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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kih | ||||||
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タイトル | S31N mutant of M2 proton channel | ||||||
要素 | Matrix protein 2 | ||||||
キーワード | TRANSPORT PROTEIN / S31N / M2 / proton channel / influenza / matrix protein 2 / Cell membrane / Disulfide bond / Hydrogen ion transport / Ion transport / Ionic channel / Membrane / Transmembrane / Transport / Virion | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 : / : / suppression by virus of host autophagy / protein complex oligomerization / proton transmembrane transporter activity / monoatomic ion channel activity / membrane => GO:0016020 / symbiont genome entry into host cell via pore formation in plasma membrane / host cell plasma membrane / virion membrane ...: / : / suppression by virus of host autophagy / protein complex oligomerization / proton transmembrane transporter activity / monoatomic ion channel activity / membrane => GO:0016020 / symbiont genome entry into host cell via pore formation in plasma membrane / host cell plasma membrane / virion membrane / identical protein binding / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Pielak, R.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2009 タイトル: Mechanism of drug inhibition and drug resistance of influenza A M2 channel. 著者: Pielak, R.M. / Schnell, J.R. / Chou, J.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2kih.cif.gz | 507.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2kih.ent.gz | 426.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2kih.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2kih_validation.pdf.gz | 376.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2kih_full_validation.pdf.gz | 618.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2kih_validation.xml.gz | 29.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2kih_validation.cif.gz | 42.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ki/2kih ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ki/2kih | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5035.910 Da / 分子数: 4 / 変異: S31N,C19S,C50S / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) 株: A/Udorn/307/1972 H3N2 / 遺伝子: M / プラスミド: trpLE / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63231, UniProt: P0DOF5*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 0.8 mM [U-100% 15N] potassium phosphate, sodium azide, glutamate, rimantadine, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] potassium phosphate, sodium azide, glutamate, rimantadine, 0.8 mM [U-100% 13C; U- ...内容: 0.8 mM [U-100% 15N] potassium phosphate, sodium azide, glutamate, rimantadine, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] potassium phosphate, sodium azide, glutamate, rimantadine, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-90% D2O] potassium phosphate, sodium azide, glutamate, rimantadine, 95% H2O/5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.1 / pH: 7.5 / 圧: ambient / 温度: 303.1 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |