内容: 50 mM TRIS-maleate, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.01 % sodium azide, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Solution-ID
50mM
TRIS-maleate-1
1
150mM
NaCl-2
1
2mM
DTT-3
1
0.01 %
sodium azide-4
1
10 %
D2O-5
1
試料状態
イオン強度: 150 / pH: 6 / 圧: ambient / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
700
1
Varian INOVA
Varian
INOVA
600
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
NMRView
Johnson, OneMoonScientific
peakpicking
NMRView
Johnson, OneMoonScientific
解析
NMRView
Johnson, OneMoonScientific
chemicalshiftassignment
NMRDraw
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
CYANA
2.2
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
PSVS
BhattacharyaandMontelione
データ解析
Rosetta
RASREC
O.F. LangeandD. Baker
精密化
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
精密化
精密化
手法: simulated annealing, torsion angle dynamics, matrix relaxation ソフトェア番号: 1 詳細: RASREC method has six stages that cycle between generating Rosetta fragments, producing low energy models, and biasing conformational search space towards low energy space
NMR constraints
NOE constraints total: 1395 / NOE intraresidue total count: 167 / NOE long range total count: 748 / NOE medium range total count: 150 / NOE sequential total count: 330
代表構造
選択基準: fewest violations
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20