+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2rig | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT RABBIT INTERFERON-GAMMA AT 2.7-ANGSTROMS RESOLUTION | |||||||||
要素 | INTERFERON-GAMMA | |||||||||
キーワード | CYTOKINE | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 type II interferon receptor binding / regulation of growth / positive regulation of autophagy / cytokine activity / defense response to virus / immune response / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Oryctolagus cuniculus (ウサギ) | |||||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.3 Å | |||||||||
データ登録者 | Samudzi, C.T. / Burton, L.E. / Rubin, J.R. | |||||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1991 タイトル: Crystal structure of recombinant rabbit interferon-gamma at 2.7-A resolution. 著者: Samudzi, C.T. / Burton, L.E. / Rubin, J.R. #1: ジャーナル: Biochem.Biophys.Res.Commun. / 年: 1991 タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Studies of Recombinant Rabbit Interferon-Gamma 著者: Samudzi, C.T. / Gribskov, C.L. / Burton, L.E. / Rubin, J.R. | |||||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2rig.cif.gz | 14.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb2rig.ent.gz | 6.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2rig.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2rig_validation.pdf.gz | 309.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 2rig_full_validation.pdf.gz | 309.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2rig_validation.xml.gz | 722 B | 表示 | |
CIF形式データ | 2rig_validation.cif.gz | 1.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ri/2rig ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ri/2rig | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16950.389 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / 参照: UniProt: P30123 |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.51 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.99 % | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 8 / 手法: batch method | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 3 Å / Num. obs: 3284 / % possible obs: 84 % / Observed criterion σ(I): 2 / Num. measured all: 21224 / Rmerge(I) obs: 0.058 |
---|
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | Rfactor obs: 0.212 / 最高解像度: 2.3 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.3 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|