登録情報 | データベース: PDB / ID: 3c2p |
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タイトル | X-ray crystal structure of the N4 mini-vRNAP P1 promoter complex |
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要素 | - P1 Promoter DNA
- Virion RNA polymerase
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キーワード | transferase/DNA / protein-DNA complex / nucleotidyltransferase / promoter binary complex / DNA-hairpin / virion RNA polymerase / transferase-DNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA-directed RNA polymerase complex / virion component / DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity / DNA-directed RNA polymerase / GTP binding / ATP binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 - #110 / Alpha-Beta Plaits - #2440 / Transcription Regulator spoIIAA - #220 / Helix Hairpins - #1360 / Helix Hairpins - #1370 / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #1860 / : / : / Virion DNA-directed RNA polymerase, plug insertion / Virion DNA-directed RNA polymerase domain ...Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 - #110 / Alpha-Beta Plaits - #2440 / Transcription Regulator spoIIAA - #220 / Helix Hairpins - #1360 / Helix Hairpins - #1370 / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #1860 / : / : / Virion DNA-directed RNA polymerase, plug insertion / Virion DNA-directed RNA polymerase domain / Transcription Regulator spoIIAA / Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 / Helix Hairpins / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Helix non-globular / Special / Alpha-Beta Plaits / Up-down Bundle / 2-Layer Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Virion DNA-directed RNA polymerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bacteriophage N4 (ファージ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Gleghorn, M.L. / Murakami, K.S. |
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引用 | ジャーナル: Mol.Cell / 年: 2008 タイトル: Structural basis for DNA-hairpin promoter recognition by the bacteriophage N4 virion RNA polymerase. 著者: Gleghorn, M.L. / Davydova, E.K. / Rothman-Denes, L.B. / Murakami, K.S. |
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履歴 | 登録 | 2008年1月25日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年12月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年10月25日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.3 | 2024年2月21日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ref_seq Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end |
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