- PDB-3c3m: Crystal structure of the N-terminal domain of response regulator ... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3c3m
タイトル
Crystal structure of the N-terminal domain of response regulator receiver protein from Methanoculleus marisnigri JR1
要素
Response regulator receiver protein
キーワード
SIGNALING PROTEIN / STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / PSI-2 / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / New York SGX Research Center for Structural Genomics / NYSGXRC
機能・相同性
機能・相同性情報
phosphorelay signal transduction system 類似検索 - 分子機能
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.9793 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.7→50 Å / Num. obs: 20448 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 5.8 % / Biso Wilson estimate: 22.923 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.075 / Net I/σ(I): 6.5
反射 シェル
解像度: 1.7→1.76 Å / 冗長度: 5.7 % / Rmerge(I) obs: 0.63 / Mean I/σ(I) obs: 1.6 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
SHELXD
位相決定
SHELXE
モデル構築
REFMAC
5.3.0034
精密化
ADSC
Quantum
データ収集
HKL-2000
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.7→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.971 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.964 / SU B: 1.716 / SU ML: 0.057 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.081 / ESU R Free: 0.083 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.19318
654
3.2 %
RANDOM
Rwork
0.16378
-
-
-
obs
0.16471
19747
99.88 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK