+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3d8a | ||||||
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Title | Co-crystal structure of TraM-TraD complex. | ||||||
Components |
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Keywords | DNA BINDING PROTEIN / TraM tetramerization domain / TraD C-terminal peptide / protein complex / Conjugation / DNA-binding / ATP-binding / Inner membrane / Membrane / Nucleotide-binding / Transmembrane | ||||||
Function / homology | Function and homology information unidirectional conjugation / membrane => GO:0016020 / DNA binding / ATP binding / plasma membrane / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Escherichia coli (E. coli) Escherichia coli K12 (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.55 Å | ||||||
Authors | Glover, J.N.M. / Lu, J. / Wong, J.J. / Edwards, R.A. | ||||||
Citation | Journal: Mol.Microbiol. / Year: 2008 Title: Structural basis of specific TraD-TraM recognition during F plasmid-mediated bacterial conjugation. Authors: Lu, J. / Wong, J.J. / Edwards, R.A. / Manchak, J. / Frost, L.S. / Glover, J.N. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3d8a.cif.gz | 118.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3d8a.ent.gz | 95.8 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3d8a.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d8/3d8a ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d8/3d8a | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 2g07S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1
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