-2.59	1.06	0	5113	0
ANO_2	2.45-2.52	0.958	0	5231	0
ANO_2	2.38-2.45	0.86	0	5400	0
ANO_2	2.32-2.38	0.804	0	5453	0
ISO_3	10.22-57.81	0.982	0.941	747	283
ISO_3	7.28-10.22	1.654	1.078	1439	331
ISO_3	5.96-7.28	1.846	0.766	1931	337
ISO_3	5.17-5.96	1.632	1.11	2270	334
ISO_3	4.63-5.17	1.395	1.056	2618	341
ISO_3	4.23-4.63	1.295	0.852	2898	337
ISO_3	3.92-4.23	1.289	0.913	3182	348
ISO_3	3.66-3.92	1.228	0.913	3397	332
ISO_3	3.46-3.66	1.19	0.784	3655	347
ISO_3	3.28-3.46	1.228	0.838	3834	338
ISO_3	3.13-3.28	1.236	0.805	4074	340
ISO_3	2.99-3.13	1.196	0.786	4239	344
ISO_3	2.88-2.99	1.123	0.74	4454	338
ISO_3	2.77-2.88	1.05	0.7	4611	338
ISO_3	2.68-2.77	0.956	0.631	4756	335
ISO_3	2.59-2.68	0.905	0.567	4954	342
ISO_3	2.52-2.59	0.859	0.569	5128	342
ISO_3	2.45-2.52	0.77	0.445	5251	336
ISO_3	2.38-2.45	0.712	0.511	5429	343
ISO_3	2.32-2.38	0.636	0.433	5396	316
ANO_3	10.22-57.81	0.943	0	747	0
ANO_3	7.28-10.22	1.952	0	1436	0
ANO_3	5.96-7.28	2.523	0	1927	0
ANO_3	5.17-5.96	2.136	0	2266	0
ANO_3	4.63-5.17	1.773	0	2616	0
ANO_3	4.23-4.63	1.617	0	2896	0
ANO_3	3.92-4.23	1.574	0	3180	0
ANO_3	3.66-3.92	1.411	0	3397	0
ANO_3	3.46-3.66	1.307	0	3653	0
ANO_3	3.28-3.46	1.391	0	3831	0
ANO_3	3.13-3.28	1.385	0	4074	0
ANO_3	2.99-3.13	1.303	0	4235	0
ANO_3	2.88-2.99	1.268	0	4448	0
ANO_3	2.77-2.88	1.146	0	4605	0
ANO_3	2.68-2.77	1.004	0	4747	0
ANO_3	2.59-2.68	0.959	0	4950	0
ANO_3	2.52-2.59	0.909	0	5122	0
ANO_3	2.45-2.52	0.811	0	5239	0
ANO_3	2.38-2.45	0.728	0	5417	0
ANO_3	2.32-2.38	0.676	0	5437	0

Phasing MAD set site

ID	Cartn x (Å)	Cartn y (Å)	Cartn z (Å)	Atom type symbol	B iso	Occupancy
1	64.039	35.525	13.718	SE	15.75	0.77
2	56.164	30.749	9.633	SE	15.11	0.77
3	100.044	33.922	85.066	SE	17.65	0.74
4	101.508	35.731	33.006	SE	16.19	0.72
5	107.294	39.122	89.798	SE	18.31	0.74
6	101.435	30.634	41.762	SE	17.34	0.71
7	63.363	15.096	16.029	SE	19.89	0.74
8	66.152	54.328	17.273	SE	22.32	0.77
9	103.04	15.153	32.038	SE	19.99	0.72
10	104.315	54.513	30.08	SE	21.71	0.73
11	52.775	11.763	8.962	SE	22.86	0.78
12	101.873	11.512	44.641	SE	23.12	0.74
13	97.582	54.358	86.339	SE	20.23	0.7
14	96.641	14.987	85.455	SE	25.33	0.77
15	54.253	51.06	12.693	SE	22.84	0.73
16	106.335	18.834	93.525	SE	23.58	0.72
17	108.756	58.249	92.041	SE	25.35	0.74
18	106.047	50.701	42.545	SE	24.61	0.72
19	33.923	55.195	15.424	SE	27.89	0.7
20	113.943	14.71	112.605	SE	31.43	0.71
21	29.532	59.998	15.295	SE	31.55	0.68
22	116.436	9.938	116.427	SE	30.09	0.65
23	33.898	5.525	15.397	SE	37.61	0.68
24	77.301	60.955	95.78	SE	41.4	0.73
25	64.922	8.807	37.648	SE	39.53	0.66
26	77.021	9.278	90.037	SE	35.56	0.61
27	32.281	9.981	20.11	SE	46.58	0.73
28	72.266	65.093	95.011	SE	38.69	0.65
29	68.067	4.596	41.515	SE	35.98	0.61
30	74.89	14.123	93.974	SE	39.55	0.61
31	69.179	49.301	18.213	SE	15.88	0.26
32	103.376	49.666	26.92	SE	16.99	0.24
33	101.809	16.664	47.985	SE	17.45	0.22
34	49.962	17	7.426	SE	22.63	0.26
35	111.683	53.294	93.747	SE	18.63	0.21
36	94.103	19.982	83.197	SE	18.66	0.24

Phasing dm

FOM : 0.85 / FOM acentric: 0.84 / FOM centric: 0.9 / 反射: 82266 / Reflection acentric: 75488 / Reflection centric: 6778

Phasing dm shell

解像度 (Å)	FOM	FOM acentric	FOM centric	反射	Reflection acentric	Reflection centric
6.6-57.806	1.31	0.99	2.48	3769	2966	803
4.1-6.6	0.95	0.96	0.85	11141	9846	1295
3.3-4.1	0.94	0.95	0.83	13810	12603	1207
2.9-3.3	0.88	0.89	0.71	13852	12832	1020
2.5-2.9	0.78	0.79	0.57	24554	22978	1576
2.3-2.5	0.67	0.68	0.45	15140	14263	877

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALA	3.2.25	データスケーリング
SHARP		位相決定
RESOLVE	2.13	位相決定
CNS	1.2	精密化
PDB_EXTRACT	3.006	データ抽出
ADSC	Quantum	データ収集
HKL-2000		データ削減

精密化

構造決定の手法:

多波長異常分散 / 解像度: 1.8→47.87 Å / R_factor R_free error: 0.002 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / Data cutoff high absF: 3093830 / Data cutoff low absF: 0 / Isotropic thermal model: RESTRAINED / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / 詳細: BULK SOLVENT MODEL USED

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.222	8291	5 %	RANDOM
R_work	0.192	-	-	-
all	-	174565	-	-
obs	-	165278	94.6 %	-

溶媒の処理

溶媒モデル: FLAT MODEL / B_sol: 48.599 Å² / k_sol: 0.4 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso max: 74.03 Å² / B_iso mean: 26.662 Å² / B_iso min: 6.8 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	3.89 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-3.32 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.57 Å²

Refine analyze

	Free	Obs
Luzzati coordinate error	0.23 Å	0.2 Å
Luzzati d res low	-	5 Å
Luzzati sigma a	0.13 Å	0.09 Å
Luzzati d res high	-	1.8

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.8→47.87 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11844	0	364	1289	13497

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal
X-RAY DIFFRACTION	c_bond_d	0.01
X-RAY DIFFRACTION	c_angle_deg	1.5
X-RAY DIFFRACTION	c_dihedral_angle_d	22.9
X-RAY DIFFRACTION	c_improper_angle_d	0.89
X-RAY DIFFRACTION	c_mcbond_it
X-RAY DIFFRACTION	c_mcangle_it
X-RAY DIFFRACTION	c_scbond_it
X-RAY DIFFRACTION	c_scangle_it

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	% reflection R_free (%)	R_factor R_work	Num. reflection R_work	R_factor R_free error	Num. reflection all	Num. reflection obs	% reflection obs (%)
1.8-1.88	0.252	783	5.2	0.221	14398	0.009	21628	15181	70.2
1.88-1.98	0.235	968	5.1	0.199	17966	0.008	21636	18934	87.5
1.98-2.11	0.243	1077	5	0.199	20439	0.007	21739	21516	99
2.11-2.27	0.245	1050	4.8	0.199	20624	0.008	21720	21674	99.8
2.27-2.5	0.232	1060	4.9	0.19	20674	0.007	21770	21734	99.8
2.5-2.86	0.236	1124	5.2	0.199	20670	0.007	21806	21794	99.9
2.86-3.6	0.228	1115	5.1	0.2	20838	0.007	21963	21953	100
3.6-47.87	0.193	1114	5	0.178	21378	0.006	22532	22492	99.8

Xplor file

Refine-ID	Serial no	Param file	Topol file
X-RAY DIFFRACTION	1	protein_rep.param	protein.top
X-RAY DIFFRACTION	2	water_rep.param	water.top
X-RAY DIFFRACTION	3	hem.param	azi.top
X-RAY DIFFRACTION	4	azi.param	hem.top
X-RAY DIFFRACTION	5	edo.param	edo.top

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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