ソフトウェア | 名称 | 分類 |
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X-PLOR | 精密化 | SAINT | データ削減 | SAINT | データスケーリング |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.68→8 Å / σ(F): 3 / | Rfactor | 反射数 |
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Rfree | 0.287 | - |
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Rwork | 0.207 | - |
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obs | 0.207 | 3538 |
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原子変位パラメータ | Biso mean: 15.9 Å2 |
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.2 Å |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.68→8 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 284 | 16 | 49 | 349 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | x_bond_d0.007 | X-RAY DIFFRACTION | x_bond_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_bond_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_deg1.48 | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_deg_na | X-RAY DIFFRACTION | x_angle_deg_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_dihedral_angle_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_improper_angle_d | X-RAY DIFFRACTION | x_improper_angle_d_na | X-RAY DIFFRACTION | x_improper_angle_d_prot | X-RAY DIFFRACTION | x_mcbond_it | X-RAY DIFFRACTION | x_mcangle_it | X-RAY DIFFRACTION | x_scbond_it | X-RAY DIFFRACTION | x_scangle_it | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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Xplor file | Refine-ID | Serial no | Param file | Topol file |
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X-RAY DIFFRACTION | 1 | PAR_NDB.DNATOP_NDB.DNAX-RAY DIFFRACTION | 2 | PAR_NDB_HIGH.DNA | | | |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.68 Å / 最低解像度: 8 Å / σ(F): 3 |
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溶媒の処理 | *PLUS |
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原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 15.9 Å2 |
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