登録情報 | データベース: PDB / ID: 2o7w |
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タイトル | Duplex DNA containing an abasic site with an opposite G (alpha anomer) in 5'-G_AC-3' (10 structure ensemble and averaged structure) |
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要素 | - 5'-D(*CP*CP*AP*AP*AP*GP*(ORP)P*AP*CP*CP*GP*GP*G)-3'
- 5'-D(*CP*CP*CP*GP*GP*TP*GP*CP*TP*TP*TP*GP*G)-3'
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キーワード | DNA / DNA damage / APE1 / abasic / AMBER / molecular dynamics |
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機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) 機能・相同性情報 |
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手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics matrix relaxation |
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Model type details | minimized average |
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データ登録者 | Chen, J. / Dupradeau, F.Y. / Case, D.A. / Turner, C.J. / Stubbe, J. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2008 タイトル: DNA oligonucleotides with A, T, G or C opposite an abasic site: structure and dynamics. 著者: Chen, J. / Dupradeau, F.Y. / Case, D.A. / Turner, C.J. / Stubbe, J. |
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履歴 | 登録 | 2006年12月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2007年11月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2022年3月16日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / pdbx_struct_assembly ...database_2 / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.3 | 2023年11月29日 | Group: Data collection / Database references カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_database_related Item: _pdbx_database_related.db_name |
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