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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l4g | ||||||
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タイトル | Influenza Haemagglutinin fusion peptide mutant G13A | ||||||
要素 | Haemagglutinin | ||||||
キーワード | VIRAL PROTEIN / fusion peptide | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / membrane => GO:0016020 / host cell surface receptor binding / apical plasma membrane / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model 1 | ||||||
データ登録者 | Lai, A.L. / Tamm, L.K. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2010 タイトル: Shallow boomerang-shaped influenza hemagglutinin G13A mutant structure promotes leaky membrane fusion. 著者: Lai, A.L. / Tamm, L.K. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2l4g.cif.gz | 100.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2l4g.ent.gz | 68.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2l4g.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2l4g_validation.pdf.gz | 343.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2l4g_full_validation.pdf.gz | 445.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2l4g_validation.xml.gz | 6.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2l4g_validation.cif.gz | 11.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l4/2l4g ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l4/2l4g | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2802.276 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 346-365 / 変異: G13A / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) 株: X31 / プラスミド: pET31b+ / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9DHG0 |
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配列の詳細 | THIS PORTION OF THE SEQUENCE (-GCGKKKK) REPRESENTS A SEGMENT INTRODUCED TO INCREASE THE SOLUBILITY ...THIS PORTION OF THE SEQUENCE (-GCGKKKK) REPRESENTS |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 5 / 圧: ambient / 温度: 303 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |