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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2n5i | ||||||
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タイトル | PltL-pyrrolyl | ||||||
![]() | Peptidyl carrier protein PltL | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / peptidyl carrier protein / pyoluteorin / PltL / pyrrole | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
![]() | Jaremko, M.J. / Lee, D.J. / Burkart, M.D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure and Substrate Sequestration in the Pyoluteorin Type II Peptidyl Carrier Protein PltL. 著者: Jaremko, M.J. / Lee, D.J. / Opella, S.J. / Burkart, M.D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 668.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 571.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 527.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 899.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 90.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 79.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10312.802 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: Pf-5 / ATCC BAA-477 / 遺伝子: PFL_2786, pltL / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-4EM / ( |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 50 mM potassium phosphate, 5 mM TCEP, 0.1 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | pH: 7.4 / 圧: ambient / 温度: 298.15 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |