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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2u2a | ||||||||||||||||||||
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タイトル | STEM LOOP IIA FROM U2 SNRNA OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-R(P*![]() RNA / PRE-MRNA SPLICING / U2SNRNA / U-TURN / RNA-PROTEIN INTERACTIONS / RIBONUCLEIC ACID | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 生物種 | ![]() ![]() 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ![]() Stallings, S.C. / Moore, P.B. | ![]() ![]() タイトル: The structure of an essential splicing element: stem loop IIa from yeast U2 snRNA. 著者: Stallings, S.C. / Moore, P.B. #1: ![]() タイトル: Efficient Association of U2 Snrnps with Pre-Mrna Requires an Essential U2 RNA Structural Element 著者: Zavanelli, M.I. / Ares Junior, M. #2: ![]() タイトル: Lethal and Temperature-Sensitive Mutations and Their Suppressors Identify an Essential Structural Element in U2 Small Nuclear RNA 著者: Ares Junior, M. / Igel, A.H. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 20.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 13.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 291.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 291.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 1.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 1.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 6406.878 Da / 分子数: 1 / 断片: STEM LOOP IIA 変異: TWO TERMINAL BASE PAIRS WERE CHANGED FROM UAS IN STEM LOOP IIA TO GCS IN U2A TO ACCOMMODATE T7 TRANSCRIPTION 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 解説: MOLECULE TRANSCRIBED FROM A PARTIALLY SINGLE-STRANDED DNA TEMPLATE USING T7 RNA POLYMERASE 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | イオン強度: 75 mM / pH: 7.6 圧: 1 ATM SOLVENT SYSTEM : 10MM KH2PO4, 50 MM KCL, 15 MM NACL, 0.5 MM EDTA atm 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT WAS DONE USING TORSION ANGLE MOLECULAR DYNAMICS. DETAILS OF THE PROTOCOL CAN BE FOUND IN THE STRUCTURE CITATION ABOVE. | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATIONS 計算したコンフォーマーの数: 15 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |