登録情報 | データベース: PDB / ID: 2zrx |
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タイトル | Crystal structure of Sulfolobus shibatae isopentenyl diphosphate isomerase in complex with FMN and DMAPP. |
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要素 | Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase |
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キーワード | ISOMERASE / type 2 / IDI / FMN / DMAPP / isopentenyl diphosphate isomerase / Flavoprotein / Isoprene biosynthesis / NADP |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase / isopentenyl-diphosphate delta-isomerase activity / isoprenoid biosynthetic process / NADPH binding / FMN binding / oxidoreductase activity / magnesium ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, FMN-dependent / FMN-dependent dehydrogenase / FMN-dependent dehydrogenase / IMP dehydrogenase / GMP reductase domain / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DIMETHYLALLYL DIPHOSPHATE / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Sulfolobus shibatae (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 3 Å |
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データ登録者 | Unno, H. / Yamashita, S. / Ikeda, Y. / Sekiguchi, S. / Yoshida, N. / Yoshimura, T. / Kusunoki, M. / Nakayama, T. / Nishino, T. / Hemmi, H. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2009 タイトル: New role of flavin as a general acid-base catalyst with no redox function in type 2 isopentenyl-diphosphate isomerase. 著者: Unno, H. / Yamashita, S. / Ikeda, Y. / Sekiguchi, S.Y. / Yoshida, N. / Yoshimura, T. / Kusunoki, M. / Nakayama, T. / Nishino, T. / Hemmi, H. |
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履歴 | 登録 | 2008年9月1日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2009年1月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2012年5月23日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2024年3月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR DETERMINED |
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Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR DETERMINED |
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