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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2rl1 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase from Haemophilus influenzae in complex with UDP-N-acetylglucosamine | ||||||
![]() | UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / MurA / MurZ / UDP-N-acetylglucosamine / Cell cycle / Cell division / Cell shape / Cell wall biogenesis/degradation / Cytoplasm / Peptidoglycan synthesis | ||||||
機能・相同性 | ![]() UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase activity / UDP-N-acetylgalactosamine biosynthetic process / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / regulation of cell shape / cell cycle / cell division / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yoon, H.J. / Suh, S.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase from Haemophilus influenzae in complex with UDP-N-acetylglucosamine and fosfomycin 著者: Yoon, H.J. / Lee, S.J. / Mikami, B. / Park, H.J. / Yoo, J. / Suh, S.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 101.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 75.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 872.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 880 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 31.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 45236.812 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: MurZ / プラスミド: pET-21a(+) / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P45025, UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-UD1 / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.78 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.71 % |
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結晶化 | 温度: 296 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 1.8M ammonium sulfate, 5-10% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2007年6月23日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.73→30 Å / Num. obs: 52873 / % possible obs: 99.7 % / Rmerge(I) obs: 0.062 |
反射 シェル | 解像度: 1.73→1.79 Å / Rmerge(I) obs: 0.35 / % possible all: 98.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→30 Å / σ(F): 320
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溶媒の処理 | Bsol: 55.707 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 29.634 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→30 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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