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Yorodumi- PDB-2r87: Crystal structure of PurP from Pyrococcus furiosus complexed with ADP -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2r87 | ||||||
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Title | Crystal structure of PurP from Pyrococcus furiosus complexed with ADP | ||||||
Components | PurP protein PF1517 | ||||||
Keywords | UNKNOWN FUNCTION / ATP-grasp superfamily | ||||||
Function / homology | Function and homology information formate-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide ligase / ligase activity, forming carbon-nitrogen bonds / 'de novo' IMP biosynthetic process / magnesium ion binding / ATP binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Pyrococcus furiosus (archaea) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 2.3 Å | ||||||
Authors | Zhang, Y. / White, R.H. / Ealick, S.E. | ||||||
Citation | Journal: Biochemistry / Year: 2008 Title: Crystal structure and function of 5-formaminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide synthetase from Methanocaldococcus jannaschii. Authors: Zhang, Y. / White, R.H. / Ealick, S.E. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 2r87.cif.gz | 414.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb2r87.ent.gz | 338.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 2r87.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 2r87_validation.pdf.gz | 2.3 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 2r87_full_validation.pdf.gz | 2.3 MB | Display | |
Data in XML | 2r87_validation.xml.gz | 73.7 KB | Display | |
Data in CIF | 2r87_validation.cif.gz | 101.7 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r8/2r87 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r8/2r87 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 2r7kSC 2r7lC 2r7mC 2r7nC 2r84C 2r85C 2r86C C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Refine code: 5
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