PDB-2y7a: Crystal structure of unliganded GTB P156L

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2y7a

タイトル

Crystal structure of unliganded GTB P156L

要素

ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

キーワード

TRANSFERASE / ABO BLOOD GROUP

機能・相同性

機能・相同性情報

fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase / glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase / glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase activity / fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase activity / ABO blood group biosynthesis / hexosyltransferase activity / : / Golgi cisterna membrane / protein glycosylation / antigen binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

HOMO SAPIENS (ヒト)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 2.06 Å

データ登録者

Weadge, J. / Palcic, M.M. / Henriksen, A.

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Structural and Biochemical Characterization of the Human Blood Group a and B Galactosyltransferases Possessing the Pro156Leu Mutation
著者: Weadge, J. / Palcic, M.M. / Henriksen, A.

履歴

登録	2011年1月31日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2012年2月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年10月3日	Group: Derived calculations
改定 1.2	2017年7月12日	Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.type
改定 1.3	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2y7a.cif.gz	465.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2y7a.ent.gz	385.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2y7a.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	2y7a_validation.pdf.gz	776.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2y7a_full_validation.pdf.gz	781.9 KB	表示
XML形式データ	2y7a_validation.xml.gz	42 KB	表示
CIF形式データ	2y7a_validation.cif.gz	59.4 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y7/2y7a ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y7/2y7a	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1zizS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1r82-2 1lzj-2 2rit-2 6bjl-2 1r81-2 3sxd-2 1wt2-2 5nue-2 4frh-1 3sx8-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#156 - 2012年12月 ABO式血液型糖転移酵素 (ABO Blood Type Glycosyltransferases) 類似性 (9) #254 - 2021年2月セルロース合成酵素 (Cellulose Synthase) 類似性 (2) #141 - 2011年9月 O-GlcNAc転移酵素 (O-GlcNAc Transferase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

B: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

C: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

D: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

ヘテロ分子

139 kDa, 4 ポリマー
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1

A: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

B: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
69.8 kDa, 2 ポリマー
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2

C: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

D: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
69.4 kDa, 2 ポリマー
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3

D: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

C: ABO GLYCOSYLTRANSFERASE

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
69.4 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	63.730, 78.290, 143.740
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 88.96, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	ABO GLYCOSYLTRANSFERASE 分子量: 34676.098 Da / 分子数: 4 / 断片: RESIDUES 54-344 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: Q70V26, UniProt: P16442*PLUS, fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase
#2: 化合物	ChemComp-MN / MANGANESE (II) ION 分子量: 54.938 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mn
#3: 化合物	ChemComp-UDP / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE / UDP タイプ: RNA linking / 分子量: 404.161 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₉H₁₄N₂O₁₂P₂ / コメント: UDP*YM
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 376 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
構成要素の詳細	ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, PRO 146 TO LEU ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, PRO 146 TO LEU ...ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, PRO 146 TO LEU ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, PRO 146 TO LEU ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN C, PRO 146 TO LEU ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN D, PRO 146 TO LEU
配列の詳細	N-TERMINAL DISCREPANCIES ENGINEERED TO CONSTRUCT EXPRESSION PLASMID.

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.72 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.8 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 7 詳細: 5 MM MOPS PH 7, 1 MM MNCL2, 1 MM DTT, 0.1 M AMSO4, 10% (W/V) PEG 3350.

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

回転陽極 / タイプ: RIGAKU RUH3R / 波長: 1.5418

検出器

タイプ: RIGAKU IMAGE PLATE / 検出器: IMAGE PLATE / 詳細: MIRRORS

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.5418 Å / 相対比: 1

Reflection twin

Crystal-ID	ID	Operator	Domain-ID	Fraction
1	1	H, K, L	1	0.55
1	1	h,-k,-l	2	0.45

反射

解像度: 2.06→143.76 Å / Num. obs: 75523 / % possible obs: 93.2 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.5 % / B_iso Wilson estimate: 29.955 Å² / R_merge(I) obs: 0.07 / Net I/σ(I): 12.6

反射シェル

解像度: 2.06→2.16 Å / 冗長度: 2.8 % / R_merge(I) obs: 0.35 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / % possible all: 77.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.5.0109	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1ZIZ

1ziz

解像度: 2.06→143.76 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.935 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.92 / SU B: 9.629 / SU ML: 0.113 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.049 / ESU R Free: 0.039 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. DISORDERED REGIONS AND SIDECHAINS WERE NOT MODELED.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.24453	4047	5.1 %	RANDOM
R_work	0.21567	-	-	-
obs	0.21716	75523	91 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 39.362 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	7.46 Å²	0 Å²	-6.98 Å²
2-	-	-27.82 Å²	0 Å²
3-	-	-	20.35 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.06→143.76 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8969	0	26	376	9371

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.007	0.022	9253
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	0.984	1.952	12570
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.289	5	1097
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.235	22.648	438
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	14.213	15	1529
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	13.104	15	74
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.071	0.2	1370
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.021	7063
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.164	1.5	5502
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.295	2	8936
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.504	3	3751
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	0.79	4.5	3634
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.061→2.114 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.3	174	-
R_work	0.297	2951	-
obs	-	-	48.82 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.7791	-6.8043	3.7399	-2.5962	1.6671	-0.7683	0.1026	-0.4293	-0.1546	0.4572	0.32	-0.0165	0.2435	-0.1271	-0.4226	0.3232	-0.0851	0.0714	0.3144	-0.0487	0.3065	-5.598	31.062	-9.991
2	6.1848	1.5886	4.9253	0.2122	2.1143	6.71	-0.0665	0.3894	0.1572	-0.2273	0.0471	-0.1768	-0.0498	0.1513	0.0194	0.2994	0.007	0.1566	0.3601	0.0152	0.2283	-8.496	29.942	-26.816
3	1.999	1.1097	0.9253	1.8325	0.6348	0.0758	0.0434	0.1353	0.0265	-0.1541	0.0138	-0.0755	-0.0132	0.0727	-0.0572	0.1305	0.031	0.0805	0.2734	0.0075	0.0995	-9.187	17.278	-23.24
4	0.2027	-18.7594	-4.2383	29.3121	-17.9336	19.2946	-0.0824	-0.6044	0.0618	0.5282	0.1033	-0.4394	-0.4745	0.0775	-0.021	0.2084	-0.062	0.0686	0.3563	-0.0457	0.2278	-1.73	23.793	-7.556
5	3.4321	0.9886	0.6986	1.4794	0.7624	1.7934	0.1576	0.0872	-0.4311	-0.0229	-0.1249	-0.2092	0.3027	0.1137	-0.0327	0.1442	-0.005	0.0424	0.2935	-0.0329	0.1403	5.586	-1.628	-9.783
6	3.0058	-0.7569	2.6001	4.7107	-0.5689	1.5626	0.2424	0.29	-0.0514	-0.3613	-0.0712	-0.4426	0.0337	0.2869	-0.1712	0.1379	-0.0052	0.1187	0.3774	-0.0891	0.2247	9.414	9.251	-14.674
7	3.3398	-0.5055	3.5294	8.2496	-13.2228	10.4822	0.0743	-0.017	0.0131	0.3793	-0.2172	-0.0488	-0.4736	-0.0609	0.1429	0.0963	-0.0132	0.0791	0.2999	0.0049	0.1171	5.7	8.419	-4.609
8	1.6727	-0.3951	0.8034	6.6005	0.4993	1.1979	0.1125	0.0183	-0.1165	-0.0243	-0.0452	-0.5676	0.1087	0.1908	-0.0673	0.1625	0.0157	0.0665	0.3571	0.012	0.2121	12.315	2.671	-5.162
9	-5.9628	-1.0607	-9.1167	-0.4422	-4.3541	2.1371	-0.0237	0.3759	0.1075	-0.2857	-0.0408	0.1443	0.6515	0.2107	0.0645	0.4014	0.0701	0.0271	0.4952	0.0016	0.3787	1.503	-8.334	-2.108
10	2.4865	2.3182	2.878	6.5152	3.8548	6.8494	0.21	-0.2213	-0.1416	0.3338	-0.0645	-0.1519	0.5005	-0.2386	-0.1455	0.1164	0.0285	0.0603	0.3085	0.0214	0.1293	-4.16	-2.799	-0.93
11	3.9024	0.4418	-2.9795	10.3344	0.4392	9.4715	-0.0663	-0.7032	0.015	0.5118	-0.0961	-0.0644	0.0819	0.258	0.1624	0.1248	-0.0254	0.0461	0.2877	-0.0053	0.0972	-1.445	8.414	1.631
12	0.4168	-0.6316	-0.235	6.9619	-1.0308	3.3347	-0.0076	0.0411	-0.0916	0.0798	0.0626	-0.1396	0.3409	0.1251	-0.055	0.0955	-0.0142	0.066	0.2988	-0.0609	0.1628	0.996	3.092	-13.363
13	2.8805	0.7234	2.3176	0.1397	-0.89	1.8208	-0.0219	-0.0068	-0.0766	-0.0842	-0.0543	-0.1233	-0.0892	0.1536	0.0761	0.1404	-0.0084	0.0878	0.2317	-0.0059	0.0989	0.541	12.4	-18.028
14	2.0771	-1.6077	-2.3419	-0.1409	0.1979	4.1218	0.0796	-0.014	0.0273	-0.1817	0.0778	0.0231	-0.1238	0.2986	-0.1574	0.148	-0.0434	0.0661	0.2982	-0.0002	0.1028	-10.186	2.713	-23.001
15	1.583	0.6015	-0.1793	2.3679	0.1586	0.9669	-0.0845	0.0901	-0.1916	-0.2541	0.0942	0.0445	0.1408	-0.0517	-0.0097	0.1077	0.0046	0.053	0.2549	-0.0123	0.0906	-16.725	-3.648	-18.37
16	4.5683	8.978	2.1495	14.8046	4.3291	1.0871	0.1679	-0.1672	0.0708	0.3458	-0.1766	0.238	0.1117	-0.0245	0.0087	0.0797	0.0277	0.0949	0.3009	0.0113	0.1098	-13.243	-2.225	-4.034
17	1.1895	-0.3446	-1.7541	11.0671	-5.3383	17.0974	-0.0574	-0.092	0.0068	-0.3753	-0.214	-0.5405	-0.108	0.8543	0.2714	0.0985	-0.0249	0.0775	0.3402	-0.0206	0.1626	-16.473	-16.505	-7.938
18	2.4558	-1.1502	-1.1909	6.1894	1.8515	3.1254	-0.0006	-0.0344	-0.0974	0.0982	0.0119	0.008	0.2272	0.0485	-0.0114	0.1205	0.0004	0.0278	0.2636	-0.0042	0.0767	-14.288	-5.057	-14.858
19	1.2411	-0.9925	-0.363	0.7339	-0.5342	1.4965	-0.0313	0.1759	-0.1094	-0.0265	-0.0457	0.015	0.0866	-0.046	0.077	0.097	-0.0204	0.0297	0.2534	-0.0629	0.0744	-7.156	6.397	-21.466
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66	-4.4558	8.0879	3.1787	4.5782	2.541	7.7994	0.0812	-0.0261	-0.4967	0.2111	-0.0197	-0.4069	0.5713	0.7635	-0.0615	0.4341	-0.0606	0.1299	0.518	0.1224	0.5598	-39.978	33.9	-58.577
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74	1.6009	1.5074	-0.6309	0.6165	-0.4006	0.4639	-0.2178	0.1312	0.199	-0.1287	0.2653	0.078	0.0865	0.0555	-0.0475	0.2674	-0.0443	0.0613	0.3491	0.0061	0.1251	-22.289	45.883	-51.028
75	2.2069	-2.1388	0.311	1.3317	0.2271	2.8883	-0.043	-0.1661	-0.2071	0.2611	0.0944	-0.1653	0.386	0.3698	-0.0513	0.357	-0.0132	0.1405	0.4558	-0.0666	0.4893	-10.628	30.892	-51.225
76	2.2261	-1.9663	1.543	4.8882	-3.0747	1.7597	-0.0422	0.3172	-0.3364	-0.1437	0.0114	-0.4029	0.1402	0.0697	0.0308	0.3224	-0.0965	0.1091	0.399	-0.1028	0.2788	-15.279	38.562	-51.379
77	0.295	-4.6206	-0.4624	12.6593	3.3781	0.8198	0.2812	0.1172	0.2523	-0.4973	-0.2553	-0.5737	0.0612	0.1384	-0.0259	0.3528	-0.0522	0.1396	0.5217	0.0213	0.3343	-19.156	41.949	-67.156
78	2.219	-3.2187	-3.9812	5.6898	4.1275	5.8183	-0.0601	-0.0625	0.3242	-0.0134	0.2429	0.4326	0.8754	-0.052	-0.1828	0.4928	-0.0389	0.0398	0.4043	-0.0877	0.3242	-16.485	25.702	-61.607
79	2.5969	0.5849	0.0025	1.1518	0.2103	2.3588	-0.2812	0.3585	-0.3419	-0.2822	0.202	-0.2656	0.0964	0.1197	0.0792	0.2318	-0.047	0.1041	0.2917	0.0417	0.157	-19.545	42.023	-52.904
80	3.8516	-2.0987	-0.0355	1.1747	-3.5434	4.78	-0.2131	-0.1741	0.0378	-0.0822	0.2286	0.3026	0.283	0.0005	-0.0155	0.2924	-0.0308	0.0463	0.3573	0.0675	0.1534	-31.443	43.81	-41.445

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	62 - 68
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	69 - 80
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	81 - 107
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	108 - 113
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	114 - 130
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	131 - 145
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	146 - 151
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	152 - 172
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	173 - 186
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	187 - 198
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	199 - 205
12	X-RAY DIFFRACTION	12	A	206 - 215
13	X-RAY DIFFRACTION	13	A	216 - 226
14	X-RAY DIFFRACTION	14	A	227 - 240
15	X-RAY DIFFRACTION	15	A	241 - 275
16	X-RAY DIFFRACTION	16	A	276 - 289
17	X-RAY DIFFRACTION	17	A	290 - 297
18	X-RAY DIFFRACTION	18	A	298 - 312
19	X-RAY DIFFRACTION	19	A	313 - 327
20	X-RAY DIFFRACTION	20	A	328 - 345
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	65 - 73
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	74 - 79
23	X-RAY DIFFRACTION	23	B	80 - 84
24	X-RAY DIFFRACTION	24	B	85 - 107
25	X-RAY DIFFRACTION	25	B	108 - 120
26	X-RAY DIFFRACTION	26	B	121 - 131
27	X-RAY DIFFRACTION	27	B	132 - 158
28	X-RAY DIFFRACTION	28	B	159 - 175
29	X-RAY DIFFRACTION	29	B	181 - 197
30	X-RAY DIFFRACTION	30	B	198 - 208
31	X-RAY DIFFRACTION	31	B	209 - 220
32	X-RAY DIFFRACTION	32	B	221 - 236
33	X-RAY DIFFRACTION	33	B	237 - 255
34	X-RAY DIFFRACTION	34	B	256 - 271
35	X-RAY DIFFRACTION	35	B	272 - 283
36	X-RAY DIFFRACTION	36	B	284 - 292
37	X-RAY DIFFRACTION	37	B	293 - 309
38	X-RAY DIFFRACTION	38	B	310 - 324
39	X-RAY DIFFRACTION	39	B	325 - 330
40	X-RAY DIFFRACTION	40	B	331 - 345
41	X-RAY DIFFRACTION	41	C	66 - 82
42	X-RAY DIFFRACTION	42	C	83 - 108
43	X-RAY DIFFRACTION	43	C	109 - 116
44	X-RAY DIFFRACTION	44	C	117 - 133
45	X-RAY DIFFRACTION	45	C	134 - 144
46	X-RAY DIFFRACTION	46	C	145 - 158
47	X-RAY DIFFRACTION	47	C	159 - 175
48	X-RAY DIFFRACTION	48	C	188 - 197
49	X-RAY DIFFRACTION	49	C	198 - 215
50	X-RAY DIFFRACTION	50	C	216 - 223
51	X-RAY DIFFRACTION	51	C	224 - 233
52	X-RAY DIFFRACTION	52	C	234 - 239
53	X-RAY DIFFRACTION	53	C	240 - 258
54	X-RAY DIFFRACTION	54	C	259 - 264
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56	X-RAY DIFFRACTION	56	C	286 - 291
57	X-RAY DIFFRACTION	57	C	292 - 307
58	X-RAY DIFFRACTION	58	C	308 - 313
59	X-RAY DIFFRACTION	59	C	314 - 331
60	X-RAY DIFFRACTION	60	C	332 - 345
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79	X-RAY DIFFRACTION	79	D	302 - 327
80	X-RAY DIFFRACTION	80	D	328 - 345

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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