THE C-TERMINAL 6 AMINO ACIDS (EFIVTD) ARE ADDED FOR PROTEIN STABILITY PURPOSES.
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
2D 1H-15N HSQC
1
2
1
2D 1H-13C HSQC aromatic
1
3
1
2D 1H-13C HSQC aliphatic
1
4
1
3D 1H-15N NOESY
1
5
1
3D 1H-13C NOESY
1
6
1
3D HN(CA)CB
1
7
1
3D HNCA
1
8
1
3DH(CCO)NH
1
9
1
3D (H)CCH-TOCSY
1
10
1
3DHN(COCA)CB
-
試料調製
詳細
内容: 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium sulphate, 1 mM EDTA, 2 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] Pitx2 Homeodomain, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
10mM
sodium phosphate-1
1
150mM
sodium sulphate-2
1
1mM
EDTA-3
1
2mM
Pitx2 Homeodomain-4
[U-98% 13C; U-98% 15N]
1
試料状態
イオン強度: 150 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 295 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
800
1
Varian INOVA
Varian
INOVA
600
2
Varian INOVA
Varian
INOVA
500
3
Varian INOVA
Varian
INOVA
400
4
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解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
NMRPipe
Delaglio, ZhengrongandBax
解析
Amber
11
Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... andKollm
精密化
精密化
手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 871 / NOE intraresidue total count: 253 / NOE long range total count: 126 / NOE medium range total count: 263 / NOE sequential total count: 229
代表構造
選択基準: minimized average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: Lowest energy / 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / Maximum lower distance constraint violation: 0 Å / Maximum upper distance constraint violation: 0.093 Å
NMR ensemble rms
Distance rms dev: 0 Å / Distance rms dev error: 0 Å