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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3abf | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of a 4-Oxalocrotonate Tautomerase Homologue (TTHB242) | ||||||
![]() | 4-oxalocrotonate tautomerase | ||||||
![]() | ISOMERASE / tautomerase | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kida, H. / Miki, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of a 4-Oxalocrotonate Tautomerase Homologue (TTHB242) from Thermus thermophilus HB8 著者: Kida, H. / Kita, A. / Miki, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 89.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 68.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 472.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 477.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 25.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1bjpS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7426.663 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: HB8 / 遺伝子: TTHB242 / プラスミド: pET11a / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.53 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / pH: 5.6 詳細: 0.6M MgSO4, 0.1M sodium citrate pH 5.6, vapor diffusion, sitting drop, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4r / 検出器: CCD / 日付: 2002年10月12日 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
放射波長 | 波長: 0.978 Å / 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
反射 | 解像度: 1.94→50 Å / Num. obs: 26856 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 4 % / Rmerge(I) obs: 0.057 / Χ2: 1 / Net I/σ(I): 22.231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
反射 シェル |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1BJP 解像度: 1.94→43.52 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0
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溶媒の処理 | Bsol: 67.79 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 33.33 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.94→43.52 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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