0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TR8 protein, 10 mM sodium phosphate, 300 mM sodium chloride, 1 mM benzamidine, 10 mM DTT, 90% H2O/10% D2O
2
0.8 mM [U-5% 13C; U-100% 15N] TR8 protein, 10 mM sodium phosphate, 450 mM sodium chloride, 1 mM benzamidine, 10 mM DTT, 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.8mM
TR8protein
[U-100% 13C; U-100% 15N]
1
10mM
sodiumphosphate
1
300mM
sodiumchloride
1
1mM
benzamidine
1
10mM
DTT
1
0.8mM
TR8protein
[U-5% 13C; U-100% 15N]
2
10mM
sodiumphosphate
2
450mM
sodiumchloride
2
1mM
benzamidine
2
10mM
DTT
2
試料状態
Conditions-ID
イオン強度
pH
圧 (kPa)
温度 (K)
1
300
6.5
ambient
298K
2
450
6.5
ambient
298K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker AVANCE
Bruker
AVANCE
800
1
Varian INOVA
Varian
INOVA
600
2
Varian INOVA
Varian
INOVA
750
3
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
1.3
BrukerBiospin
collection
TopSpin
1.3
BrukerBiospin
解析
VNMR
6.1C
Varian
collection
VnmrJ
2.1B
Varian
collection
PROSA
6.0.2
Guntert
解析
XEASY
1.3.13
Bartelsetal.
データ解析
CARA
1.8.4
KellerandWuthrich
chemicalshiftassignment
CARA
1.8.4
KellerandWuthrich
データ解析
CARA
1.8.4
KellerandWuthrich
peakpicking
CSI
2
WishartandSykes
データ解析
TALOS
2003.027.13.05
Cornilescu, DelaglioandBax
データ解析
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
AutoStructure
2.2.1
Huang, Tejero, PowersandMontelione
構造決定
AutoAssign
1.15.1
Zimmerman, Moseley, KulikowskiandMontelione
chemicalshiftassignment
CNS
1.2
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
PSVS
BhattacharyaandMontelione
structurevalidation
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 1929 / NOE intraresidue total count: 611 / NOE long range total count: 578 / NOE medium range total count: 266 / NOE sequential total count: 474
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20