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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2xsk | ||||||
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タイトル | E. coli curli protein CsgC - SeCys | ||||||
![]() | CSGC | ||||||
![]() | CHAPERONE | ||||||
機能・相同性 | Curli production protein CsgC / Thin aggregative fimbriae synthesis protein / Immunoglobulin-like - #2420 / periplasmic space / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / ACETATE ION / Curli assembly protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Salgado, P.S. / Taylor, J.D. / Cota, E. / Matthews, S.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Extending the Usability of the Phasing Power of Diselenide Bonds: Secys Sad Phasing of Csgc Using a Non-Auxotrophic Strain. 著者: Salgado, P.S. / Taylor, J.D. / Cota, E. / Matthews, S.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 28 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 21.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 406.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 406.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12400.276 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 11-110 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: CYSTEINE 29 AND 31 SUBSTITUTED FOR SELENOCYSTEINE AND DISELENIDE BOND BETWEEN SECYS 29 AND SECYS31 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.16 % / 解説: SE SAD USING SELENOCYSTEINE |
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結晶化 | pH: 4.6 / 詳細: pH 4.6 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年7月17日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.979 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→32.2 Å / Num. obs: 11136 / % possible obs: 98.8 % / Observed criterion σ(I): 2.6 / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.04 / Net I/σ(I): 16.8 |
反射 シェル | 解像度: 1.7→1.8 Å / Rmerge(I) obs: 0.41 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / % possible all: 98.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: NONE 解像度: 1.7→26.66 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.946 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.923 / SU B: 3.274 / SU ML: 0.104 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.132 / ESU R Free: 0.134 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. RESIDUES 1-2 AND 98-110 INCLUDING CTERM HISTAG ARE DISORDERED
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 28.851 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→26.66 Å
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拘束条件 |
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