+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l5m | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution structure of GF-17 in complex with micelles | ||||||
![]() | GF-17 | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / Antimicrobial peptide / LL-37-derived | ||||||
生物種 | artificial gene (人工物) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Wang, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Decoding the Functional Roles of Cationic Side Chains of the Major Antimicrobial Region of Human Cathelicidin LL-37. 著者: Wang, G. / Epand, R.F. / Mishra, B. / Lushnikova, T. / Thomas, V.C. / Bayles, K.W. / Epand, R.M. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 108.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 85 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 343.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 446.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2105.575 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) artificial gene (人工物) |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 | 内容: 2 mM GF-17-1, 80 mM [U-99% 2H] SDS-2, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
試料 |
| ||||||||||||
試料状態 | イオン強度: 0.08 / pH: 5.4 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |