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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ndb | ||||||
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タイトル | NMR structure of omega-agatoxin IVA in DPC micelles | ||||||
![]() | Omega-agatoxin-Aa4a | ||||||
![]() | TOXIN / NEUROTOXIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() host cell presynaptic membrane / calcium channel inhibitor activity / toxin activity / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model14 | ||||||
![]() | Ryu, J.H. / Kim, J.I. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure-activity relationships of omega-Agatoxin IVA in lipid membranes 著者: Ryu, J.H. / Jung, H.J. / Konishi, S. / Kim, H.H. / Park, Z.Y. / Kim, J.I. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 284.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 238.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 526.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 699.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 33 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 41.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5277.445 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 50 mM [U-100% 2H] DPC-1, d38-DPC / 溶媒系: d38-DPC |
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試料 | 濃度: 50 mM / 構成要素: DPC-1 / Isotopic labeling: [U-100% 2H] |
試料状態 | pH: 4.0 / 圧: ambient / 温度: 310 |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 14 |