PDB-2w7y: Structure of a Streptococcus pneumoniae solute-binding protein in...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2w7y

タイトル

Structure of a Streptococcus pneumoniae solute-binding protein in complex with the blood group A-trisaccharide.

要素

PROBABLE SUGAR ABC TRANSPORTER, SUGAR-BINDING PROTEIN

キーワード

SUGAR BINDING PROTEIN / SUGAR-BINDING PROTEIN / SOLUTE-BINDING PROTEIN / STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE / BLOOD GROUP ANTIGEN / CARBOHYDRATE TRANSPORT

機能・相同性

Periplasmic binding protein-like II / D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta / IODIDE ION / :

機能・相同性情報

生物種

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE (肺炎レンサ球菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 2.35 Å

データ登録者

Higgins, M.A. / Abbott, D.W. / Boulanger, M.J. / Boraston, A.B.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2009
タイトル: Blood-Group Antigen Recognition by a Solute-Binding Protein from a Serotype 3 Strain of Streptococcus Pneumoniae.
著者: Higgins, M.A. / Abbott, D.W. / Boulanger, M.J. / Boraston, A.B.

履歴

登録	2009年1月6日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2009年3月10日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年5月8日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年10月16日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_ncs_dom_lim Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2w7y.cif.gz	168.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2w7y.ent.gz	133.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2w7y.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	2w7y_validation.pdf.gz	1.2 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2w7y_full_validation.pdf.gz	1.2 MB	表示
XML形式データ	2w7y_validation.xml.gz	36 KB	表示
CIF形式データ	2w7y_validation.cif.gz	50.8 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/2w7y ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w7/2w7y	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	5iai-d 2zym-d 5f7v-d 2gh9-d 6jba-d 2zyk-4 2zyk-3 1iud-d 1jvy-d 6z84-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: PROBABLE SUGAR ABC TRANSPORTER, SUGAR-BINDING PROTEIN

B: PROBABLE SUGAR ABC TRANSPORTER, SUGAR-BINDING PROTEIN

ヘテロ分子

95.7 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: PROBABLE SUGAR ABC TRANSPORTER, SUGAR-BINDING PROTEIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
47.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: PROBABLE SUGAR ABC TRANSPORTER, SUGAR-BINDING PROTEIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
47.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	36.990, 104.900, 97.700
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 89.95, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: GLU / Beg label comp-ID: GLU / End auth comp-ID: VAL / End label comp-ID: VAL / Refine code: 1 / Auth seq-ID: 38 - 383 / Label seq-ID: 38 - 385

Dom-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	A	A
2	B	B

#1: タンパク質

PROBABLE SUGAR ABC TRANSPORTER, SUGAR-BINDING PROTEIN / FCSSBP

分子量: 47169.984 Da / 分子数: 2 / 断片: SOLUTE-BINDING PROTEIN, RESIDUES 24-430 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE (肺炎レンサ球菌)
株: SP3-BS71 / プラスミド: PSBP / 発現宿主:

ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: A5LBQ6

#2: 多糖

alpha-L-fucopyranose-(1-2)-[2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose-(1-3)]beta-D-galactopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 529.490 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
LFucpa1-2[DGalpNAca1-3]DGalpb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/3,3,2/[a2112h-1b_1-5][a1221m-1a_1-5][a2112h-1a_1-5_2*NCC/3=O]/1-2-3/a2-b1_a3-c1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-Galp]{[(2+1)][a-L-Fucp]{}[(3+1)][a-D-GalpNAc]{}}	LINUCS	PDB-CARE

#3: 化合物

ChemComp-IOD / IODIDE ION

分子量: 126.904 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: I

#4: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 410 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

Has protein modification

Y

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.1 Å³/Da / 溶媒含有率: 40.94 % / 解説: NONE

-
データ収集

回折	平均測定温度: 113 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL9-2 / 波長: 0.97884
検出器	タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97884 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.35→30 Å / Num. obs: 31126 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 10.4 % / R_merge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 22.5
反射シェル	解像度: 2.35→2.48 Å / 冗長度: 10.4 % / R_merge(I) obs: 0.39 / Mean I/σ(I) obs: 5.5 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称: REFMAC / バージョン: 5.2.0019 / 分類: 精密化

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散
開始モデル: NONE

解像度: 2.35→97.59 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.92 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.879 / SU B: 17.293 / SU ML: 0.234 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.671 / ESU R Free: 0.294 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.26311	1569	5 %	RANDOM
R_work	0.21339	-	-	-
obs	0.21592	29535	99.94 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 23.495 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.03 Å²	0 Å²	-0.21 Å²
2-	-	1.71 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.74 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.35→97.59 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5966	0	74	410	6450

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.022	6152
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.212	1.964	8316
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	7.571	5	774
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.687	26.567	268
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	17.402	15	1074
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.744	15	8
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.088	0.2	938
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.003	0.02	4564
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.195	0.2	3150
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.296	0.2	4198
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.143	0.2	375
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.217	0.2	77
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.264	0.2	13
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.18	1.5	3870
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.178	2	6178
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.455	3	2482
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	0.576	4.5	2138
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / 数: 2983 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rms dev position: 0.03 Å

Dom-ID	Auth asym-ID	タイプ	Weight position
1	A	tight positional	0.05
2	B	tight positional	0.05
1	A	tight thermal	0.5
2	B	tight thermal	0.5

LS精密化シェル

解像度: 2.35→2.41 Å / Total num. of bins used: 20 /

	R_factor	反射数
R_free	0.33	103
R_work	0.257	2180

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.2695	-0.7665	-0.3824	5.7694	-2.11	1.5591	-0.263	-0.4386	0.1676	0.2987	0.2123	-0.328	-0.0862	0.1431	0.0507	-0.117	0.0181	-0.058	0.0828	-0.0628	-0.0417	25.4885	4.6013	63.8667
2	5.0822	-1.0571	-0.0234	2.4489	-0.2838	2.2767	-0.3608	-0.5971	-0.4455	0.2107	0.3567	0.2756	0.1537	-0.4159	0.0042	-0.0557	0.0533	0.042	0.0787	0.0665	-0.1227	12.2872	-5.1739	65.4454
3	0.5946	0.0803	0.4888	0.3289	-0.0188	2.3725	-0.0795	0.1212	0.0193	-0.1627	0.0372	0.0214	0.0851	0.0457	0.0423	-0.0687	-0.0164	0.0032	-0.0274	-0.0065	-0.0449	5.8366	1.3606	36.4362
4	6.8538	0.4631	-0.2704	5.2741	-0.2945	1.2846	-0.0994	0.645	0.3221	-0.2688	0.0859	-0.2126	0.1256	0.3515	0.0136	-0.0429	-0.0035	-0.0432	-0.0639	-0.0133	-0.0689	12.8935	-2.3753	33.5977
5	5.3145	-0.1002	0.9658	2.6632	-2.0491	11.0298	0.0078	0.0314	-0.4276	-0.0358	0.0656	0.5051	0.7912	-0.5711	-0.0735	0.0127	-0.0723	0.0447	-0.1346	-0.0263	0.0958	5.8245	-18.6529	43.7875
6	3.4495	-2.057	-2.3805	9.8199	2.394	8.3673	-0.0519	0.0238	-0.1462	-0.3637	0.2916	-0.8744	-0.2665	0.3884	-0.2397	-0.1741	0.0064	0.0266	0.077	-0.0645	-0.0607	17.5897	-4.1159	32.4801
7	1.4674	-0.3302	0.3671	1.4082	0.587	2.5729	-0.0648	-0.2382	0.1901	0.033	0.046	-0.0007	-0.2367	0.0712	0.0188	-0.1244	0.0048	0.0036	-0.056	-0.0128	-0.071	11.4511	6.7596	53.4685
8	2.4272	-1.1355	-0.6744	2.8286	0.8243	2.2429	-0.0781	0.0242	-0.0367	0.0413	0.0474	0.1963	-0.0511	-0.099	0.0307	-0.163	-0.0296	0.0257	-0.086	0.0028	-0.1099	7.7627	0.8744	45.8696
9	3.7354	-0.4647	0.5722	5.3106	-1.5926	2.0067	-0.0493	0.1977	0.0901	0.2193	0.025	-0.5544	-0.035	0.0983	0.0242	-0.0018	-0.0758	-0.0312	0.0424	-0.0129	-0.009	46.2663	-23.0784	82.1982
10	4.4407	-1.2483	1.7059	2.8998	-0.9357	3.8729	-0.2912	0.1838	0.3885	0.1204	0.1318	-0.0313	-0.2468	-0.6709	0.1594	-0.0144	-0.0429	-0.0479	0.0993	0.0191	-0.1306	31.7076	-17.2948	78.9121
11	0.714	0.2657	-0.8721	0.1304	-0.0493	3.4689	-0.1517	0.0433	-0.035	0.1377	-0.005	-0.0405	-0.1012	-0.0709	0.1567	0.014	0.0163	-0.0019	0.0083	0.0045	-0.0484	24.0689	-23.6907	106.0728
12	6.0876	0.8561	-0.7301	4.2524	0.7144	3.9193	-0.3377	-0.1331	0.1681	0.0681	0.1163	0.1274	-0.2286	0.0587	0.2214	-0.0292	-0.003	-0.041	-0.1023	-0.046	-0.0583	28.649	-18.3944	109.8873
13	2.6741	0.0786	1.901	6.5365	-1.6382	5.6076	-0.3124	0.0485	0.5178	-0.3405	0.1197	0.0789	-0.4406	0.0187	0.1926	0.0766	-0.0401	-0.0416	-0.0429	0.0013	0.0362	30.7737	-11.9816	105.9765
14	0.3204	0.3129	-0.5454	0.3424	-0.8633	3.8964	-0.2902	0.1201	-0.55	0.2238	0.2031	-0.1995	0.6126	0.143	0.087	0.1206	0.0163	-0.0008	-0.0757	0.0273	0.013	29.5347	-32.5034	105.6883
15	1.9732	-0.1095	-1.3216	1.3061	0.1052	3.0196	-0.2806	0.4916	-0.3817	-0.0798	0.047	0.0439	0.2385	-0.4618	0.2336	-0.0556	-0.1029	-0.0153	0.1671	-0.0399	-0.0485	27.4525	-29.8138	84.0695
16	3.8821	2.5794	1.4166	2.9894	1.709	2.1264	-0.4002	-0.0137	0.3825	-0.2901	0.1523	0.0925	-0.4279	-0.069	0.2479	0.066	0.0263	-0.0899	-0.0941	0.029	-0.0195	31.0029	-13.4185	102.5715

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	38 - 55
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	56 - 103
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	104 - 148
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	149 - 169
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	170 - 199
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	200 - 221
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	222 - 310
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	311 - 365
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	38 - 52
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	53 - 101
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	102 - 146
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	147 - 175
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	176 - 224
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	225 - 252
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	253 - 322
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	323 - 383

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)