- PDB-2v07: Structure of the Arabidopsis thaliana cytochrome c6A V52Q variant -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 2v07
タイトル
Structure of the Arabidopsis thaliana cytochrome c6A V52Q variant
要素
CYTOCHROME C6
キーワード
PHOTOSYNTHESIS / IRON / HEME / PLASTID / THYLAKOID / TRANSPORT / CHLOROPLAST / METAL-BINDING / TRANSIT PEPTIDE / ELECTRON TRANSFER / ELECTRON TRANSPORT
機能・相同性
機能・相同性情報
chloroplast thylakoid lumen / photosynthesis / electron transfer activity / iron ion binding / heme binding 類似検索 - 分子機能
ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, ILE 87 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, GLY 88 TO ALA ...ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, ILE 87 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, GLY 88 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, VAL 122 TO GLN
Has protein modification
Y
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1
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試料調製
結晶
マシュー密度: 2.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 53 % / 解説: NONE
結晶化
pH: 4.5 詳細: 1.26 M AMMONIUM SUPHATE 100 MM AMMONIUM ACETATE PH 4.5 200 MM SODIUM CHLORIDE
解像度: 1.6→39.68 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.947 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.932 / SU B: 3.443 / SU ML: 0.057 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / ESU R: 0.113 / ESU R Free: 0.093 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.236
848
5.05 %
RANDOM
Rwork
0.198
-
-
-
obs
0.2
16810
98.9 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK BULK SOLVENT