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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3cuz
タイトル
Atomic Resolution Structures of Escherichia coli and Bacillis anthracis Malate Synthase A: Comparison with Isoform G and Implications for Structure Based Drug Design
温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.1M Tris pH 7.5, 0.2M calcium acetate, 22%PEG 8K. Prior to collection crystal incubated in similar solution with magnesium acetate instead of calcium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.2 / 波長: 0.9 Å
検出器
タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2005年12月7日
放射
モノクロメーター: Single crystal, cylindrically bent, Si(220) プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.9 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.04→30 Å / Num. obs: 228574 / % possible obs: 89.5 % / Observed criterion σ(I): 2
反射 シェル
解像度: 1.04→1.08 Å / % possible all: 50.9
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.2.0019
精密化
ADSC
Quantum
データ収集
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
MOLREP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: E. coli malate synthase A 解像度: 1.04→25.61 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.972 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.966 / SU B: 0.629 / SU ML: 0.015 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / ESU R: 0.029 / ESU R Free: 0.028 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.16593
11644
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.1527
-
-
-
obs
0.15336
216908
89.25 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK