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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2jqy | ||||||
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タイトル | Outer Membrane Protein G | ||||||
![]() | Outer membrane protein G | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / OmpG | ||||||
機能・相同性 | ![]() carbohydrate transmembrane transport / oligosaccharide transporting porin activity / maltose transporting porin activity / porin activity / pore complex / monoatomic ion transport / cell outer membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | Solution NMR structure of OmpG, 10 lowest energy structures | ||||||
![]() | Liang, B. / Tamm, L.K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of outer membrane protein G by solution NMR spectroscopy. 著者: Liang, B. / Tamm, L.K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 860.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 721.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 349.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 459.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 54.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 69 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 32805.332 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR 詳細: Solution NMR structure of OmpG, 10 lowest energy structures | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 15-300 mM DPC, 25 mM Bis-Tris, 95% H2O/5% D2O / 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | |||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 50 / pH: 6.3 / 圧: ambient / 温度: 313 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software | 名称: CNS / 開発者: Brunger A. T. et.al. / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: lowest energy |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |