- PDB-2zw0: Crystal structure of a Streptococcal protein G B1 mutant -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 2zw0
タイトル
Crystal structure of a Streptococcal protein G B1 mutant
要素
Protein LG
キーワード
IMMUNE SYSTEM / IMMUNOGLOBULIN BINDING DOMAIN / PH-DEPENDENT LIGAND BINDING
機能・相同性
Protein L, Ig light chain-binding / Protein L b1 domain / IgG-binding B / B domain / Ubiquitin-like (UB roll) - #10 / Ubiquitin-like (UB roll) / Roll / Alpha Beta / Protein LG
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.4→50 Å / Num. obs: 9052 / 冗長度: 6.5 % / Biso Wilson estimate: 11.346 Å2
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.2.0019
精密化
HKL-2000
データ収集
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
MOLREP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.4→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.959 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.948 / SU B: 1.1 / SU ML: 0.045 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.074 / ESU R Free: 0.081 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2235
430
4.8 %
RANDOM
Rwork
0.1765
-
-
-
obs
0.17865
8574
99.82 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK