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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mfv | ||||||
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タイトル | Structure of lasso peptide xanthomonin ii | ||||||
![]() | Xanthomonin II | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION / LASSO PEPTIDE / SEVEN-RESIDUE LASSO RING | ||||||
機能・相同性 | Uncharacterized protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Hegemann, J.D. / Zimmermann, M. / Harms, K. / Xie, X. / Marahiel, M.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Xanthomonin I-III are Lasso Peptides Featuring Macrolactam Rings Consisting of Only Seven Amino Acids 著者: Hegemann, J.D. / Zimmermann, M. / Zhu, S. / Harms, H.S. / Xie, X. / Marahiel, M.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 53.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 41.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 373.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 413.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1289.413 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 29-42 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC 19865 / 遺伝子: XGAA2, XGA_4059 / プラスミド: PET41A / 発現宿主: ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 8.8 mM XANTHOMONIN II, DMSO / 溶媒系: DMSO |
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試料 | 濃度: 8.8 mM / 構成要素: XANTHOMONIN II-1 |
試料状態 | 圧: ambient / 温度: 305 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: Avance / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |