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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2m4i | ||||||
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タイトル | Solution structure of Bacillus subtilis MinC N-terminal domain | ||||||
要素 | Septum site-determining protein MinC | ||||||
キーワード | CELL CYCLE / MinC / Bacillus subtilis / FtsZ inhibitor | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of protein polymerization / regulation of cell septum assembly / division septum assembly / cell morphogenesis 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bacillus subtilis (枯草菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing, torsion angle dynamics, 精密化 | ||||||
Model details | minimized average structure, model1 | ||||||
Model type details | minimized average | ||||||
データ登録者 | Castellen, P. / Sforca, M.L. / Zeri, A.C.M. / Gueiros-Filho, F.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution structure of Bacillus subtilis MinC N-terminal domain 著者: Castellen, P. / Sforca, M.L. / Zeri, A.C.M. / Gueiros-Filho, F.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2m4i.cif.gz | 657.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2m4i.ent.gz | 550.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2m4i.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2m4i_validation.pdf.gz | 473.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2m4i_full_validation.pdf.gz | 998.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2m4i_validation.xml.gz | 135.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2m4i_validation.cif.gz | 102.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/m4/2m4i ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/m4/2m4i | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12028.641 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP RESIDUES 1-102 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus subtilis (枯草菌) / 株: 168 / 遺伝子: BSU28000, minC / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q01463 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.1 / pH: 7.4 / 圧: ambient atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DGSA-distance geometry simulated annealing, torsion angle dynamics, 精密化 ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 1257 / NOE intraresidue total count: 399 / NOE long range total count: 207 / NOE medium range total count: 235 / NOE sequential total count: 416 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / Maximum lower distance constraint violation: 0 Å / Maximum upper distance constraint violation: 0 Å / 代表コンフォーマー: 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR ensemble rms | Distance rms dev: 0.58 Å / Distance rms dev error: 0.13 Å |